Job Description P07762 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 92 Aligned Residues 325 % Identity 12% Template d1r7aa2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.77

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		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	D	N	N	F	W	L	S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W
Query Conservation
Alig confidence																		.																																																		.	.	.	.	.
Template Conservation																		.																																																		.	.	.	.	.
Template Sequence		A	D	R	L	G	D	G	T	I	K	S	M	T	D	I	L	.	R	T	R	F	D	G	V	Y	D	G	V	H	I	L	P	F	F	T	P	F	D	G	A	D	A	G	F	D	P	I	D	H	T	K	V	D	E	R	L	G	S	W	D	D	V	A	E	L	S	.	.	.	.	.	K	T	H	N	I	M	V	D	A
Template Known Secondary structure		S	S	S	B	S	S	S	S									.				S	T	T	T													S	S	S	S	S	T	T	S	S		S							T	T	T											.	.	.	.	.	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																		.																																																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.		.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.						.	.	.	.	80	.	.	.	.
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.					.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	370	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	.	.	.	.	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	W	N	T	L	I	Y	N
Query Conservation																	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	V	N	H	M	S	W	E	S	K	Q	F	Q	D	V	L	A	K	G	E	E	S	E	Y	Y	P	M	F	L	T	M	S	S	V	F	P	N	G	A	T	E	E	D	L	A	G	I	Y	R	P	R	P	G	L	P	F	T	H	Y	K	F	A	G	K	T	R	L	V	W	V	S	F	T	P	Q	Q	V	D	I	D
Template Known Secondary structure				S				T	T	S										G	G	G	S	T	T	G	G	G	B		B						T	T									T	S			S	S	S	S		S							T	T								S	S	S	T	T				B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M
Query Conservation
Alig confidence																				.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template Conservation																				.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template Sequence		T	D	S	D	K	G	W	E	Y	L	M	S	I	F	D	Q	M	A	.	A	S	H	V	S	Y	I	R	L	D	A	V	G	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	E	A	G	T	S	C	F	M	T	P	K	T	F	K	L	I	S	R	L	R	E	E	G	V	K	.	.	R	G	L	E	I	L
Template Known Secondary structure		T	T	S																.		T	T								T	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	S		S	S	S																		.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																				.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.		.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.												.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.			.	.	.	.	.	230
		457	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L
Query Conservation
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	E	V	H	S	Y	Y	K	K	Q	V	E	I	A	S	K	V	D	R	V	Y	D	F	A	L	P	P	L	L	L	H	A	L	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	V	E	P	V	A	H	W	T	D	I	R	P	N	N	A	V	T	V	L	D	T	H	D	G	I	G	V	I	D	I	G	S	D
Template Known Secondary structure						S										T	T	S	S						S												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													S		S	S					S			S	S		B		S	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.											.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
		537	.	.	540	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	R	M	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	L	D	R	S	L	K	G	L	V	P	D	E	D	V	D	N	L	V	N	T	I	H	A	N	T	H	G	E	S	Q	A	A	T	G	A	A	A	S	N	L	D	L	Y	Q	V	N	S	T	Y	Y	S	A	L	G	N	D	Q	H	Y	I	A	A	R	A	V	Q	F	F	L	P	G	V	P	Q	V	Y	Y	V	G
Template Known Secondary structure		S	S		T	T	S			S	S																T	T	T						S	G	G	G	S	B		S		S	S	S	B		S						T																S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
		571	.	.	.	.	.	.												.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	F	A	Q	G	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	N	H	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Template Conservation																																			.	.
Template Sequence		A	L	A	G	K	N	D	M	E	L	L	R	K	T	N	N	G	R	D	I	N	R	H	Y	Y	S	T	A	E	I	D	E	N	.	.	L	K	R	P	V	V	K	A	L	N	A	L	A	K	F	R	N	E	L
Template Known Secondary structure			T	T													B	G	G	G	G	G				B									.	.	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.			.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.