Job Description P07762 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 515 % Identity 24% Template c2by0A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:maltooligosyltrehalose trehalohydrolase; PDBTitle: is radiation damage dependent on the dose-rate used during2 macromolecular crystallography data collection Resolution 1.55 Å

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		117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	H	L	R	P	Y	E	T	L	G	A	H	A	D	T	M	D	G	V	T	G	T	R	F	S	V	W	A	P	N	A	R	R	V	S	V	V	G	Q	F	N	Y	W	D	G	R	R	H	P	M	R	L	R	K	E	S	G	I	W	E	L	F	I	P	G	A	H	N	G	Q	L	Y	K	Y	E	M	I	D	A	N
Query Conservation
Alig confidence																			.	.																				.	.	.	.	.													.									.															.
Template Conservation																			.	.																				.	.	.	.	.													.									.															.
Template Sequence		T	Q	H	D	P	R	T	R	L	G	A	T	P	L	P	G	G	.	.	A	G	T	R	F	R	L	W	T	S	T	A	R	T	V	A	V	R	V	.	.	.	.	.	N	G	T	E	H	V	X	T	S	L	G	G	.	G	I	Y	E	L	E	L	P	.	V	G	P	G	A	R	Y	L	F	V	L	D	G	V	.
Template Known Secondary structure			S			G	G	G		S						G	G	G	.	.	T									S	S		S	S						.	.	.	.	.	T	T										T	.	T							S	.			T	T								T	T		.
Template Predicted Secondary structure																			.	.																				.	.	.	.	.													.									.															.
Template SS confidence
		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.			.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.						.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.		.	.	.	.	.	70	.	.		.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	N	L	R	L	K	S	D	P	Y	A	F	E	A	Q	M	R	P	E	T	A	S	L	I	C	G	L	P	E	K	V	V	Q	T	E	E	R	K	K	A	N	Q	F	D	A	P	I	S	I	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	R	H	T	D	N	N	F	W	L	S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																							.																			.															.	.	.	.	.	.											.
Template Conservation		.	.	.	.																							.																			.															.	.	.	.	.	.											.
Template Sequence		.	.	.	.	P	T	P	D	P	Y	A	R	F	L	P	D	G	V	H	G	E	A	E	V	V	D	.	F	G	T	F	D	W	T	D	A	D	W	H	G	I	K	L	A	D	.	C	V	F	Y	E	V	H	V	G	T	F	T	P	E	.	.	.	.	.	.	G	T	Y	R	A	A	A	E	K	L	.	P	Y	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.					T	T		S			T	T		T	T	S							.	T	T	S	S					T	T						G	G	G	.												S	S	S	.	.	.	.	.	.		S						T	T		.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																							.																			.															.	.	.	.	.	.											.
Template SS confidence
						87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.		.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.		.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140							.	.	.	.	.	.	.	.	.	150		.	.	.
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	D	G	T	N	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	E	L	G	V	T	A	I	Q	V	X	P	L	A	A	F	D	G	Q	R	G	W	G	Y	D	G	A	A	F	Y	A	P	Y	A	P	Y	G	R	P	E	D	L	X	A	L	V	D	A	A	H	R	L	G	L	G	V	F	L	D	V	V	Y	N	H	F	G	P	S	G	N	Y	L	S	S	Y	A	P	S	Y	F
Template Known Secondary structure					T													S	S	S				S	T	T									G	G	G																T	T										S				S	S	S								G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	D	R	.	.	.	.	.	.	.	F	S	S	A	W	G	X	G	L	D	Y	A	E	P	H	X	R	R	Y	V	T	G	N	A	R	X	W	L	R	D	Y	H	F	D	G	L	R	L	D	A	T	P	Y	X	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	D	S	E	T
Template Known Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.				S	S	S					T	T	S																					S					T	T	G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S	S
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		234	.	.								.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280																					.	.	.	.	.	.
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																																															.	.	.
Query Sequence		E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	.	.	.
Query Conservation																																																																															.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.	.																																							.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.
Template Sequence		H	I	L	T	E	L	A	Q	E	I	H	E	L	G	G	T	H	L	L	L	A	E	D	H	R	N	L	P	D	L	V	T	V	N	.	.	.	.	.	H	L	D	G	I	W	T	D	D	F	H	H	E	T	R	V	T	L	T	G	E	Q	E	G	Y	Y	A	G	Y	R	G	G	A	E	A	L	A	Y	T	I	R
Template Known Secondary structure													T	T		S										S			T					T	S	.	.	.	.	.			S					T															S	G	G	G	G	G				S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320						.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
																												514	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Conservation																																												.	.
Template Sequence		R	G	W	R	Y	E	G	Q	F	W	A	V	K	G	E	E	H	E	R	G	H	P	S	D	A	L	E	A	P	N	F	V	Y	C	I	Q	N	H	D	Q	I	G	.	.	N	R	P	L	G	E	R	L	H	Q	S	D	G	V	T	L	H	E	Y	R	G	A	A	A	L	L	L	T	L	P	X	T	P	L	L	F
Template Known Secondary structure			S	S	S									T	T										T	T			G	G	G					S								.	.	T	S	T	T				G	G	G	S	T	T																S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																												.	.
Template SS confidence
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.			.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		568	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Template Conservation																																																											.	.
Template Sequence		Q	G	Q	E	W	A	A	S	T	P	F	Q	F	F	S	D	H	A	G	E	L	G	Q	A	V	S	E	G	R	K	K	E	F	D	V	P	D	P	Q	A	E	Q	T	F	L	N	S	K	L	N	W	A	E	R	E	G	G	.	.	E	H	A	R	T	L	R	L	Y	R	D	L	L	R	L	R	R	E	D	P	V
Template Known Secondary structure		T	T	G	G	G	T		S	S																													T	T	S							T	S			G	G	G	G	G	S		.	.																				T	T
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.
Template SS confidence
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.			.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
		616	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	N	E	I	I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.																			.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.																			.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	H	N	R	Q	R	E	N	.	.	.	.	.	.	L	T	T	G	H	D	G	D	V	L	W	V	R	T	V	T	G	A	.	G	E	R	V	L	L	W	N	L	G	Q	D	T	R	A	V	A	E	V	K	L	P	F	T	V	P	R	R	L	L	L	H	T	E	G	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T				G	G	G	.	.	.	.	.	.							T	T									T	T	.										S	S	S				G	G	G	S			S	S										T	T			S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.																			.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		527	.	.	530	.	.	.	.							.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.		.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		696	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	T	L	G	A	G	E	A	V	L	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S				T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																		590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.