Job Description P07762 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 629 % Identity 19% Template c2e8yA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:amyx protein; PDBTitle: crystal structure of pullulanase type i from bacillus subtilis str.2 168 Resolution 2.11 Å

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		37	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.			.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.		.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.						90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.																		.																			.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.																		.																			.	.	.	.	.
Query Sequence		R	A	L	L	P	D	A	T	D	V	W	V	I	E	P	K	T	G	.	.	R	K	L	A	K	L	E	C	L	D	S	R	G	F	F	S	G	.	V	I	P	R	R	K	N	F	F	R	Y	Q	L	A	V	V	W	H	.	.	.	.	.	G	Q	Q	N	L	I	D	D	P	Y	R	F	G	P	L	I	Q	E	M
Query Conservation																				.	.																		.																			.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.																		.																			.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	A	Y	V	D	D	M	N	I	I	T	V	L	I	P	A	E	Q	K	E	I	M	T	P	P	F	R	L	E	T	E	I	T	D	F	P	L	A	V	R	E	E	Y	S	L	E	A	K	Y	K	Y	V	C	V	S	D	H	P	V	T	F	G	K	I	H	C	V	R	A	S	S	G	H	K	T	D	L	Q	I	G
Template Known Secondary structure								T	T								G	G	G	T	T	T	S		S							T	T														S	S									S	S				T	T	S							T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.		.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.
Query SS confidence																		.
Query Sequence		D	A	W	L	L	S	E	G	T	H	L	R	P	Y	E	T	.	L	G	A	H	A	D	T	M	D	G	V	T	G	T	R	F	S	V	W	A	P	N	A	R	R	V	S	V	V	G	Q	F	N	Y	W	D	G	R	R	H	P	M	R	L	R	K	E	S	G	I	W	E	L	F	I	P	G	A	H	N	G	Q	L
Query Conservation																		.
Alig confidence																		.								.	.	.	.																																					.
Template Conservation																										.	.	.	.																																					.
Template Sequence		A	V	I	R	T	A	A	F	D	D	E	F	Y	Y	D	G	E	L	G	A	V	Y	T	A	.	.	.	.	D	H	T	V	F	K	V	W	A	P	A	A	T	S	A	A	V	K	L	S	H	P	N	K	S	G	R	T	F	Q	M	T	R	L	E	K	.	G	V	Y	A	V	T	V	T	G	D	L	H	G	Y	E
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	S											S								S	.	.	.	.	S									T	T		S									T	T	S											G	G	.	G								S			T	T
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.																																					.
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.					.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.		.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.			.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.	.
Query SS confidence																																																																												.	.
Query Sequence		Y	K	Y	E	M	I	D	A	N	G	N	L	R	L	K	S	D	P	Y	A	F	E	A	Q	M	R	P	E	T	A	S	L	I	C	G	L	P	E	K	V	V	Q	T	E	E	R	K	K	A	N	Q	F	D	A	P	I	S	I	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	R	H	T	D	N	N	F	.	.	W	L	S	Y
Query Conservation																																																																												.	.
Alig confidence									.																												.	.																		.																				.	.
Template Conservation									.																												.	.																		.
Template Sequence		Y	L	F	C	I	C	N	.	N	S	E	W	M	E	T	V	D	Q	Y	A	K	A	V	T	V	N	G	E	K	G	V	V	L	R	P	.	.	D	Q	M	K	W	T	A	P	L	K	P	F	S	H	P	V	D	.	A	V	I	Y	E	T	H	L	R	D	F	S	I	H	E	N	S	G	M	I	N	K	G	K	Y
Template Known Secondary structure									.	T	T								T	T		S	S	B		G	G	G		S							.	.													S		G	G	G	.														S	T	T	S			S	S	T	T	S	G
Template Predicted Secondary structure									.																												.	.																		.
