Job Description P0A9W3 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:11:33 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 516 % Identity 24% Template c2r6fA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:excinuclease abc subunit a; PDBTitle: crystal structure of bacillus stearothermophilus uvra Resolution 3.20 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	T	M	H	R	V	G	K	V	V	P	P	K	R	H	I	L	K	N	I	S	L	S	F	F	P	G	A	K	I	G	V	L	G	L	N	G	A	G	K	S	T	L	L	R	I	M	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	D	K	D	I	E	G	E	A	R
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	I	V	K	G	A	.	.	.	.	.	.	R	A	H	N	L	K	N	I	D	V	E	I	P	R	G	K	L	V	V	L	T	G	L	S	G	S	G	K	S	S	L	A	F	D	T	I	Y	A	E	G	Q	R	R	Y	V	E	S	L	S	A	Y	A	R	Q	F	L	G	Q	X	E	K	P	D	V	D	A	I	E
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	.	.		S	S	S			S							T	T	S							S	T	T	S	S						T	T	T											T	T	S										T	S				S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.							10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
		65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	Q	P	D	I	K	I	G	Y	L	P	Q	E	P	Q	L	N	P	E	H	T	V	R	E	S	I	E	E	A	V	S	E	V	V	N	A	L	K	R	L	D	E	V	Y	A	L	Y	A	D	P	D	A	D	F	D	K	L	A	A	E	Q	G	R	L	E	E	I	I	Q	A	H	D	G	H	N	L	N	V	Q	L
Query Conservation
Alig confidence						.																		.	.	.	.	.																																																				.	.
Template Conservation						.																		.	.	.	.	.																																																				.	.
Template Sequence		G	L	S	P	.	A	I	S	I	D	Q	K	T	T	S	R	N	P	R	S	T	V	.	.	.	.	.	G	T	V	T	E	I	Y	D	Y	L	R	L	L	F	A	R	I	G	R	P	I	C	P	T	H	G	I	E	I	Q	S	Q	T	I	E	Q	X	V	D	R	L	L	S	Y	P	E	R	T	K	X	Q	.	.
Template Known Secondary structure		S				.					S	S	T	T	S				T	T		B		.	.	.	.	.				T	S												T				B		T	T	T			B															T	S		T	T					.	.
Template Predicted Secondary structure						.																		.	.	.	.	.																																																				.	.
Template SS confidence
		78	.	80	.		.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.						.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.		.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.				.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure													.																																																						.	.	.
Query SS confidence													.																																																						.	.	.
Query Sequence		E	R	A	A	D	A	L	R	L	P	D	.	W	D	A	K	I	A	N	L	S	G	G	E	R	R	R	V	A	L	C	R	L	L	L	E	K	P	D	M	L	L	L	D	E	P	T	N	H	L	D	A	E	S	V	A	W	L	E	R	F	L	H	D	F	.	.	.	E	G	T	V	V	A	I	T	H	D	R	Y
Query Conservation													.																																																						.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.								.																																																						.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	I	L	A	P	I	D	V	V	V	D	R	I	I	I	K	D	G	I	A	A	R	L	A	D	S	L	E	T	A	L	K	L	A	D	G	K	V	V	V	D	V	I	G	E	G	E	L	L	F	S	E	K	H	A	C	P	Y	C	G	F	S	I	G	E	L	E	P	R	L	F	S	F	N	S	P	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.																S	T	T															T	T	S							T	T	T							S	S				T	T	T									G	G	G	G		S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Template SS confidence
						150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.										.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	L	D	N	V	A	G	W	I	L	E	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	E	G	I	P	W	E	G	N	Y	S	S	W	L	E	Q	K	D	Q	R	L	A	Q	E	A	S	Q	E	A	A	R	R	K	S	I	E	K	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	A	C	P	D	C	D	G	L	G	A	K	L	E	V	D	L	D	L	V	I	P	N	D	E	L	T	L	K	E	H	A	I	A	P	W	E	P	Y	Y	P	Q	L	L	E	A	V	C	R	H	Y	G	I	P	X	D	V	P	V	K	D	L	P	K	E	Q	L	D	K	I	L	Y	G	S	G	G	E	P	I	Y
Template Known Secondary structure		T	B		T	T	T	T	S														S	S	S			B	G	G	G		S	S	S	S	S																			S	S		B	G	G	G	S													T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	R	Y	T	N	D	F	G	Q	V	R	E	Q	Y	I	A	F	E	G	V	I	P	N	V	E	R	R	Y	R	E	T	S	S	D	Y	I	R	E	Q	X	E	K	Y	X	A	E	Q	P	C	P	T	C	Q	G	Y	R	L	K	K	E	S	L	A	V	L	V	G	G	K	H	I	G	E	V	T	A	X	S	V	T
Template Known Secondary structure		B			B		S	S	S		B			B																					T	T						G	G	G							T	T	T	T	T	S		B		T	T	T	T	T			S	S	S		B						T	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	A	L	A	F	F	D	G	L	E	L	T	E	K	E	A	Q	I	A	R	L	I	L	R	E	I	R	D	R	L	G	F	L	Q	N	V	G	L	D	Y	L	T	L	S	R	S	A	G	T	L	S	G	G	E	A	Q	R	I	R	L	A	T	Q	I	G	S	R	L	T	G	V	L	Y	V	L	D	E	P	S	I
Template Known Secondary structure																				S																		T		T	T	S	B	S	S	S	B	G	G	G																T	T				S								T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	L	H	Q	R	D	N	D	R	L	I	A	T	L	K	S	X	R	D	L	G	N	T	L	I	V	V	E	H	D	E	D	T	X	L	A	A	D	Y	L	I	D	I	G	P	G	A	G	I	H	G	G	E	V	V	A	A	G	T	P	E	E	V	X	N	D	P	N	S	L	T	G	Q	Y	L	S	G	K	K	F
