Job Description P07762 Confidence 98.61% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 120 Aligned Residues 344 % Identity 12% Template c3a5vA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of alpha-galactosidase i from mortierella vinacea Resolution 2.00 Å

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		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.		.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.				.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.																								.	.	.
Query SS confidence														.																								.	.	.
Query Sequence		S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	.	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	G	S	W	.	.	.	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G
Query Conservation														.																								.	.	.
Alig confidence														.												.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.														.																											.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.																					.																											.
Template Sequence		L	I	L	D	A	A	K	A	I	A	S	S	G	L	K	D	L	G	Y	N	Y	V	I	I	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	C	W	Q	K	N	E	R	E	S	S	K	T	L	L	A	D	P	T	.	K	F	P	R	G	I	K	P	L	V	D	D	I	H	N	L	G	L	K	A	G	I	Y	S	S	A	.
Template Known Secondary structure														T					T							.	.	.	.	.	.	.	.		S	S		B		S	S			T	T	S				B		T	T	.	T		T	T												T	T									S	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.																					.																											.
Template SS confidence
		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50									.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70		.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.
		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	L	T	C	G	G	H	I	A	S	L	G	Y	E	D	I	D	A	K	T	W	A	K	W	.	G	I	D	Y	L	K	Y	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	B		T	T	S		B			T	T													.	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.		.	.	.	.	.	.	.	.
		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.						.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		G	E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	.	.	.	.	.	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K
Query Conservation																																													.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																																										.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																																																																					.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	N	C	Y	N	Q	G	Q	S	G	T	P	K	L	S	Y	D	R	Y	K	A	M	G	N	A	L	N	K	T	G	R	P	M	L	Y	S	L	C	N	W	G	E	D	G	P	W	N	F	A	S	T	I	S	N	S	W	R	I	S	G	D	V	Y	D	N	F	N	R	P	.	.	.	.	.	.	.	D	P	A
Template Known Secondary structure		.	.		T	T		T	T			S	S																		T		S								S	T	T	T	T						S	T	T	T		S					S	S		B		S		S	S			.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.																																																																					.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.								.	.	200
		495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q
Query Conservation
Alig confidence																																																																					.	.	.	.								.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.	.								.	.
Template Sequence		C	P	C	T	T	Y	D	C	V	L	A	G	F	R	C	S	V	M	N	I	I	N	K	A	V	A	V	S	Q	K	A	R	S	G	G	W	N	D	L	D	M	L	E	V	G	N	G	G	M	N	Q	E	E	Y	R	V	H	Y	T	I	W	A	A	L	K	S	P	.	.	.	.	L	I	L	G	N	D	V	.	.
Template Known Secondary structure		S				S	S			S				S		B													G	G	G		B	T	T	B							B		T	T	S	S	S	S															T	T			.	.	.	.					S		S	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.								.	.
Template SS confidence
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.					.	.	270	.	.	.	.
		575	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.			.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.
Query SS confidence																															.	.
Query Sequence		G	R	E	W	N	H	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	.	.	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	N	E	I	I
Query Conservation																															.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.									.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	N	I	T	N	T	T	K	E	I	I	M	N	K	E	V	I	A	V	N	Q	.	D	S	S	F	S	P	A	N	R	I	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	G	D	Q	Q	L	F	S	G	N	L	A	N	N	T	Q	V	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S																			T	.		T	T									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T									T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																				275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.		.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.											.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
		653	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.												.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	L	L	N	A	G	D	S	A	A	K	.	M	T	A	T	W	D	D	I	W	V	Y	N	L	P	N	V	D	S	S	R	S	I	E	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	L	W	K	Q	K	S	L	G	N	F	S	N	H	.	.	.	.	.	.	.	I	T	L	D	V	P	A	H	G	V	R
Template Known Secondary structure							S	S	S				.									T	G	G	G	T	T	S	B		T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T	T								S		.	.	.	.	.	.	.							T	T
Template Predicted Secondary structure													.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.		.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360												.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.								.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
		722	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	L	V	R	E	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	L	K	F	M	D
Template Known Secondary structure						S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		387	.	.	390	.	.