Job Description P07762 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 30 Aligned Residues 455 % Identity 16% Template c1zjaB_ PDB info PDB header:isomerase Chain: B: PDB Molecule:trehalulose synthase; PDBTitle: crystal structure of the trehalulose synthase mutb from2 pseudomonas mesoacidophila mx-45 (triclinic form) Resolution 1.60 Å

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		234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	K	A	N	Q	F	D	A	P	I	S	I	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	R	H	T	D	N	N	F	W	L	S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G
Query Conservation
Alig confidence																							.																		.																							.
Template Conservation																							.																		.																							.
Template Sequence		K	P	G	A	P	W	W	K	S	A	V	F	Y	Q	V	Y	P	R	S	F	K	.	D	T	N	G	D	G	I	G	D	F	K	G	L	T	E	K	L	.	D	Y	L	K	G	L	G	I	D	A	I	W	I	N	P	H	Y	A	S	P	N	T	.	D	N	G	Y	D	I	S	D	Y	R	E	V	M	K	E	Y	G
Template Known Secondary structure																		G	G	G	T		.		S	S	S	S	S	S									T		.							T															T	.	T	T	T	S	S		S							G	G	G
Template Predicted Secondary structure																							.																		.																							.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.		.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.		.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	M	E	D	F	D	R	L	M	A	E	L	K	K	R	G	M	R	L	M	V	D	V	V	I	N	H	S	S	D	Q	H	E	W	F	K	S	S	R	A	S	K	D	N	P	Y	R	D	Y	Y	F	W	R	D	G	K	D	G	H	E	P	N	N	Y	P	S	F	F	G	G	S	A	W	E	K	D	P	V	T	G
Template Known Secondary structure																T	T										S	B			T	T	S								T		S	S	S	T	T	G	G	G	B						B	T	T	B		S	S			B		T	T	S	S	B	S					T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
		364	.	.	.	.	.	370			.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.			.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.																																																				.	.
Query SS confidence									.	.																																																				.	.
Query Sequence		E	G	Y	H	Q	D	W	.	.	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	.	.	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L
Query Conservation									.	.																																																				.	.
Alig confidence									.	.																									.																											.	.
Template Conservation																																			.
Template Sequence		Q	Y	Y	L	H	Y	F	G	R	Q	Q	P	D	L	N	W	D	T	P	K	L	R	E	E	L	Y	A	M	L	R	F	W	L	.	D	K	G	V	S	G	M	R	F	D	T	V	A	T	Y	S	K	T	P	G	F	P	D	L	T	P	E	Q	M	K	N	F	A	E	A	Y	T	Q	G	P	N	L	H	R	Y	L
Template Known Secondary structure							S	S		T	T			B	B		T	T																	.	T	T	T							T	T	G	G	G	S	S			T	T											T					T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190		.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.		.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.					.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.																														.	.	.	.
Query SS confidence																																						.																														.	.	.	.
Query Sequence		R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	.	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	.	.	.	.	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N
Query Conservation																																						.																														.	.	.	.
Alig confidence											.																											.																														.	.	.	.
Template Conservation											.
Template Sequence		Q	E	M	H	E	K	V	F	D	.	H	Y	D	A	V	T	A	G	E	I	F	G	A	P	L	N	Q	V	P	L	F	I	D	S	R	R	K	E	L	D	M	A	F	T	F	D	L	I	R	Y	D	R	A	L	D	R	W	H	T	I	P	R	T	L	A	D	F	R	Q	T	I	D	K	V	D	A	I	A	G	E
Template Known Secondary structure								T	G	G	.	G	S										S			G	G	G							G	G	G		S		S					S	T	T	T	T	T	T	B		T	T	S	S		B																				T	T
Template Predicted Secondary structure											.
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.	.		.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580
Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.
Template Sequence		Y	G	W	N	T	F	F	L	G	N	H	D	N	P	R	.	.	.	.	A	V	S	H	F	G	D	D	R	P	Q	W	R	E	A	S	A	K	A	L	A	T	V	T	L	T	Q	R	G	T	P	F	I	F	Q	G	D	E	L	G	M	T	N	Y	P	F	K	T	L	Q	D	F	D	D	I	E	V	K	G	F	F
Template Known Secondary structure		T			B				S			T	T	S			.	.	.	.						S			S	T	T	T													T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T								S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.
Template SS confidence
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330					.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
																												581	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	D	Y	V	E	T	G	K	A	T	A	E	E	L	L	T	N	V	A	L	T	S	R	D	N	A	R	T	P	F	Q	W	D	D	S	A	N	A	G	F	T	T	G	K	P	W	L	K	V	N	P	N	Y	T	E	I	N	A	A	R	E	I	G	D	P	K	S	V	Y	S	F	Y	R	N	L	I	S	I	R	H
Template Known Secondary structure					T	T	T	T	S	S														G	G	G	G	T	S					S	S	S	G	G	G	G	S		S	S			S	S				G	G	G	G	T	S							T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
		612	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	N	E	I	I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.																			.																.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.																			.																.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	T	P	A	L	S	T	G	S	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	D	I	D	P	S	N	A	D	V	Y	A	Y	T	R	S	Q	D	G	.	E	T	Y	L	V	V	V	N	F	K	A	E	P	R	S	.	.	.	F	T	L	P	D	G	M	H	I	A	E	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T		T					S				.	.	.	.	.	.	.		S		T	T		S	S									T	T	.										S	S	S				.	.	.					T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.																			.																.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.								.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500		.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.				.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.
		692	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V	R	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	I	E	S	S	S	P	A	A	P	A	A	G	A	A	S	L	E	L	Q	P	W	Q	S	G	I	Y	K	V	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.				S		S	S				T	T		S						T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								529	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.