Job Description P07762 Confidence 79.55% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 381 Aligned Residues 366 % Identity 12% Template c2zq0B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alpha-glucosidase (alpha-glucosidase susb); PDBTitle: crystal structure of susb complexed with acarbose Resolution 1.60 Å

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		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.				.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.
Query Sequence		S	W	R	R	H	T	D	N	N	F	W	L	S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	G	S	W	G	Y	Q	.	.	.	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A
Query Conservation																																																				.	.	.
Alig confidence																																											.									.	.	.												.	.	.	.
Template Conservation																																											.																							.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	S	K	T	K	P	N	G	K	H	S	A	N	T	A	N	V	K	R	Y	I	D	F	A	A	A	H	G	F	D	A	V	L	V	E	G	W	N	E	G	.	W	E	D	W	F	G	N	S	K	D	Y	V	F	D	F	V	T	P	Y	P	D	F	.	.	.	.	D	V	K	E	I	H	R	Y	A	A	R	K
Template Known Secondary structure			G	G	G	S		B		S		B																	T	T		S						S		B	T	T	.	G	G	G		S	S	S			S	S				S	S		B		T	T		.	.	.	.												T
Template Predicted Secondary structure																																											.																							.	.	.	.
Template SS confidence
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.		.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.					.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	I	K	M	M	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	H	E	T	S	A	S	V	R	N	Y	E	R	H	.	.	.	.	.	.	M	D	K	A	Y	Q	F	M	A	D	N	G	Y	N	S	V	K	S	G	Y	V	G
Template Known Secondary structure		T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	B								.	.	.	.	.	.											T	T										S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		431	.	.	.	.	.																																	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450							.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
		409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.
Template Sequence		N	I	I	P	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	H	H	Y	G	Q	W	M	N	N	H	Y	L	Y	A	V	K	K	A	A	D	Y	K	I	M	V	N	A	H	E	A	T	R	P	T	G	I	C	R	T	Y	P	N	L	I	G	N	E	S	A	R	G	T	E	Y	.	.	.
Template Known Secondary structure		S		B	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	S																	T	T						T	T	S					S	G	G	G	T		T	T							S			G	G	G	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.
Template SS confidence
		473	.	.	.	.	.																	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
		489	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M
Query Conservation
Alig confidence		.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation		.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Sequence		.	.	E	S	F	G	G	N	K	V	Y	H	T	T	I	L	P	F	T	R	L	V	G	G	P	M	D	Y	T	P	G	I	F	E	T	H	C	N	K	M	N	P	A	N	N	S	Q	V	R	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	R	Q	L	A	L	Y	V	T	M	Y	S	P	.	.	.	.	L	Q	M
Template Known Secondary structure		.	.	G	T	T	T				T	T	G	G	G	T	G	G	G	T	T	T	T	T	S		B							S			B	G	G	G	T		T	T				B		S	S		.	.	.	.	.	.	.	.											S			S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template SS confidence
				534	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.									.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.					.	.	.
		569	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	D	I	P	E	N	Y	E	R	F	M	D	A	F	Q	F	I	K	D	V	A	L	D	W	D	E	T	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Y	L	E	A	E	P	G	E	Y	I	T	I	A	R	K	A	K	D	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S								T												S	S					.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	T									T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																										600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.									.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.
			649	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.		.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.			720	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																										.																																															.	.
Query SS confidence		.																										.																																															.	.
Query Sequence		.	N	E	I	I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	.	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	.	.	T	I	W	L	V
Query Conservation		.																										.																																															.	.
Alig confidence		.																										.													.	.	.																																.	.
Template Conservation																																									.	.	.
Template Sequence		D	D	W	Y	V	G	C	T	A	G	E	N	G	H	T	S	K	L	V	F	D	F	L	T	P	G	K	Q	Y	I	A	T	V	Y	A	D	A	K	D	.	.	.	A	D	W	K	E	N	P	Q	A	Y	T	I	K	K	G	I	L	T	N	K	S	K	L	N	L	H	A	A	N	G	G	G	Y	A	I	S	I	K
Template Known Secondary structure		S										T	T									T	T	S		T	T												T	T	.	.	.		B	T	T	T	B	T	T											T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.
Template SS confidence
		648	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.				.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.
		725	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	E	A	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	V	K	D
Template Known Secondary structure				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		725	.	.	.