Job Description P07762 Confidence 95.96% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 229 Aligned Residues 335 % Identity 16% Template c3a23A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:putative secreted alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of beta-l-arabinopyranosidase complexed with d-2 galactose Resolution 1.90 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.		.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.				.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
Predicted Secondary structure													.																								.	.	.
Query SS confidence													.																								.	.	.
Query Sequence		Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	.	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	G	S	W	.	.	.	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H
Query Conservation													.																								.	.	.
Alig confidence													.												.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.														.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template Sequence		I	K	K	Q	V	D	A	F	V	A	A	G	L	P	A	A	G	Y	T	Y	I	N	I	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	G	W	W	Q	G	T	R	D	S	A	G	N	I	T	V	D	T	A	.	E	W	P	G	G	M	S	A	I	T	A	Y	I	H	S	K	G	L	K	A	G	I	Y	T	D	A	G	K
Template Known Secondary structure												T	T					T							.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S			S		B		T	T	S		B				T	T	.	T	S	T	T												T	T									S	S	S
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template SS confidence
		75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.									.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.		.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	G	C	G	Y	Y	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	T	G	R	P	A	A	P	G	S	G	S	E	G	H	Y	D	Q	D	M	L	Q	F	S	T	W	.	G	F	D	F	V	K	V	D	W	C	G	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	S				T	T		S		T	T													.	T		S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		146	.	.	.	150	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.		.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.		.	.	.	.	460	.	.	.	.						.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.										.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.										.	.	.	.	.
Query Sequence		E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	.	M	A	E	E	S	T	D	F	P	.	.	.	.	.	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K
Query Conservation																																					.										.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																															.										.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	A	E	G	L	D	A	A	T	T	Y	K	S	I	S	D	A	V	G	R	A	A	A	T	T	G	R	P	L	T	L	S	I	C	N	W	G	Y	Q	N	P	W	N	W	A	A	G	Q	A	P	L	W	R	T	S	T	D	I	I	Y	Y	G	N	Q	P	S	M	T	S	L	L	S	N	F	D	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.			T																						S										T	T	T	T		G	G	G	T		T	T	T		S					S	S		S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
		495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.								.	.
Template Conservation																										.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.								.	.
Template Sequence		T	L	H	P	T	A	Q	H	T	G	Y	Y	N	D	P	D	M	L	M	V	G	M	D	G	.	.	.	.	F	T	A	A	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	R	T	H	M	N	L	W	A	I	S	G	A	P	.	.	.	.	L	L	A	G	N	D	L	.	.
Template Known Secondary structure					T	T	T		B	T	T	B						S			T	T		T	T	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T			.	.	.	.					S		G	.	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.								.	.
Template SS confidence
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290					.	.	.	.	.																					.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.					310	.	.	.	.	.	.
		575	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.			.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.		.	.	.	.	650	.
Predicted Secondary structure																															.	.																																											.
Query SS confidence																															.	.																																											.
Query Sequence		G	R	E	W	N	H	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	.	.	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	.	K	E	G	N	E	I
Query Conservation																															.	.																																											.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	M	T	S	E	T	A	G	I	L	K	N	P	E	V	I	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Q	D	S	R	G	L	Q	G	V	K	V	A	E	D	T	T	G	L	Q	A	Y	G	K	V	L	S	G	T	G	N	R	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G										T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T		T	T												T	T									S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																				317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.											.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
		652	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.					.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.
Query Sequence		I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	.	.	.	.	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V
Query Conservation																								.	.	.	.
Alig confidence														.										.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	V	L	L	N	R	T	S	A	A	H	D	.	I	T	V	R	W	S	D	L	G	L	T	N	A	S	A	T	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	L	W	A	R	Q	N	V	G	T	S	A	T	G	.	.	.	.	.	.	.	Y	T	A	S	V	P	A	G	G	S	V	M	L	T
Template Known Secondary structure								S	S	S				.					T	T	T	T	T	B		S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T	T							S	S		.	.	.	.	.	.	.							T	T
Template Predicted Secondary structure														.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380		.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.												.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.								.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.