Job Description P06996 Confidence 84.17% Date Thu Jan 5 10:59:51 GMT 2012 Rank 43 Aligned Residues 172 % Identity 22% Template c3kvnA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:esterase esta; PDBTitle: crystal structure of the full-length autotransporter esta from2 pseudomonas aeruginosa Resolution 2.50 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	N	N	G	R	D	A	L	R	Q	N	G	D	G	V	G	G	S	I	T	Y	D	Y	E	G	F	G	I	G	G	A	I	S	S	S	K	R	T	D	A	Q	N	T	A	A	Y	I	G	N	G	D	R	A	E	T	Y	T	G	G	L	K	Y	D	A	N	N	I	Y	L	A	A	Q	Y	T	Q	T	Y	N	A	T
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	Q	D	S	A	A	S	G	D	G	N	G	Y	N	L	T	L	G	G	S	Y	R	I	D	E	A	W	R	A	G	V	A	A	G	F	Y	R	Q	K	L	E	A	G	A	K	D	S	D	Y	R	M	N	S	Y	M	A	S	A	F	V	Q	Y	Q	E	N	R	W	W	A	D	A	A	L	T	G	G	Y	L	D	Y
Template Known Secondary structure			B	T	T	B																			S	S	S																	T	T	T	T																			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
		267	.														.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.							.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	L	G	W	A	N	K	A	Q	N	F	E	A	V	A	Q	Y	Q	F	D	F	G	.	.	.	.	.	.	L	R	P	S	L	A	Y	L	Q	S	K	G	K	N	L	G	R	G	Y	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	D	L	K	R	K	F	A	L	G	G	G	E	R	S	E	K	G	D	T	N	G	H	L	W	A	F	S	A	R	L	G	Y	D	I	A	Q	Q	A	D	S	P	W	H	L	S	P	F	V	S	A	D	Y	A	R	V	E	V	D	G	Y	S	E	K	G	A	S	A	T	A	L	D	Y	D	D	Q	K	R	S	S
Template Known Secondary structure											T	T																								S		S		T	T		S																				B		S	S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.
																																																								312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	D	I	L	K	Y	V	D	V	G	A	T	Y	Y	F	N	K	N	M	S	T	Y	V	D	Y
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	R	L	G	A	G	L	Q	G	K	Y	A	F	G	S	D	T	Q	L	F	A	E	Y	A	H	E	R	E	Y	E	D	D	T	Q	D	L	T	M	S	L	N	S	L	P	G	N	R	F	T	L	E	G	Y	T	P	Q	D	H	L	N	R	V	S	L	G	F	S	Q	K	L	A	P	E	L	S	L	R	G	G	Y
Template Known Secondary structure														S	S	S	S													S												T	T															S															T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		522	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	I	N	L	L	D	D	N	Q	F	T	R	D	A	G	I	N	T	D	N	I	V	A	L	G	L	V	Y	Q	F
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	W	R	K	G	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	Q	Q	S	V	S	L	A	L	S	L	D	F
Template Known Secondary structure							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		602	.	.	.	.	.	.										.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions