Job Description P07762 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 23 Aligned Residues 503 % Identity 18% Template c3edeB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:cyclomaltodextrinase; PDBTitle: structural base for cyclodextrin hydrolysis Resolution 1.71 Å

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		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	A	R	R	V	S	V	V	G	Q	F	N	Y	W	D	G	R	R	H	P	M	R	L	R	K	E	S	G	I	W	E	L	F	I	P	G	A	H	N	G	Q	L	Y	K	Y	E	M	I	D	A	N	G	N	L	R	L	K	S	D	P	Y	A	F	E	A	Q	M	R	P	E	T	A	S	L	I	C	G	L	P	E
Query Conservation
Alig confidence												.	.															.			.																								.	.	.	.
Template Conservation												.	.															.			.																								.	.	.	.
Template Sequence		Q	H	K	G	L	Q	L	M	V	H	.	.	G	R	D	I	G	R	M	E	A	A	L	D	Y	P	.	G	V	.	R	L	V	S	P	T	R	V	P	N	A	N	Y	L	F	V	D	L	E	I	G	P	E	.	.	.	.	A	Q	P	G	S	F	D	I	V	F	K	G	D	G	R	S	E	R	Y	R	Y	R	L
Template Known Secondary structure		S	S									.	.	S	T	T	G	G	G							B	T	.	T		.									S		T	T										T	T	.	.	.	.			S										T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.															.			.																								.	.	.	.
Template SS confidence
		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.			.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.		.	.		.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.					.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	V	V	Q	T	E	E	R	K	K	A	N	Q	F	D	A	P	I	S	I	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	R	H	T	D	N	N	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Conservation																				.																																															.
Template Sequence		L	A	R	E	Q	G	S	A	Q	R	Q	G	F	G	P	G	D	A	.	I	Y	Q	I	M	P	D	R	F	A	N	G	D	P	S	N	D	N	V	A	G	M	R	E	Q	A	D	R	R	H	G	G	G	R	H	G	G	D	I	R	G	T	I	D	H	L	.	D	Y	I	A	G	L	G	F	T	Q	L	W	P	T
Template Known Secondary structure						T	T		T	T						T	T			.												S		G	G	G	S	S		T	T		S					T	T	S	T	T	S												T		.						T	T
Template Predicted Secondary structure																				.																																															.
Template SS confidence
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.		.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.		.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		288	.	290	.			.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.
Query SS confidence						.	.
Query Sequence		P	I	N	E	.	.	H	P	F	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G
Query Conservation						.	.
Alig confidence						.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	L	V	E	N	D	A	A	A	Y	S	Y	H	G	Y	A	A	T	D	H	Y	R	I	D	P	R	Y	G	S	N	E	D	F	V	R	L	S	T	E	A	R	K	R	G	M	G	L	I	Q	D	V	V	L	S	H	I	G	K	H	H	W	W	M	K	D	L	P	T	P	D	W	I	N	Y	G	G	K	F	V	P
Template Known Secondary structure									S	S		G	G	G			S		S							T	T	T																T	T										S	B			T	T		G	G	G	G	S		S	S	T	T	S	B	G	G	G	G	S			B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
		366	.																								.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	D	W	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	Q	H	H	R	V	A	V	Q	D	P	Y	A	A	Q	A	D	S	E	N	F	T	K	G	W	F	V	E	G	M	P	D	L	N	Q	T	N	P	L	V	A	N	Y	L	I	Q	N	N	I	W	W	I	E	Y	A	G	L	S	G	L	R	I	D	T	Y	G	Y	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						G	G	G	G	S		T	T												S	B	S	S	T	T	S		B	B		T	T	S																			T		S					S	S	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
		423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.								.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	.	.	.	.	.	.	.	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K	L
Query Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	A	F	L	T	E	Y	T	R	R	L	M	A	E	Y	P	R	L	N	M	V	G	E	E	W	S	T	R	V	P	V	V	A	R	W	Q	R	G	K	A	N	F	D	G	Y	T	S	H	L	P	S	L	M	D	F	P	L	V	D	A	M	R	N	A	L	S	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T										S							T	T	S	T	T				T	T										B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
		496	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.				.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.
Query Sequence		D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	.	.	.	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F
Query Conservation																						.	.	.
Alig confidence																						.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	G	E	E	N	G	L	N	E	V	Y	E	T	L	S	L	D	Y	L	Y	P	E	P	Q	N	L	V	L	F	G	G	N	H	D	M	A	R	M	F	S	A	A	G	E	D	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	W	R	M	N	L	V	F	L	M	T	M	P	R	I	P	Q	F	Y	S	G	D	E	I
Template Known Secondary structure		T	T	S	S		T	T									G	G	G	G	S	S		G	G	G	S				S			T	T	S							T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.													S	S	S						T	T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430										.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
		573	.	.	.	.	.																.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	Q	G	R	E	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	H	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	M	T	S	T	V	K	G	R	D	D	A	S	Y	R	R	D	F	P	G	G	W	A	G	D	K	A	N	A	F	S	G	A	G	L	T	S	Q	Q	R	A	A	Q	D	L	V	R	K	L	A	N	W	R	K	N	Q	P	V	I	H	N	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	L	M	H	F	G	P	E	E	N
Template Known Secondary structure		T						S	S			G	G	G	G					T	T	S	S	T	T		S	S		T	T	T		T	T																					T									.	.	.	.	.	.	.	.							B	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.									.	520	.	.	.	.	.	.	.
		638	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.						.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	N	E	I	I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	.	.	.	.	.	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S
Query Conservation																																	.	.	.	.	.
Alig confidence												.																.					.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.																.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	W	V	Y	F	R	Y	N	K	D	.	K	R	I	M	V	A	M	N	N	N	D	K	P	M	T	.	L	P	T	A	R	F	Q	E	M	L	K	G	A	P	S	G	V	D	F	L	S	G	K	T	V	G	L	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E
Template Known Secondary structure										S	S	.										S	S	S				.			G	G	G	G					T	T						B	T	T	T							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.																.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		528	.	530	.	.	.	.	.	.	.		.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.		.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.																								.
		713	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	R	L	A	P	K	S	V	V	V	I	E
Template Known Secondary structure						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		583	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.