Job Description P07762 Confidence 99.12% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 114 Aligned Residues 464 % Identity 17% Template c3mi6A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of the alpha-galactosidase from lactobacillus2 brevis, northeast structural genomics consortium target lbr11. Resolution 2.70 Å

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		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.									.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	F	N	Y	W	D	G	R	R	H	P	M	R	L	R	K	E	S	G	I	W	E	L	F	I	P	G	A	H	N	G	Q	L	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	K	Y	E	M	I	D	A	N	G	N	L	R	L	K	S	D	P	Y	A	F	E	A	Q	M	R	P	E	T	A	S	L	I	C	G	L	P	E	K
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.
Template Sequence		Q	T	T	D	E	Q	G	A	V	F	G	F	N	L	V	Y	S	.	G	N	F	L	D	A	I	E	V	D	Q	Y	S	T	S	R	I	L	T	G	I	N	P	D	E	F	G	W	N	L	A	P	Q	A	T	F	Q	T	P	E	A	I	L	S	Y	T	S	A	G	X	N	Q	L	S	Q	Q	X	A	S	F	Y	Q
Template Known Secondary structure		T			S	S	S	B								S			.	S	S									T	T	S										S	T	T							T	T														S	B
Template Predicted Secondary structure																			.
Template SS confidence
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.		.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.			.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.
Query SS confidence																																																																			.	.
Query Sequence		V	V	Q	T	E	E	R	K	K	A	N	Q	F	D	A	P	I	S	I	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	R	H	T	D	N	N	F	W	L	S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	.	.	H	P	F	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G
Query Conservation																																																																			.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.								.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.
Template Sequence		Q	H	L	V	N	P	R	F	A	H	E	E	R	P	V	L	I	N	N	W	E	A	T	Y	F	D	F	N	E	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	X	T	I	V	N	Q	A	K	R	L	G	I	.	.	.	E	X	F	V	L	D	D	G	W	F	G	H	R	D	D	D	T	T	S	L	G	D
Template Known Secondary structure				T	S		T	T	T	T	T	S													T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T		.	.	.							T	T		B	T	T		S	S	T	T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.												.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.				.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N
Query Conservation
Alig confidence												.	.																																																		.	.	.
Template Conservation												.	.																																																		.	.	.
Template Sequence		W	F	V	D	Q	R	K	F	P	D	.	.	G	I	E	H	F	S	Q	A	V	H	Q	Q	G	X	K	F	G	L	W	F	E	P	E	X	V	S	V	D	S	D	L	Y	Q	Q	H	P	D	W	L	I	H	A	P	K	S	T	P	T	P	.	.	.	G	R	H	Q	F	V	L	D	X	A	R	P	E	V	V	D
Template Known Secondary structure			S	B		T	T	T		T	T	.	.												T	T									T	T				S	S	S	S						G	G	G	B				T	T						.	.	.	S	S	S				B		T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.																																																		.	.	.
Template SS confidence
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.			.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.				.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	L	F	K	L	X	S	Q	X	I	E	S	A	N	L	D	Y	I	K	W	D	.	.	.	.	.	X	N	R	Y	A	T	E	X	F	S	S	R	L	T	S	D	Q	Q	L	E	L	P	H	R	Y	I	L	G	V	Y	Q	L	Y	A	R	L	T	Q	A	Y	P	N	V	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															T		S						.	.	.	.	.			S				S				S	S	S		G	G	G	G	G	G																					T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.						480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.
		465	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.								.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.		.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.																															.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.																															.
Query Sequence		G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	.	.	.	.	.	.	.	K	L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	E	N	F	V	L	P	L	.	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.																															.
Alig confidence		.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.																															.										.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	E	S	C	A	S	G	G	G	R	F	D	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	X	X	Y	Y	A	P	Q	A	W	T	S	D	D	T	D	A	A	E	R	L	L	I	Q	F	G	T	S	Y	G	Y	P	Q	A	X	X	G	A	H	V	S	A	V	P	N	D	Q	X	G	R	I	T	S	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.				S	T	T	T	S	S		S			.	.	.	.	.	.	.	.					S	S						S															T	T	T	S		G	G	G								S	S		T	T	T						.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.
Template SS confidence
					525	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.									.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		537	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.		.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.
Query SS confidence																																																																															.
Query Sequence		D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	.	K	A
Query Conservation																																																																															.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	T	R	G	A	V	A	F	F	G	D	L	G	Y	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	T	K	X	A	P	T	E	L	D	Q	V	K	K	Q	V	A	F	Y	K	C	Y	R	Q	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	S	S						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	T	T																			T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.
		616	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650		.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.					.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690
Predicted Secondary structure																																					.																		.	.	.	.
Query SS confidence																																					.																		.	.	.	.
Query Sequence		M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	N	E	.	I	I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	.	.	.	.	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N
Query Conservation																																					.																		.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.																										.																		.	.	.	.											.	.
Template Conservation								.	.	.	.																																																										.	.
Template Sequence		F	Q	F	G	K	F	.	.	.	.	Y	R	I	D	S	P	F	V	E	D	G	N	V	T	S	W	Q	V	V	S	D	D	Q	K	Q	A	I	A	A	R	Y	Q	L	L	N	H	P	N	A	P	Y	T	R	F	Y	F	K	G	L	R	P	N	Q	R	Y	Q	I	.	.	N	D	D	P	S	T	Y	Y	G	D	E
Template Known Secondary structure					S			.	.	.	.				S		T	T	S	T	T											T	T	S	S									S	S			S	S										S			T	T						.	.	T	T			S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.																																																										.	.
Template SS confidence
		633	.	.	.	.	.					.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.			.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.
		691	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.											.	720	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	I	W	L	V	R	E	A
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	X	N	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	F	V	P	T	I	L	A	D	G	Q	E	S	K	D	F	Y	T	Q	L	F	V	V	T	A
Template Known Secondary structure					T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										S	S	S			S	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		707	.	.	710	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.