Job Description P0A9W3 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:11:33 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 475 % Identity 32% Template c3g5uB_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: B: PDB Molecule:multidrug resistance protein 1a; PDBTitle: structure of p-glycoprotein reveals a molecular basis for2 poly-specific drug binding Resolution 3.80 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.			.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70												.	.
Predicted Secondary structure														.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	T	M	H	R	V	G	K	V	V	P	P	.	.	K	R	H	I	L	K	N	I	S	L	S	F	F	P	G	A	K	I	G	V	L	G	L	N	G	A	G	K	S	T	L	L	R	I	M	A	G	I	D	K	D	I	E	G	E	A	R	P	Q	P	D	I	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G
Query Conservation														.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	E	F	K	N	I	H	F	S	Y	P	S	R	K	E	V	Q	I	L	K	G	L	N	L	K	V	K	S	G	Q	T	V	A	L	V	G	N	S	G	C	G	K	S	T	T	V	Q	L	M	Q	R	L	Y	D	P	L	D	G	M	V	S	I	D	G	Q	D	I	R	T	I	N	V	R	Y	L	R	E	I	I	G
Template Known Secondary structure												S	S	T	T	S			S										T	T									S	S	T	T								T	T	T	S	S			S							T	T			G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
		73	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	L	P	Q	E	P	Q	L	N	P	E	H	T	V	R	E	S	I	E	E	A	V	S	E	V	V	N	A	L	K	R	L	D	E	V	Y	A	L	Y	A	D	P	D	A	D	F	D	K	L	A	A	E	Q	G	R	L	E	E	I	I	Q	A	H	D	G	H	N	L	N	V	Q	L	E	R	A	A	D	A	L	R
Query Conservation
Alig confidence													.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	V	S	Q	E	P	V	L	F	A	T	.	T	I	A	E	N	I	R	Y	G	R	E	D	V	T	M	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	E	K	A	V	K	E	A	N
Template Known Secondary structure					S	S					S	S	.											S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T
Template Predicted Secondary structure													.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		468	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.		.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
		153	.	.		.	.	.												.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.			.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.
Query SS confidence					.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.
Query Sequence		L	P	D	.	W	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	A	N	L	S	G	G	E	R	R	R	V	A	L	C	R	L	L	L	E	K	P	D	M	L	L	L	D	E	P	T	N	H	L	D	A	E	S	V	A	W	L	E	R	F	L	H	D	F	.	.	E	G	T	V	V	A	I	T	H	D
Query Conservation					.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.
Alig confidence					.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	Y	D	F	I	M	K	L	P	H	Q	F	D	T	L	V	G	E	R	G	A	Q	L	S	G	G	Q	K	Q	R	I	A	I	A	R	A	L	V	R	N	P	K	I	L	L	L	D	E	A	T	S	A	L	D	T	E	S	E	A	V	V	Q	A	A	L	D	K	A	R	E	G	R	T	T	I	V	I	A	H	R
Template Known Secondary structure			T	T					S	T	T	G	G	G				S	S	S	S		S	S																			S						B	T	T		S	S																T	T	S	S							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	Y	F	L	D	N	V	A	G	W	I	L	E	L	D	R	G	E	G	I	P	W	E	G	N	Y	S	S	W	L	E	Q	K	D	Q	R	L	A	Q	E	A	S	Q	E	A	A	R	R	K	S	I	E	K	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.																.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.																.
Template Sequence		L	S	T	V	R	.	N	A	D	V	I	A	G	F	D	G	G	V	I	V	E	.	Q	G	N	H	D	E	L	M	R	E	K	G	I	Y	F	K	L	V	M	T	Q	T	L	D	E	D	V	P	P	A	S	F	W	R	I	L	K	L	N	S	T	E	W	P	Y	F	V	V	G	I	F	C	A	I	I	N	G	G
Template Known Secondary structure						T	.	T		S						S	S	S					.											T	S									T											T	T									T
Template Predicted Secondary structure							.																.
