Job Description P07762 Confidence 91.73% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 283 Aligned Residues 365 % Identity 15% Template c1xc6A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-galactosidase; PDBTitle: native structure of beta-galactosidase from penicillium sp. in complex2 with galactose Resolution 2.10 Å

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		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310				.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.
Query Sequence		D	Q	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	.	.	.	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F
Query Conservation																																											.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	D	I	F	E	K	V	K	A	L	G	F	N	C	V	S	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	V	D	W	A	L	L	E	G	N	P	G	H	Y	S	A	E	G	I	F	D	L	Q	P	F	F	D	A	A	K	E	A	G	I	Y	L	L	A	R	P	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									S	B	T	T	B					G	G	G		S											T									S	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.														.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370				.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.
Query Sequence		A	L	A	E	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	.	.	.	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I
Query Conservation																										.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	I	N	A	E	V	S	G	G	G	F	P	G	W	L	Q	R	V	D	G	I	L	R	T	S	D	E	A	Y	L	K	A	T	D	N	Y	A	S	N	I	A	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	K	A	Q	I	T	N	G	G	P	I	I	L	Y	Q	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	B	G	G	G	G			G	G	G	G	G		S	S		T	T	S	S																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	B	G	G	G	T	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180											.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
		424	.	.	.	.	.	430					.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.
Query Sequence		P	N	E	F	G	G	R	.	.	.	.	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y
Query Conservation									.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	N	E	Y	S	G	A	C	C	G	Y	N	G	F	P	D	G	S	Y	M	Q	Y	I	E	D	H	A	R	D	A	G	I	V	V	P	F	I	S	N	D	A	W	A	A	G	H	N	A	P	G	T	G	A	G	A	V	D	I	Y	G	H	D	S	Y	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S					B		T	T					S															T	T			S		B	B			B	S	S	S	S		T	T		T	T	S		T	T			S	B							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.										.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.										.	560	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	F	P
Query Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	L	G	F	D	C	A	N	P	S	T	W	P	S	G	N	L	P	T	Y	F	H	T	S	H	E	Q	Q	S	P	S	T	P	Y	S	L	V	E	F	Q	G	G	A	F	D	P	W	G	G	V	G	F	A	K	C	A	A	L	L	N	H	E	F	E	R	V	F	Y	K	N	D	F	S	F	G	V	A	F	L
Template Known Secondary structure		.	.	T		S			S	S	T	T				T	T		S													T	T	S									S						T	T											T	S													T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
		562	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.		.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640
Predicted Secondary structure																																						.
Query SS confidence																																						.
Query Sequence		G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	.	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I
Query Conservation																																						.
Alig confidence																																						.																																.
Template Conservation																																																																						.
Template Sequence		N	L	Y	M	I	F	G	G	T	N	W	G	N	L	G	H	P	G	G	Y	T	S	Y	D	Y	G	S	A	I	S	E	S	R	N	I	T	R	E	K	Y	S	E	L	K	L	L	G	N	F	A	K	V	S	P	G	Y	L	V	A	N	P	G	D	L	S	T	S	T	.	Y	T	N	T	A	D	L	T	V	T	P
Template Known Secondary structure										B			T	T		B		T	T	S		S	B			T	T		S	B		T	T	S				S															T		G	G	G	T	T	S						B	S	S	S	.	S	B	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																						.
Template SS confidence
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.		.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		641	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	V	R	R	D	K	E	G	N	E	I	I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	L	G	S	N	S	S	A	S	S	F	F	V	I	R	H	S	D	Y	S	S	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	E	Y	K	L	T	V	P	T	S	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	T	I	P	Q	L	G	G
Template Known Secondary structure					S	S	T	T	S									S	S	T	T				.	.	.	.	.	.	.	.											T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T	S
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.									.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	460	.	.	.	.
		721	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	W	L	V	R	E	A	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	L	T	L	S	G	R	D
Template Known Secondary structure							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		465	.	.	.	.	470	.	.