Job Description P07762 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 69 Aligned Residues 352 % Identity 20% Template d1h3ga3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.1

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		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Query Sequence		R	K	K	A	N	Q	F	D	A	P	I	S	I	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	R	H	T	D	N	N	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	.
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Alig confidence																								.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																				.
Template Conservation																								.																																					.
Template Sequence		S	A	Q	R	Q	G	F	G	P	G	D	A	I	Y	Q	I	X	P	D	R	F	A	.	N	G	D	P	S	N	D	N	V	A	G	X	R	E	Q	A	D	R	R	H	G	G	G	R	H	G	G	D	I	R	G	T	I	D	H	L	.	D	Y	I	A	G	L	G	F	T	Q	L	W	P	T	P	L	V	E	N	D
Template Known Secondary structure			T	T						T	T													.		S		G	G	G	S	S		T	T		S	S				T	T	S	T	T	S												T		.							T
Template Predicted Secondary structure																								.																																					.
Template SS confidence
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.		.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.		.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
			293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																																																																														.	.
Query SS confidence		.																																																																														.	.
Query Sequence		.	P	F	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	.	.
Query Conservation		.																																																																														.	.
Alig confidence		.																																																																														.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	A	Y	S	Y	H	G	Y	A	A	T	D	H	Y	R	I	D	P	R	Y	G	S	N	E	D	F	V	R	L	S	T	E	A	R	K	R	G	X	G	L	I	Q	D	V	V	L	S	H	I	G	K	H	H	W	W	X	K	D	L	P	T	P	D	W	I	N	Y	G	G	K	F	V	P	T	Q	H	H	R	V
Template Known Secondary structure			S	S		G	G	G			S		S							T	T	T																T	T										S	B			T	T	S	G	G	G	G	S		S	S	T	T	S	B	S			S	S			B					G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
																							370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I	P	N	E	F	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	V	Q	D	P	Y	A	A	Q	A	D	S	E	N	F	T	K	G	W	F	V	E	G	X	P	D	L	N	Q	T	N	P	L	V	A	N	Y	L	I	Q	N	N	I	W	W	I	E	Y	A	G	L	S	G	L	R	I	D	T	Y	G	Y	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	S		T	T												S	B	S	S	T	T	S		B	B		T	T	S																			T		S					T	T	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.								.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	.	.	.	.	.	.	.	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R	Q
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	D	G	A	F	L	T	E	Y	T	R	R	L	X	A	E	Y	P	R	L	N	X	V	G	E	E	W	S	T	R	V	P	V	V	A	R	W	Q	R	G	K	A	N	F	D	G	Y	T	S	H	L	P	S	L	X	D	F	P	L	V	D	A	X	R	N	A	L	S	K	T	G	E	E	N	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.																	T	T										S							T	T	S	T	T				T	T										B															T	T		S	S	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
		502	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.				.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.
Query SS confidence																.	.	.
Query Sequence		Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	.	.	.	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W
Query Conservation																.	.	.
Alig confidence																.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	N	E	V	Y	E	T	L	S	L	D	Y	L	Y	P	E	P	Q	N	L	V	L	F	G	G	N	H	D	X	A	R	X	F	S	A	A	G	E	D	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	W	R	X	N	L	V	F	L	X	T	X	P	R	I	P	Q	F	Y	S	G	D	E	I	L	X	T	S	T	V
Template Known Secondary structure		T									G	G	G	G	S	S	S	G	G	G	S				S			T	T	S							T	T	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.													S	S	S						T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430										.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
		579									580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.								.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	.	.	.	.	.	.	.	.	H	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	.	.	.	.	.	.	.	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	G	R	D	D	A	S	Y	R	R	D	F	P	G	G	W	A	G	D	K	A	N	A	F	S	G	A	G	L	T	S	Q	Q	R	A	A	Q	D	L	V	R	K	L	A	N	W	R	K	N	Q	P	V	I	H	N	G
Template Known Secondary structure		S	S	S		G	G	G	G	S				T	T	S	S	T	T		S	S		T	T	T		T	T																				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.