Job Description P07762 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 27 Aligned Residues 422 % Identity 21% Template c2wcsA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha amylase, catalytic region; PDBTitle: crystal structure of debranching enzyme from nostoc2 punctiforme (npde) Resolution 2.80 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	K	K	A	N	Q	F	D	A	P	I	S	I	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	R	H	T	D	N	N	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Conservation																																																															.
Template Sequence		Q	I	Q	T	P	D	W	V	K	H	A	V	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	K	Q	P	R	K	R	L	L	Q	E	A	R	W	E	D	W	D	S	M	P	T	L	Q	G	Y	K	G	G	D	L	W	G	I	M	E	D	L	.	D	Y	I	Q	N	L	G	I	N	A	I	Y	F	T	P	I	F	Q
Template Known Secondary structure							T	T	G	G	G								G	G	G	T				S	S					S		T	T			T	T	T	G	G	G						T			S									T		.							T							S
Template Predicted Secondary structure																																																															.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.		.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.																.	.	350	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	P	F	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	E	F	D	G	T	N	L
Query Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.
Template Sequence		S	A	S	N	.	.	H	R	Y	H	T	H	D	Y	Y	Q	V	D	P	M	L	G	G	N	E	A	F	K	E	L	L	D	A	A	H	Q	R	N	I	K	V	V	L	D	G	V	F	N	H	S	S	R	G	F	F	F	F	H	D	V	L	E	N	G	P	H	S	P	W	V	N	W	F	K	I	E	G	W	P	L
Template Known Secondary structure			S	T	T	.	.		T	T	S									G	G	G	T															T	T										S	B			T	T	S										G	G	G		T	T	G	G	G	B		B		S	S	S
Template Predicted Secondary structure						.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.			.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370					.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.
Query Sequence		Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	.	.	.	.	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N
Query Conservation																.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.																									.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	P	Y	N	G	E	F	P	A	N	Y	V	G	W	A	G	N	R	A	L	P	E	F	N	H	D	N	P	E	V	R	E	Y	I	M	E	I	A	E	Y	W	L	.	K	F	G	I	D	G	W	R	L	D	V	P	F	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S			S	S			S	B		B	G	G	G		T	T	S	B	B	B		T	T	S																.			T								S	T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																												.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200		.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																																				.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																																				.	.	.	.	.
Template Sequence		.	K	T	P	G	F	W	Q	E	F	R	D	R	T	K	A	I	N	P	E	A	Y	I	V	G	E	V	W	G	D	S	R	Q	W	L	D	.	.	.	.	.	G	T	Q	F	D	G	V	M	N	Y	L	F	A	G	P	T	I	A	F	A	A	G	D	R	V	V	L	E	Q	V	Q	S	R	D	Y	Q	P	Y	P
Template Known Secondary structure		.			T	T														T	T									S			G	G	G		S	.	.	.	.	.	S	S	S		S																T	G	G	G			S	S	S			T	T	T					S
Template Predicted Secondary structure		.																																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
			216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250						.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
						497	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	L	F	A	A	E	Y	A	T	K	I	Q	E	V	L	Q	L	Y	P	W	E	I	Q	L	T	Q	L	N	L	L	A	S	H	D	T	A	R	L	M	T	I	A	G	G	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	V	E	L	S	T	L	L	L	L	T	F	P	G	A	P	S	I	Y	Y	G	D	E	V
Template Known Secondary structure																	T	S	S						T	T					S			T	T	S							T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T	S	S	S						T	T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.										.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
		573	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	Q	G	R	E	W	N	H	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	N	E	I	I
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation																	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Sequence		G	L	P	G	G	I	D	P	D	S	R	R	G	F	P	.	.	.	.	E	A	N	W	N	Q	E	I	F	N	T	H	R	Q	L	I	T	I	R	Q	T	Y	P	A	L	R	T	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Q	V	L	Y	A	Q	G	Q	L	Y	L	F	A	R	T	L	G	T	.	E	E	L	I
Template Known Secondary structure		T					S	S	S	S	S						.	.	.	.																							T					S		.	.	.	.	.	.	.	.								T	T									T	T	.
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template SS confidence
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.					.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.									.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.		.	.	.	.
		653	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.		.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.
Query SS confidence													.
Query Sequence		V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	.	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V
Query Conservation													.
Alig confidence													.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	A	I	N	A	G	T	S	S	A	T	A	N	V	D	V	A	S	L	H	T	Q	P	N	K	L	L	Y	G	T	A	E	A	E	W	N	G	E	E	G	T	Q	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	L	T	L	P	A	R	S	G	C	I	L	G
Template Known Secondary structure							S	S	S										S		S	S								S										S	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.