Job Description P07762 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 43 Aligned Residues 425 % Identity 17% Template c3bmwA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:cyclomaltodextrin glucanotransferase; PDBTitle: cyclodextrin glycosyl transferase from thermoanerobacterium2 thermosulfurigenes em1 mutant s77p complexed with a maltoheptaose3 inhibitor Resolution 1.60 Å

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		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.			.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																						.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																						.	.
Query Sequence		N	Q	F	D	A	P	I	S	I	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	R	H	T	D	N	N	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	.	.	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	.	.
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																						.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.		.	.																						.	.
Template Conservation																																																							.
Template Sequence		V	V	N	Y	S	T	D	V	I	Y	Q	I	V	T	D	R	F	V	D	G	N	T	S	N	N	P	T	G	D	L	Y	D	P	T	H	T	S	L	K	K	Y	F	G	G	D	W	Q	G	I	I	N	K	I	.	N	D	G	Y	L	T	G	M	G	V	T	A	I	W	I	P	Q	P	V	E	N	I	Y	A	V	L
Template Known Secondary structure		T	T			T	T								G	G	G	T					G	G	G	S			G	G	G	B		T	T	S		S	T	T	S	B													.		T	S	T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																																							.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.		.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
											296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	D	S	T	F	G	G	S	T	S	Y	H	G	Y	W	A	R	D	F	K	R	T	N	P	Y	F	G	S	F	T	D	F	Q	N	L	I	N	T	A	H	A	H	N	I	K	V	I	I	D	F	A	P	N	H	T	S	P	A	S	E	T	D	P	T	Y	A	E	N	G	R	L	Y	D	N	G	T	L	L	G	G
Template Known Secondary structure				T	T	T					S	T	T	S		S									T	T	T																T	T									T	T							S	S		T	T	S	T	T	T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
						354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.									.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	H	Q	D	W	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E
Query Conservation		.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.																													.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	T	N	D	T	N	G	Y	F	H	H	Y	G	G	T	D	F	S	S	Y	E	D	G	I	Y	R	N	L	F	D	L	A	D	L	N	Q	Q	N	S	T	I	D	S	Y	L	K	S	A	I	K	V	W	L	.	D	M	G	I	D	G	I	R	L	D	A	V	K	H	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	T	T		T	T			B			S		B			S	S	S							S	B	S	T	T				B		T	T	S																.	T	T	T							T	T	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																							.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220		.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
		422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.		.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Predicted Secondary structure																																																.
Query SS confidence																																																.
Query Sequence		W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	.	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R
Query Conservation																																																.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	F	G	W	Q	K	N	F	M	D	S	I	L	S	Y	R	P	.	V	F	T	F	G	E	W	F	L	G	T	N	E	I	D	V	N	N	T	Y	F	A	N	E	S	G	M	S	L	L	D	F	R	F	S	Q	K	V	R	Q	V	F	R	D	N	T	D	T	M
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																S		.											T	T													S	S	S			B													T	S			S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template SS confidence
															236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.		.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510			.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.
Query SS confidence												.	.
Query Sequence		Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	.	.	I	L	Y	N	Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W
Query Conservation												.	.
Alig confidence												.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	G	L	D	S	M	I	Q	S	T	A	S	D	Y	N	F	I	N	D	M	V	T	F	I	D	N	H	D	M	D	R	F	Y	N	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	R	P	V	E	Q	A	L	A	F	T	L	T	S	R	G	V	P	A	I	Y	Y	G	T	E	Q	Y	M	T	G	N	G
Template Known Secondary structure																T	T	G	G	G					S			T	T	S			S			S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S													S	S	S						T	T	G	G	G	T					S
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.												.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
		579	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	H	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	N	E	I	I	V	A	S	N	F	T
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation											.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Sequence		D	P	Y	N	R	A	M	M	T	.	.	.	.	S	F	N	T	S	T	T	A	Y	N	V	I	K	K	L	A	P	L	R	K	S	N	P	A	I	A	Y	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Q	Q	R	W	I	N	N	D	V	Y	I	Y	E	R	K	F	G	N	.	N	V	A	L	V	A	I	N	R	N
Template Known Secondary structure		T	T	G	G	G					.	.	.	.				T	T	S										T	T													.	.	.	.	.	.	.	.								S	S									T	T	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template SS confidence
		371	.	.	.	.	.	.	.	.					380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.									.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.		.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
		659	660	.	.	.				.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.
Query SS confidence							.	.	.
Query Sequence		P	V	P	R	H	.	.	.	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V	R	E	A
Query Conservation							.	.	.
Alig confidence							.	.	.								.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Conservation																	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Sequence		L	S	T	S	Y	N	I	T	G	L	Y	T	A	L	P	.	A	G	T	Y	T	D	V	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	L	L	N	G	N	S	I	S	V	A	S	D	G	S	V	T	.	.	.	.	.	P	F	T	L	S	A	G	E	V	A	V	W	Q	Y	V	S
Template Known Secondary structure		S	S							S		B		S	S		.	S						T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T	S								T	T	S	B	B		.	.	.	.	.						T	T
Template Predicted Secondary structure																	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.		.	.	.	.	.	.	.	460										.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.						.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.