Job Description P0A8F8 Confidence 99.96% Date Thu Jan 5 11:07:44 GMT 2012 Rank 31 Aligned Residues 319 % Identity 18% Template c3ewsA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:atp-dependent rna helicase ddx19b; PDBTitle: human dead-box rna-helicase ddx19 in complex with adp Resolution 2.70 Å

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		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.							.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	S	A	F	K	P	S	G	D	Q	P	E	A	I	R	R	L	E	E	G	L	E	D	G	L	A	H	Q	T	L	L	G	V	T	G	S	G	K	T	F	T	I	A	N	V	I	A	D	L	.	.	.	.	.	.	Q	R	P	T	M	V	L	A	P	N	K	T	L	A	A	Q	L	Y	G	E	M	K	E	F	F
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.																														.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.
Template Sequence		M	G	F	N	R	P	S	K	I	Q	E	N	A	L	P	L	M	.	.	.	L	A	E	P	P	Q	N	L	I	A	Q	S	Q	S	G	T	G	K	T	A	A	F	V	L	A	M	L	S	Q	V	E	P	A	N	K	Y	P	Q	C	L	C	L	S	P	T	Y	E	L	A	L	Q	T	G	K	V	I	E	Q	M	G
Template Known Secondary structure		T	T			S			T	T									.	.	.	S		S	S										T	T	S	S															T	T	S		S								S	S															T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.
Template SS confidence
		110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.				.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.		.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure																																																																										.
Query SS confidence																																																																										.
Query Sequence		P	E	N	A	V	E	Y	F	V	S	Y	Y	D	Y	Y	Q	P	E	A	Y	V	P	S	S	D	T	F	I	E	K	D	A	S	V	N	E	H	I	E	Q	M	R	L	S	A	T	K	A	M	L	E	R	R	D	V	V	V	V	A	S	V	S	A	I	Y	G	L	G	D	P	D	L	.	Y	L	K	M	M	L	H
Query Conservation																																																																										.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	F	Y	P	E	L	K	L	A	Y	A	V	R	G	N	K	L	E	R	G	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	S	E	Q	I	V	I	G	T	P	G	T	V	L	D	W	C	S	K	L	K	F	I	D	P	K	K	I	K
Template Known Secondary structure		T	T		T	T							S	T	T					S		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S														T	T	T			S		G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	T	V	G	M	I	I	D	Q	R	A	I	L	R	R	L	A	E	L	Q	Y	A	R	N	D	Q	A	F	Q	R	G	T	F	R	V	R	G	E	V	I	D	I	F	P	A	E	S	D	D	I	A	L	R	V	E	L	F	D	E	E	V	E	R	L	S	L	F	D	P	L	T	G	Q	I	V	S	T	I	P	R
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.																																																																	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.																																																																	.	.
Template Sequence		V	F	V	L	D	E	A	D	.	.	.	.	.	.	V	M	I	A	T	Q	G	H	Q	D	Q	S	I	R	I	Q	R	M	L	P	R	N	C	Q	M	L	L	F	S	A	T	F	E	D	S	V	W	K	F	A	Q	K	V	V	P	D	P	N	V	I	K	L	K	R	E	E	E	T	L	D	T	I	K	Q	.	.
Template Known Secondary structure										.	.	.	.	.	.			T	T	S												T	T	S		T	T	S							S														S	S	S													G	G	G				.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.																																																																	.	.
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.							.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	T	I	Y	P	K	T	H	Y	V	T	P	R	E	R	I	V	Q	A	M	E	E	I	K	E	E	L	A	A	R	R	K	V	L	L	E	N	N	K	L	L	E	E	Q	R	L	T	Q	R	T	Q	F	D	L	E	M	M	N	E	L	G	Y	C	S	G	I	E	N	Y	S	R	F	L	S	G	R	G	P	G	E
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	P	P	T	L	F	D	Y	L	P	A	D	G	L	L	V	V	D	E	S	H	V	T	I	P	Q	I	G	G	M	Y	R	G	D	R	A	R	K	E	T	L	V	E	Y	G	F	R	L	P	S	A	L	D	N	R	P	L	K	F	E	E	F	E	A	L	A	P	Q	T	I	Y	V	S	A	T	P	G	N	Y	E
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	E	K	S	G	G	D	V	V	D	Q	V	V	R	P	T	G	L	L	D	P	I	I	E	V	R	P	V	A	T	Q	V	D	D	L	L	S	E	I	R	Q	R	A	A	I	N	E	R	V	L	V	T	T	L	T	K	R	M	A	E	D	L	T	E	Y	L	E	E	H	G	E	R	V	R	Y	L	H	S	D	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Y	V	L	C	S	S	R	D	E	K	F	Q	A	L	C	N	L	Y	G	A	I	T	I	A	Q	A	M	I	F	C	H	T	R	K	T	A	S	W	L	A	A	E	L	S	K	E	G	H	Q	V	A	L	L	S	G	E	M
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	S															S				S						S	S														T	T								T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																								310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
		481	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.							.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	T	V	E	R	M	E	I	I	R	D	L	R	L	G	E	F	D	V	L	V	G	I	N	L	L	R	E	G	L	D	M	P	E	V	S	L	V	A	I	L	D	A	D	K	E	G	F	L	R	S	.	.	.	.	.	.	E	R	S	L	I	Q	T	I	G	R	A	A	R	N	V	N	G	K	A	I	L	Y	G
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																															.	.	.	.	.		.	.	.	.	.	.														.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.																					.	.	.
Template Sequence		M	V	E	Q	R	A	A	V	I	E	R	F	R	E	G	K	E	K	V	L	V	T	T	N	V	C	A	R	G	I	D	V	E	Q	V	S	V	V	I	N	F	D	L	P	V	.	.	.	.	.	D	K	D	G	N	P	D	N	E	T	Y	L	H	R	I	G	R	G	K	R	.	.	.	G	L	A	V	N	M	V
Template Known Secondary structure															T	T	S		S										T	T					S							S	S			B	.	.	.	.	.		S	S	S	S	B										T					.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.																					.	.	.
Template SS confidence
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.						.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.				.	.	.	.	.	.	.
		555	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		D	S
Template Known Secondary structure			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		444	.