Job Description P07762 Confidence 99.23% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 113 Aligned Residues 365 % Identity 15% Template c3cc1B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:putative alpha-n-acetylgalactosaminidase; PDBTitle: crystal structure of a putative alpha-n-acetylgalactosaminidase2 (bh1870) from bacillus halodurans c-125 at 2.00 a resolution Resolution 2.00 Å

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		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.													.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.
Template Sequence		E	V	L	G	N	A	E	Y	X	A	N	H	L	K	K	Y	G	W	E	Y	I	V	V	D	I	Q	W	Y	E	P	T	A	N	N	P	F	A	P	L	C	X	D	E	Y	G	R	L	L	P	A	T	N	R	F	P	S	A	K	N	G	A	G	.	.	.	.	F	K	P	L	S	D	A	I	H	D	L	G	L	K
Template Known Secondary structure														T	G	G	G	T								S		T	T		T	T				T	T					B		T	T	S		B				T	T	T		G	G	G	T	T	T	T	T	.	.	.	.	T										T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.
Template SS confidence
		29	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90					.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.			.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.
Query SS confidence																																													.	.
Query Sequence		V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	N	T	L	I	.	.	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S
Query Conservation																																													.	.
Alig confidence																																													.	.																				.														.	.
Template Conservation																																																																		.														.	.
Template Sequence		F	G	I	H	I	X	R	G	I	P	R	Q	A	V	Y	E	N	S	P	V	L	G	S	T	K	T	A	R	E	I	A	H	T	N	S	I	C	P	W	N	T	D	X	Y	G	V	D	P	T	K	E	G	A	Q	S	Y	Y	N	S	L	F	E	L	Y	.	A	Q	W	G	V	D	F	V	K	V	D	D	I	.	.
Template Known Secondary structure								S	S									T		B		T	T	S	S		B							T	T			B	T	T	B		S						T	T	S	T	T													.			T	T								S		.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																		.														.	.
Template SS confidence
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.		.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	S	R	L	Y	D	T	H	L	E	E	I	K	X	I	Q	R	A	I	Q	A	C	G	R	P	X	V	L	S	L	S	P	G	P	A	P	I	K	W	R	I	T	D	D	F	W	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	S	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		B	T	T	B																T	S	S	S										S						T	T	S		S			S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.												.	.	.
		490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G
Query Conservation
Alig confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Sequence		L	Y	Q	X	F	E	R	C	E	V	W	E	K	H	I	G	T	G	H	W	P	D	C	G	X	L	P	L	G	H	I	G	I	R	S	V	D	G	P	G	G	D	R	W	T	R	F	T	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	Q	L	T	X	X	N	L	W	A	I	C	.	H	S	P	L	X	F	G	G
Template Known Secondary structure														T	S	S			S	S							B			S				S	S		S	S	S	S	S	S	S					S			.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	T							S
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template SS confidence
		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.										.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310		.	.	.	.	.	.	.	.
		570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.			.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.
Query SS confidence																																				.	.
Query Sequence		N	E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	.	.	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E
Query Conservation																																				.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R	D	N	D	E	W	T	L	S	L	L	T	N	E	G	I	L	S	I	N	Q	K	S	V	L	N	R	F	V	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	E	D	K	V	A	W	A	A	N	G	R	N
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T									S	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		319																						320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350														.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
		648	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.				.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.
Query Sequence		G	N	E	I	I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	.	.	.	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V
Query Conservation																										.	.	.
Alig confidence																		.								.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template Conservation																		.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template Sequence		G	E	A	Y	V	A	L	F	N	L	H	D	Q	Q	K	T	.	L	Q	F	R	L	D	X	V	G	I	X	E	T	V	Q	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	N	V	W	D	R	S	F	L	Q	S	L	A	P	.	.	.	.	.	S	E	S	F	Q	I	E	L	K	P	H	Q	S	X	X	L	K
Template Known Secondary structure		S										S	S	S				.					G	G	G	T	T			S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T									T	.	.	.	.	.	T									T	T
Template Predicted Secondary structure																		.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380		.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.												.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410						.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.