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170		.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.			.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.		.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		266	.	.	.	270	.											.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.									.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	E	L	A	D	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	D	F	R
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	A	L	T	E	T	D	T	Q	T	A	N	G	S	S	S	G	L	A	Y	V	K	E	L	G	V	T	H	V	E	L	L	P	V	N	D	F	A	G	V	D	E	E	K	P	L	D	A	Y	N	W	G	Y	N	P	L	H	F	F	A	P	E	G	S	Y	A	S	N	P	H	D	P	Q	T	R	K	T	E	L	K
Template Known Secondary structure		G	G	G	G		T	T		B		T	T	S		B										T		S					S						S	S	S		T	T	S	G	G	G							S									S	T	T	S	S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.		.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.
Query SS confidence																													.
Query Sequence		Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	.	A	L	A	E	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G
Query Conservation																													.
Alig confidence																													.
Template Conservation
Template Sequence		Q	M	I	N	T	L	H	Q	H	G	L	R	V	I	L	D	V	V	F	N	H	V	Y	K	R	E	N	S	P	F	E	K	T	V	P	G	Y	F	F	R	H	D	E	C	G	K	P	S	N	G	T	G	V	G	N	D	I	A	S	E	R	R	M	A	R	K	F	I	A	D	C	V	V	Y	W	L	E	E	Y	N
Template Known Secondary structure										T	T									T	T			S	S	G	G	G	S						S	T	T	T	S	B		B		T	T	S	S	B			T	T	S	S	S			B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	D	G	F	R	F	D	L	L	G	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	D	T	V	L	Y	M	K	E	K	A	T	K	A	K	P	G	I	L	L	F	G	E	G	W	D	L	A	T	P	L	P	H	E	Q	K	A	A	L	A	N	A	P
Template Known Secondary structure								T	T	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B															S	T	T													S	S		G	G	G	B			G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
							479	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490										.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.									.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L
Query Conservation		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	M	P	G	I	G	F	F	N	D	M	F	R	D	A	V	K	G	N	T	F	H	L	K	A	T	G	F	A	L	G	N	G	E	S	A	Q	A	V	M	H	G	I	A	G	S	S	G	W	K	A	L	A	P	I	V	P	E	P	S	Q	S	I	N	Y	V	E	S	H	D	N	H	T	F	W	D	K	M	S	F
Template Known Secondary structure		G		T	T																S	S	S	T	T				G	G	G	T		G	G	G									B	T	T	S		B	T	T	B			S	S	S	S	G	G	G					S			S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.
		537	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.									.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.
Template Sequence		A	L	P	Q	E	N	D	S	R	K	R	S	R	Q	R	L	A	V	A	I	I	L	L	A	Q	G	V	P	F	I	H	S	G	Q	E	F	F	R	T	K	Q	G	V	E	N	S	Y	Q	S	S	D	S	I	N	Q	L	D	W	D	.	.	.	.	R	R	E	T	F	K	E	D	V	H	Y	I	R	R	L	I	S
Template Known Secondary structure				T	T																			T	S	B	S						T	T	G	G	G	T				T	T		S			T	T							S					.	.	.	.					T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.
Template SS confidence
		536	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.					.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.
		609	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.					.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.
Query Sequence		T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	.	.	.	.	N	E	I	I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M
Query Conservation																																										.	.	.	.
Alig confidence																.																										.	.	.	.																.	.	.																.	.	.
Template Conservation																.																																													.	.	.																.	.	.
Template Sequence		L	R	K	A	H	P	A	F	R	L	R	S	A	A	.	D	I	Q	R	H	L	E	C	L	T	L	K	E	H	L	I	A	Y	R	L	Y	D	L	D	E	V	D	E	W	K	D	I	I	V	I	H	H	A	S	P	D	S	V	E	.	.	.	W	R	L	P	N	D	I	P	Y	R	L	L	C	D	P	.	.	.
Template Known Secondary structure							G	G	G	G			S			.													S	S										T	T	T		S	S	S									S	S	S				.	.	.				S	S		S								T	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.																																													.	.	.																.	.	.
Template SS confidence
		612	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.		.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.				670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.
		685	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	F	Q	E	D	P	T	E	I	K	K	.	.	.	.	.	T	V	A	V	N	G	I	G	T	V	I	L	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T											S	.	.	.	.	.						S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.
Template SS confidence
												685	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.						.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.