Job Description P0A8J8 Confidence 99.76% Date Thu Jan 5 11:08:00 GMT 2012 Rank 108 Aligned Residues 309 % Identity 15% Template c2w00B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:hsdr; PDBTitle: crystal structure of the hsdr subunit of the ecor124i2 restriction enzyme in complex with atp Resolution 2.6 Å

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		32	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.															.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	T	P	I	Q	A	L	A	L	P	L	T	L	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	D	V	A	G	Q	A	Q	T	G	T	G	K	T	M	A	F	L	T	S	T	F	H	Y	L	L	S	H	P	A	I	A	D	R	K	V	N	Q	P	R	A	L	I	M	A	P	T	R	E	L	A
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.															.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		X	R	P	Y	Q	I	A	A	T	E	R	I	L	W	K	I	K	S	S	F	T	A	K	N	W	S	K	P	E	S	G	G	Y	I	W	H	T	T	G	S	G	K	T	L	T	S	.	F	K	A	A	R	L	A	T	E	L	D	F	I	D	.	.	.	.	.	.	.	K	V	F	F	V	V	D	R	K	D	L	D
Template Known Secondary structure																							T	T			S	S	G	G	G	S							T	T	S	S						.								T	T		T	T			.	.	.	.	.	.	.								G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																.															.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.		.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.								.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.			.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.
Query SS confidence																																																													.	.
Query Sequence		V	Q	I	H	A	D	A	E	P	L	A	E	A	T	G	L	K	L	G	L	A	Y	G	G	D	G	Y	D	K	Q	L	K	V	L	E	S	G	V	D	I	L	I	G	T	T	G	R	L	I	D	Y	A	K	Q	N	H	I	N	L	.	.	G	A	I	Q	V	V	V	L	D	E	A	D	R	M	Y	D	L	G	F
Query Conservation																																																													.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.																																					.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	Q	T	X	K	E	Y	Q	R	F	S	P	D	S	V	N	G	S	.	.	.	.	.	E	N	T	A	G	L	K	R	N	L	D	K	D	D	N	K	I	I	V	T	T	I	Q	K	L	N	N	L	X	K	A	E	S	D	L	P	V	Y	N	Q	Q	V	V	F	I	F	D	E	C	H	R	S	Q	F	G	E	A
Template Known Secondary structure										T	T	S	T	T		S	S	S	S	.	.	.	.	.													S	S																						G	G	G	G	S								S			T	T
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.						.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
		176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	K	D	I	R	W	L	F	R	R	M	P	P	A	N	Q	R	L	N	M	L	F	S	A	T	L	S	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	R	E	L	A	F	E	Q	M	N	N	A	E	Y	I	E	V	E	P	E	Q	K	T	G	H	R	I	K	E	E
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	K	N	L	K	K	K	F	.	.	.	.	.	.	K	R	Y	Y	Q	F	G	F	T	G	T	P	I	F	P	E	N	A	L	G	S	E	T	T	A	S	V	F	G	R	E	L	H	S	Y	V	I	T	D	A	I	R	D	E	K	V	L	K	F	K	V	D	Y	N	D	V	R	P	Q	F	K	S	L	E	T	E
Template Known Secondary structure										.	.	.	.	.	.	S									S	S				S	T	T		T	T	S									S														T	S	S												T	T	T					T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		419	420	.	.	.	.	.	.							.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
		235	.	.	.	.																	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.								.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	F	Y	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	E	K	M	R	L	L	Q	T	L	I	E	E	E	W	P	D	.	.	.	.	.	.	.	R	A	I	I	F	A	N	T	K	H	R	C	E	E	I	W	G	H	L	A	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	D	E	K	K	L	S	A	A	E	N	Q	Q	A	F	L	H	P	X	R	I	Q	E	I	T	Q	Y	I	L	N	N	F	R	Q	K	T	H	R	T	F	P	G	S	K	G	F	N	A	X	L	A	V	S	S	V	D	A	A	K	A	Y	Y	A	T	F	K	R	L	Q	E	E	A	A	N	K	S	A	T	Y	K
Template Known Secondary structure										T		S	T	T	T	T	T																					T			S	S	S											S	S																						S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.
																																														280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	R	V	G	L	L	T	G	D	V	A	Q	K	K	R	L	R	I	L	D	E	F	T	R	G	D	L	D	I	L	V	A	T	D	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	L	R	I	A	T	I	F	S	F	A	A	I	G	E	I	S	D	E	T	F	D	T	S	A	X	D	S	S	A	K	E	F	L	D	A	A	I	R	E	Y	N	S	H	F	K	T	N	F	S	T	D	S	N	G	F	Q	N	Y	Y	R	D	L	A	Q	R	V	K	N	Q	D	I	D	L	L	I	V	V	G	X
Template Known Secondary structure																						S		G	G	G	S																				T					S	S																	T	T	S	S	S					S	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		573	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	A	R	G	L	H	I	P	A	V	T	H	V	F	N	Y	D	L	P	D	D	C	E	D	Y	V	H	R	I	G	R	T	G	R	A	G	A	S	G	H	S	I	S	L	A
Query Conservation
Alig confidence																.
Template Conservation																.
Template Sequence		F	L	T	G	F	D	A	P	T	L	N	T	L	F	.	V	D	K	N	L	R	Y	H	G	L	X	Q	A	F	S	R	T	N	R	I	Y	D	A	T	K	T	F	G	N	I
Template Known Secondary structure		T	S	S	S				T	T						.			S												G	G	G						T	T			S
Template Predicted Secondary structure																.
Template SS confidence
		659	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.		.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.

No model constructed - rank, confidence too low