Template SS confidence
		585	.	.	.	.		590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.		.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	Q	P	A	F	S	V	I	F	S	K	V	V	G	V	F	T	N	G	G	P	P	E	T	Q	R	Q	N	S	N	L	F	S	L	L	F	L	I	L	G	I	I	S	F	I	T	F	F	L	Q	G	F	T	F	G	K	A	G	E	I	L	T	K	R	L	R	Y	M	V	F	K	S	M	L	R	Q	D	V	S	W
Template Known Secondary structure																			S	S		S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	D	P	K	N	T	T	G	A	L	T	T	R	L	A	N	D	A	A	Q	V	K	G	A	T	G	S	R	L	A	V	I	F	Q	N	I	A	N	L	G	T	G	I	I	I	S	L	I	Y	G	W	Q	L	T	L	L	L	L	A	I	V	P	I	I	A	I	A	G	V	V	E	M	K	M	L	S	G	Q	A
Template Known Secondary structure				S		S																																												S	S		S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	K	D	K	K	E	L	E	G	S	G	K	I	A	T	E	A	I	E	N	F	R	T	V	V	S	L	T	R	E	Q	K	F	E	T	M	Y	A	Q	S	L	Q	I	P	Y	R	N	A	M	K	K	A	H	V	F	G	I	T	F	S	F	T	Q	A	M	M	Y	F	S	Y	A	A	A	F	R	F	G	A	Y	L
Template Known Secondary structure																				T	T		T	T	T	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																							274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	W	V	R	Q	G	T	K	G	R	Q	S	K	G	K	A	R	L	A	R	F	E	E	L	N	S	T	E	Y	Q	K	R	N	E	T	N	E	L	F	I	P	P	G	P	R	L	G	D	K	V	L	E	V	S	N	L	R	K	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	T	Q	Q	L	M	T	F	E	N	V	L	L	V	F	S	A	I	V	F	G	A	M	A	V	G	Q	V	S	S	F	A	P	D	Y	A	K	A	T	V	S	A	S	H	I	I	R	I	I	E	K	T	P	E	I	D	S	Y	S	T	Q	G	L	K	P	N	M	L	E	G	N	V	Q	F	S	G	V	V	F	N
Template Known Secondary structure		T	T	T	T		S		S	T	T																			T	S	S	S	S		S															S						S	S		S						T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		333				.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.												.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	.	.	.	G	D	R	L	L	I	D	D	L	S	F	S	I	P	K	G	A	I	V	G	I	I	G	P	N	G	A	G	K	S	T	L	F	R	M	I	S	G	Q	E	Q	P	D	S	G	T	I	T	L	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	K	L	A	S	V	D	Q	F	R	D	S	M
Query Conservation			.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation																																																																															.	.
Template Sequence		Y	P	T	R	P	S	I	P	V	L	Q	G	L	S	L	E	V	K	K	G	Q	T	L	A	L	V	G	S	S	G	C	G	K	S	T	V	V	Q	L	L	E	R	F	Y	D	P	M	A	G	S	V	F	L	D	G	K	E	I	K	Q	L	N	V	Q	W	L	R	A	Q	L	G	I	V	S	Q	E	P	.	.	I
Template Known Secondary structure			S		G	G	G			S			S							S	S	S							S	S	S	T	T									T	T	S	S			S						S	S	S	S		B	T	S	S						T	T	S						S	S		.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.
Template SS confidence
		1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.			.
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.											.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	N	S	K	T	V	W	E	E	V	S	G	G	L	D	I	M	K	I	G	N	T	E	M	P	S	R	A	Y	V	G	R	F	N	F	K	G	V	D	Q	G	K	R	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	L	S	G	G	E	R	G	R	L	H	L	A	K	L	L	Q	V	G	G	N	M	L	L	L
Query Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.
Template Sequence		L	F	D	C	S	I	A	E	N	I	A	Y	G	D	N	S	R	V	V	S	Y	E	E	.	.	I	V	R	A	A	K	E	A	N	I	H	Q	F	I	D	S	L	P	D	K	Y	N	T	R	V	G	D	K	G	T	Q	L	S	G	G	Q	K	Q	R	I	A	I	A	R	A	L	V	R	Q	P	H	I	L	L	L
Template Known Secondary structure				S	S	B						T				S	S								.	.									T						S	S	T	T	T	G	G	G		B		S	T	T	S		S	S																			S	S
Template Predicted Secondary structure																									.	.
Template SS confidence
		1118	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140			.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.
		469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490			.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.
Query SS confidence																								.	.
Query Sequence		D	E	P	T	N	D	L	D	I	E	T	L	R	A	L	E	N	A	L	L	E	F	.	.	P	G	C	A	M	V	I	S	H	D	R	W	F	L	D	R	I	A	T	H	I	L	D	Y	Q	D	E	G	K	V	E	F	F	E	G	N	F	T	E	Y	E	E
Query Conservation																								.	.
Alig confidence																								.	.																.											.							.
Template Conservation																																									.											.							.
Template Sequence		D	E	A	T	S	A	L	D	T	E	S	E	K	V	V	Q	E	A	L	D	K	A	R	E	G	R	T	C	I	V	I	A	H	R	L	S	T	I	Q	.	N	A	D	L	I	V	V	I	Q	N	.	G	K	V	K	E	H	.	G	T	H	Q	Q	L	L	A
Template Known Secondary structure			S		S	S	S																	S	S	S	S							S		T	T	G	G	G	.	S		S							T	.	B						.
Template Predicted Secondary structure																																									.											.							.
Template SS confidence
		1196	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.		.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.		.	.	.	.	.	1250		.	.	.	.	.	.	.	.