Job Description P07762 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 559 % Identity 19% Template c2x4bA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:limit dextrinase; PDBTitle: barley limit dextrinase in complex with beta-cyclodextrin Resolution 2.10 Å

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		125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.	.
Query Sequence		L	G	A	H	A	D	T	M	D	G	V	T	G	T	R	F	S	V	W	A	P	N	A	R	R	V	S	V	V	G	Q	F	N	Y	W	D	G	R	R	H	P	M	R	L	R	K	E	S	G	I	W	E	L	F	I	P	G	A	H	N	G	Q	L	Y	K	Y	E	M	I	D	A	N	G	.	.	.	.	.	N	L
Query Conservation																																																																											.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.																																																															.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.
Template Sequence		L	G	A	V	F	S	E	.	.	.	.	D	S	V	S	L	H	L	W	A	P	T	A	Q	G	V	S	V	C	F	F	D	G	P	A	G	P	A	L	E	T	V	Q	L	K	E	S	N	G	V	W	S	V	T	G	P	R	E	W	E	N	R	Y	Y	L	Y	E	V	D	V	Y	H	P	T	K	A	Q	V	L	K
Template Known Secondary structure								S	.	.	.	.	S									T	T		S								S	T	T	T	S												T	T								G	G	G	T	T												T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.
Template SS confidence
		130	.	.	.	.	.	.					.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.				.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.			.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.				.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.												.	.																											.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.												.	.																											.	.	.
Query Sequence		R	L	K	S	D	P	Y	A	F	E	A	Q	M	R	P	E	T	A	S	L	I	C	.	.	.	G	L	P	E	K	V	V	Q	T	E	E	.	.	R	K	K	A	N	Q	F	D	A	P	I	S	I	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	R	H	T	D	.	.	.	N	N	F	W	L	S	Y	R	E	L	A	D	Q
Query Conservation																								.	.	.												.	.																											.	.	.
Alig confidence																								.	.	.												.	.																											.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	L	A	G	D	P	Y	A	R	S	L	S	A	N	G	A	R	T	W	L	V	D	I	N	N	E	T	L	K	P	A	S	W	D	E	L	A	D	E	K	P	K	L	D	S	F	S	D	I	T	I	Y	E	L	H	I	R	D	F	S	A	H	D	G	T	V	D	S	D	S	R	G	G	F	R	A	F	A	Y	Q
Template Known Secondary structure							T	T		S		B	S	G	G	G	S	S						T	T		G	G	G	S		T	T	G	G	G					S				S		G	G	G														T		T	T	S		T	T	T	T	T	S	G	G	G	G	G		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
									272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.		.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.
Template Sequence		A	S	A	G	M	E	H	L	.	R	K	L	S	D	A	G	L	T	H	V	H	L	L	P	S	F	H	F	A	G	V	D	D	I	K	S	N	W	K	F	V	D	E	C	E	L	A	T	F	P	P	G	S	D	M	Q	Q	A	A	V	V	A	I	Q	E	E	D	P	Y	N	W	G	Y	N	P	V	L	W	G	V
Template Known Secondary structure		T	S							.							T													S	S	S		S		G	G	G										T	T	S		T	T		S										T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure										.
Template SS confidence
		286	.	.	.	290	.	.	.		.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
		308	.	310	.	.	.	.								.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.					.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.
