Job Description P07762 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 53 Aligned Residues 423 % Identity 16% Template c2taaA_ PDB info PDB header:hydrolase (o-glycosyl) Chain: A: PDB Molecule:taka-amylase a; PDBTitle: structure and possible catalytic residues of taka-amylase a Resolution 3.00 Å

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		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.												.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.							.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	A	N	Q	F	D	A	P	I	S	I	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	R	H	T	D	N	N	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	.	.	.	.	.	.	F	D	G	S
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.
Template Sequence		A	T	P	A	D	W	R	S	Q	S	I	Y	F	L	L	T	D	R	F	A	R	T	D	G	S	T	T	A	T	C	N	T	A	D	Q	K	Y	C	G	G	T	W	Q	G	I	I	D	K	L	.	D	Y	I	Q	G	M	G	F	T	A	I	W	I	T	P	V	T	A	Q	L	P	Q	D	C	A	Y	G	D	A	Y
Template Known Secondary structure				T	T	T	G	G	G	S							B	T	T	B			T	T			T	T					G	G	G		S						G	G	G	G	G	T			.																	S				S	S			T	T				T
Template Predicted Secondary structure																																																			.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.		50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350								.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	.	.	.	.	.	.	.	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	G	Y	W	Q	T	D	I	Y	S	L	N	E	N	Y	G	T	A	D	D	L	K	A	L	S	S	A	L	H	E	R	G	M	Y	L	M	V	D	V	V	A	N	H	M	G	Y	D	G	A	G	S	S	V	D	Y	S	V	F	K	P	F	S	S	Q	D	Y	F	H	P	F	C	F	I	Q	N	Y	E	D	Q	T
Template Known Secondary structure		T					S	S	S	S	S			S	S	S			T	T													S									T	T	B					S		G	G	G				S	S		T	T		S	S	S	T	T	B					B			S	G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		371	.	.	.													.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	T	L	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	V	E	D	C	W	L	G	D	N	T	V	S	L	P	D	L	D	T	T	K	D	V	V	K	N	E	W	Y	D	W	V	G	S	L	V	S	N	Y	S	I	D	G	L	R	I	D	T	V	K	H	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	K	D	F
Template Known Secondary structure		S	T	T	T	S	B				T	T					B	B			S	S	S															T	T	T			S					T	T		S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.																									.	.	.	.
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.			.	.	.	510	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.
Query SS confidence																																																																						.	.
Query Sequence		L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	.	.	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T
Query Conservation																																																																						.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.																							.	.	.																																.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.																							.	.	.
Template Sequence		W	P	G	Y	N	K	A	.	.	.	.	.	A	G	V	Y	C	I	G	E	V	L	D	G	D	P	A	Y	T	C	P	Y	Q	N	.	.	.	V	M	D	G	V	L	N	Y	P	I	Y	Y	P	L	L	N	A	F	K	S	T	S	G	S	M	D	D	L	Y	N	M	I	N	T	V	K	S	D	C	P	D	S	T
Template Known Secondary structure									.	.	.	.	.	S		S															T	G	G	G	T	.	.	.	T	T	S	B														S	S	S	T	T			T														B			T	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.																							.	.	.
Template SS confidence
		216	.	.	.	220	.	.						.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.				.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
		517	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.
Template Sequence		L	L	G	T	F	V	E	N	H	D	N	P	R	F	A	S	Y	T	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	A	L	A	K	N	V	A	A	F	I	I	L	N	D	G	L	P	I	I	Y	A	G	Q	E	Q	H	Y	A	G	G	N	D	P	A	N	R	E	A	T	W	L	S	G	Y	P	.	.	T	D
Template Known Secondary structure							S	S		T	T	S			G	G	G	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															S	S	S						T	T	T	T	T	T					S	S	S	T	T				G	G	G	S	S			.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.
Template SS confidence
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.											.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.			.	.
		597	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																																															.	.	.
Query Sequence		H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	N	E	I	I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	.	.	.
Query Conservation																																																																															.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.																																				.										.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.																																				.
Template Sequence		S	E	L	Y	K	L	I	A	S	A	N	A	I	R	N	Y	A	I	S	K	D	T	G	F	V	T	Y	.	.	.	.	.	K	N	P	Y	I	K	D	D	T	T	I	A	M	R	K	G	T	D	G	S	Q	I	V	T	I	L	S	N	K	G	A	S	G	D	S	.	Y	T	L	S	L	S	G	A	S	Y	T	A
Template Known Secondary structure		S																				S			T	T	T	S	.	.	.	.	.								S	S	S								S	T	T											T	T				.						S	S					T
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.																																				.
Template SS confidence
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.						.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.		.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
				674	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V	R	E	A
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	Q	Q	L	T	E	V	I	G	C	T	T	V	T	V	G	S	D	G	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	P	M	A	G	G	L	P	R	V	L	Y	P	T	E
Template Known Secondary structure		T						S	T	T								T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	S	S								T	T
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.