Template Known Secondary structure		T			G	G	G													T	T	T															S		S							S	S	S	G	G	G			S							T	T	T	T	T	T		T	T		T	T						T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		516	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
																																																				274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	W	V	R	Q	G	T	K	G	R	Q	S	K	G	K	A	R	L	A	R	F	E	E	L	N	S	T	E	Y	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	P	I	P	A	E	R	R	R	P	D	G	R	W	L	E	V	V	G	A	R	E	H	N	L	K	N	V	S	V	K	I	P	L	G	T	F	V	A	V	T	G	V	S	G	S	G	K	S	T	L	V	N	E	V	L	Y	K	A	L	A	Q	K	L	H	R	A	K	A	K	P	G	E	H	R	D	I	R	G	L
Template Known Secondary structure						S	S						S										S	S	S			S							S	S	S						B		T	T	S	S						T	T	T																		S		S					G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		596	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		K	R	N	E	T	N	E	L	F	I	P	P	G	P	R	L	G	D	K	V	L	E	V	S	N	L	R	K	S	Y	G	D	R	L	L	I	D	D	L	S	F	S	I	P	K	G	A	I	V	G	I	I	G	P	N	G	A	G	K	S	T	L	F	R	M	I	S	G	Q	E	Q	P	D	S	G	T	I	T	L	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																																																																																	.
Template Conservation
Template Sequence		E	H	L	D	K	V	I	D	I	D	Q	S	P	I	G	R	T	P	R	S	N	P	A	T	Y	T	G	V	F	D	D	I	R	D	V	F	A	S	T	N	E	A	K	V	R	G	Y	K	K	G	R	F	S	F	N	V	K	G	G	R	C	E	A	C	H	G	D	G	I	I	K	I	E	X	H	F	L	P	D	V
Template Known Secondary structure		G	G		S							S	S		S		S	S	T	T								T											T	S						T	T			T	T	T	T		T	T	S	T	T	T	B		T	T	T	T	T		S							S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		676	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.
						383	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.					.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																											.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																											.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	G	E	T	V	K	L	A	S	V	D	Q	F	R	D	S	M	D	N	S	K	T	V	W	E	E	V	.	.	.	.	S	G	G	L	D	I	M	K	I	G	N	T	E	M	P	S	R	A	Y	V	G	R	F	N	F	K	G	V	D	Q	G	K	R	V	G	E	L	S	G	G	E	R	G	R	L	H
Query Conservation		.	.	.	.																											.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																											.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	V	P	C	E	V	C	H	G	K	R	Y	N	R	E	T	L	E	V	T	Y	K	G	K	N	I	A	E	V	L	D	X	T	V	E	D	A	L	D	F	F	A	S	I	P	K	I	K	R	K	L	E	T	L	Y	D	V	G	L	G	Y	X	K	L	G	Q	P	A	T	T	L	S	G	G	E	A	Q	R	V	K
Template Known Secondary structure						T	T	T	T	T			B		T	T	G	G	G			B	T	T	B							T	S	B								T		S														T	T		S	S	S	B	T	T			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		756	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.
		455	.	.	.	.	460	.	.				.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490				.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.							.	.	.	.	.	520	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.																													.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.																													.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	A	K	L	L	Q	V	G	.	.	.	G	N	M	L	L	L	D	E	P	T	N	D	L	D	I	E	T	L	R	A	L	E	N	A	L	L	E	F	.	.	.	P	G	C	A	M	V	I	S	H	D	R	W	F	L	D	R	I	A	T	H	I	L	D	Y	.	.	.	.	.	.	Q	D	E	G	K	V	E	F
Query Conservation										.	.	.																													.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.																													.	.	.																	.								.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																												.
Template Sequence		L	A	A	E	L	H	R	R	S	N	G	R	T	L	Y	I	L	D	E	P	T	T	G	L	H	V	D	D	I	A	R	L	L	D	V	L	H	R	L	V	D	N	G	D	T	V	L	V	I	E	H	N	L	D	V	I	K	T	.	A	D	Y	I	I	D	L	G	P	E	G	G	D	R	G	G	Q	I	V	A	V
Template Known Secondary structure							S	S				S									T	T	T	T																			T	T														T	T	.		S							S	S	S	T	T	S			S
Template Predicted Secondary structure																																																												.
Template SS confidence
		836	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.		.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.
		523	.	.	.	.	.	.	530	.									.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	E	G	N	F	T	E	Y	E	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Y	K	K	R	T	L	G	A	D	A
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	G	T	P	E	E	V	A	E	V	K	E	S	H	T	G	R	Y	L	K	P	I	L	E	R	D	R
Template Known Secondary structure		.	.		S						T		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				915	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940