Query Sequence		P	T	R	R	F	G	T	.	.	.	.	.	.	.	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	D	.	.	.	.	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	N	T	L	I	Y	N
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	K	G	S	Y	A	S	D	P	D	G	P	S	R	I	I	E	Y	R	Q	M	V	Q	A	L	N	R	I	G	L	R	V	V	M	D	V	V	Y	N	H	L	D	S	S	G	P	C	G	I	S	S	V	L	D	K	I	V	P	G	Y	Y	V	R	R	D	T	N	G	Q	I	E	N	S	A	A	M	N	N	T	A
Template Known Secondary structure				G	G	G	S	S		S	S	S	T																T	T										S	B		S			S	S		S	T	T							S	T	T	T	S	B		B		T	T	S		B			T	T	S	S	S	B	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	E	H	F	M	V	D	R	L	I	V	D	D	L	L	N	W	A	V	N	Y	K	V	D	G	F	R	F	D	L	M	G	H	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	K	R	T	M	M	R	A	K	S	A	L	Q	S	L	T	T	D	A	H	G	V
Template Known Secondary structure		T	T	S																		S								T	T	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B													T							S	S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
					452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.							.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																												.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																												.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	.	.	.	.	.	.	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.																												.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																												.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	G	S	K	I	Y	L	Y	G	E	G	W	D	F	A	E	V	A	R	N	Q	R	G	I	N	G	S	Q	L	N	M	S	G	T	G	I	G	S	F	N	D	R	I	R	D	A	I	N	G	G	N	P	F	G	N	P	L	Q	Q	G	F	N	T	G	L	F	L	E	P	N	G	F	Y	Q	G	N	E	A	D	T
Template Known Secondary structure			G	G	G											G	G	G	G	G	G	T	T	S	S	B			T	T	T	T	T	T	T	T															S		T	T	S		T	T				T	T	T	T	T	T	T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580
																																																						517	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.		.	.	.	.	.	.	540	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	.	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Conservation
Template Sequence		R	R	S	L	A	T	Y	A	D	Q	I	Q	I	G	L	A	G	N	L	R	D	Y	V	L	I	S	H	T	G	E	A	K	K	G	S	E	I	H	T	F	D	G	L	P	V	G	Y	T	A	S	P	I	E	T	I	N	Y	V	S	A	H	D	N	E	T	L	F	D	V	I	S	V	K	T	P	M	I	L	S	V
Template Known Secondary structure																	B	T		B	S	S						T	T	S					T	T	T	S	B		T	T	S		B	S			B	S	S	G	G	G					S			S	S	S											S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		581	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
		544	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.									.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H	D	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	E	R	C	R	I	N	H	L	A	S	S	M	M	A	L	S	Q	G	I	P	F	F	H	A	G	D	E	I	L	R	S	K	S	I	D	R	D	S	Y	N	S	G	D	W	F	N	K	L	D	F	T	Y	E	T	N	N	W	G	V	G	L	P	P	S	E	K	N	E	D	N	W	P	L	M	K	P	R	L	E
Template Known Secondary structure																	T	S	B	S						T	T	G	G	G	T				T	T		S		G	G	G	S									T	T	S	S					S	S									G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		661	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740
											595	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.				.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.													.	650
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	.	.	.	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	P	S	F	K	P	A	K	G	H	I	L	A	A	L	D	S	F	V	D	I	L	K	I	R	Y	S	S	P	L	F	R	L	S	T	A	N	D	I	K	Q	R	V	R	F	H	N	T	G	P	S	L	V	P	G	V	I	V	M	G	I	E	D	A	R	G	E	S	P	E	M	A	Q	L	D	T	N	F	S	Y
Template Known Secondary structure			G	G	G	S																					T	T		G	G	G	G			S												S		S	T	T			T	T											S	S	S		S	S					S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		741	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820
		651	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V	R
Query Conservation
Alig confidence															.														.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.														.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	V	T	V	F	N	V	C	P	H	E	V	S	.	M	D	I	P	A	L	A	S	M	G	F	E	L	.	.	.	H	P	V	Q	V	N	S	S	D	T	L	V	R	K	S	A	Y	E	A	A	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	F	T	V	P	G	R	T	V	S	V	F	V	E
Template Known Secondary structure									S	S	S				.				G	G	G		S	S					.	.	.						T		S		T	T	G	G	G					T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T
Template Predicted Secondary structure															.														.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		821	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.		.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.				.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.										.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.