Job Description P07762 Confidence 99.03% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 115 Aligned Residues 376 % Identity 14% Template c2xn1B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: structure of alpha-galactosidase from lactobacillus acidophilus ncfm2 with tris Resolution 2.30 Å

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		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D
Query Conservation
Alig confidence																										.																									.	.
Template Conservation																										.																									.	.
Template Sequence		E	D	K	L	K	T	I	V	D	K	A	K	K	L	G	L	E	M	F	V	L	D	D	G	.	W	F	G	H	R	D	D	D	N	S	S	L	G	D	W	K	V	Y	K	K	K	F	P	N	.	.	G	L	G	H	F	A	D	Y	V	H	E	Q	G	L	K	F	G	L	W	F	E	P	E	M	I	S	Y	E	S
Template Known Secondary structure																T								T	T	.	S	B	T	T		S	S	T	T	S		T	T			S	B		T	T	T		T	T	.	.												T	T									T	T				S	S	S
Template Predicted Secondary structure																										.																									.	.
Template SS confidence
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.		.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.			.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	A	L	A	E	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I	P	N
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.																																				.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.																																				.	.	.	.	.
Template Sequence		N	L	Y	K	E	H	P	D	Y	L	M	H	V	P	G	R	K	P	C	P	S	R	N	Q	.	.	.	Y	V	L	E	L	G	R	K	E	V	R	D	N	I	F	E	Q	M	V	K	I	L	D	S	K	K	I	D	Y	I	K	W	D	M	N	.	.	.	.	.	R	S	L	S	D	I	Y	E	S	D	L	P	A
Template Known Secondary structure								G	G	G	B				T	T	S					B	T	T	B	.	.	.			B		T	T	S																T	T	S											.	.	.	.	.	S				S				T	T	S		G
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.																																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.				450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.						.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Sequence		D	Q	Q	G	E	A	Y	H	R	Y	V	L	G	Y	Y	D	L	L	N	K	L	V	T	R	Y	P	D	I	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	C	S	G	G	G	G	R	F	D	V	G	Q	.	A	Y	Y	T	P	Q	I	W	A	S	D	N	T	D	A	I	E	R	L	K	I	Q	Y
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	G																					T	T	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				B	T	B	B	T	T		S				.		T	T		S					B	S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template SS confidence
		498	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.													.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.		.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
		506	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H	D	A	S	L	D
Query Conservation
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	S	L	V	Y	P	Q	S	M	M	T	S	H	V	S	V	S	P	N	E	Q	N	G	R	I	T	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	R	G	A	V	A	M	.	.	.	.	.	W	G	D	L	G	Y	E	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T	T	S		G	G	G								S	S		T	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	.	.	.	.	.	T	S						S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		565	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.															.	.	.	.	.	.	600	.						.	.	.	.	.	.	.	.	610
		586	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.		.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.																																											.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.																																											.	.	.	.	.
Query Sequence		W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	.	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	N	E	I	I	V	A	S	.	.	.	.	.	N	F	T	P
Query Conservation																														.																																											.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																							.									.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	L	T	K	M	S	D	E	E	S	D	Q	V	V	K	Q	V	T	E	Y	K	K	I	R	E	V	T	Q	F	G	T	L	.	.	.	.	.	.	.	Y	R	L	K	A	S	A	S	N	Q	C	A	W	M	M	V	D	S	N	K	N	E	A	V	V	T	V	V	N	V	M	A	H	A	Q	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	G	G	G																										S			.	.	.	.	.	.	.						G	G	G	T									T	T	S											S			S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								611	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.								.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.
		660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V	R	E	A
Query Conservation
Alig confidence																				.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	C	T	K	T	K	L	A	G	L	D	P	D	K	R	Y	K	N	.	.	L	E	T	D	E	V	F	G	G	D	E	L	M	H	L	G	F	Y	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	R	G	D	F	K	A	K	M	Y	H	F	K	A
Template Known Secondary structure										S			T	T	S					.	.	T	T	T												T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S	S
Template Predicted Secondary structure																				.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		678	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.			.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.														.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730