Job Description P07762 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 28 Aligned Residues 449 % Identity 16% Template c1uokA_ PDB info PDB header:glucosidase Chain: A: PDB Molecule:oligo-1,6-glucosidase; PDBTitle: crystal structure of b. cereus oligo-1,6-glucosidase Resolution 2.00 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	Q	F	D	A	P	I	S	I	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	R	H	T	D	N	N	F	W	L	S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D
Query Conservation
Alig confidence																				.																		.																								.
Template Conservation																				.																		.																								.
Template Sequence		K	Q	W	W	K	E	S	V	V	Y	Q	I	Y	P	R	S	F	M	.	D	S	N	G	D	G	I	G	D	L	R	G	I	I	S	K	L	.	D	Y	L	K	E	L	G	I	D	V	I	W	L	S	P	V	Y	E	S	P	N	D	D	.	N	G	Y	D	I	S	D	Y	C	K	I	M	N	E	F	G	T	M	E
Template Known Secondary structure															G	G	G	T		.		S	S	S	S	S	S								T	T		.							T															T	T	.	T	T	S	S		S							G	G	G
Template Predicted Secondary structure																				.																		.																								.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20		.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.		.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.							.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	D	G	T	.	.	.	.	.	.	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	W	D	E	L	L	H	E	M	H	E	R	N	M	K	L	M	M	D	L	V	V	N	H	T	S	D	E	H	N	W	F	I	E	S	R	K	S	K	D	N	K	Y	R	D	Y	Y	I	W	R	P	G	K	E	G	K	E	P	N	N	W	G	A	A	F	S	G	S	A	W	Q	Y	D	E	M	T	D	E	Y	Y
Template Known Secondary structure													T	T										S	B			T	T	S							T	T		T	T		T	T	G	G	G	B						S	S	S	S		S	S		B	B		T	T	S	S	B	S					T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
								371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.					.	.	.	.	.	.	440
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																																																.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																																																																.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	.	.	.	.	E	A	I	E	F	L	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																																																																.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																									.																																							.	.	.	.
Template Conservation																																.
Template Sequence		L	H	L	F	S	K	K	Q	P	D	L	N	W	D	N	E	K	V	R	Q	D	V	Y	E	M	M	K	F	W	L	.	E	K	G	I	D	G	F	R	M	D	V	I	N	F	I	S	K	E	E	G	L	P	T	V	E	T	E	E	E	G	Y	V	S	G	H	K	H	F	M	N	G	P	N	I	H	K	Y	L	H
Template Known Secondary structure				S	S		T	T	S		B	B		T	T	S																.		T	T							T	T	G	G	G	S				T	T									S	S		B			G	G	G	T	T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure																																.
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
		441	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470		.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500						.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.																															.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.																															.	.	.	.	.
Query Sequence		N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	.	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R	.	.	.	.	.	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N
Query Conservation																																.																															.	.	.	.	.
Alig confidence										.																						.																															.	.	.	.	.
Template Conservation										.
Template Sequence		E	M	N	E	E	V	L	S	.	H	Y	D	I	M	T	V	G	E	M	P	G	V	T	T	E	E	A	K	L	Y	T	G	E	E	R	K	E	L	Q	M	V	F	Q	F	E	H	M	D	L	D	S	G	E	G	G	K	W	D	V	K	P	C	S	L	L	T	L	K	E	N	L	T	K	W	Q	K	A	L	E	H
Template Known Secondary structure							T	G	G	.	G	S									T	T												G	G	G		S		S						G	G	G	S	T	T			T	T																								T	S	S
Template Predicted Secondary structure										.
Template SS confidence
		239	240	.	.	.	.	.	.		.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H	D	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	G	W	N	S	L	Y	W	N	N	H	D	Q	P	R	.	.	.	.	.	V	V	S	R	F	G	N	D	G	M	Y	R	I	E	S	A	K	M	L	A	T	V	L	H	M	M	K	G	T	P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N	V	R	F	E	S	I	D	E	Y	R	D	I	E	T	L	N	M	Y
Template Known Secondary structure		S	S						S			T	T	S			.	.	.	.	.					T	S		S	S	T	T														T	S	S	S						T	T	G	G	G	T							S	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.						.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
																															584	.	.	.	.	.	590	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	W	H	L	L	E	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	E	K	V	M	E	R	G	E	D	I	E	K	V	M	Q	S	I	Y	I	K	G	R	D	N	A	R	T	P	M	Q	W	D	D	Q	N	H	A	G	F	T	T	G	E	P	W	I	T	V	N	P	N	Y	K	E	I	N	V	K	Q	A	I	Q	N	K	D	S	I	F	Y	Y	Y	K	K	L	I	E	L	R	K
Template Known Secondary structure							T	S																G	G	G	G	T	S						S	S	T	T	T	T	S		S	S			S	S				G	G	G	G	T	S	S								T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
		612	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	N	E	I	I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.																			.																.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.																			.																.
Template Sequence		N	N	E	I	V	V	Y	G	S	Y	D	.	.	.	.	.	.	.	L	I	L	E	N	N	P	S	I	F	A	Y	V	R	T	Y	G	V	.	E	K	L	L	V	I	A	N	F	T	A	E	E	C	I	.	F	E	L	P	E	D	I	S	Y	S	E	V	E	L	L	I	H	N	Y	D	V	E	N	G	P	I	E
Template Known Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.			S	T	T		S	S									T	T	.										S	S	S				.					T	T				S								S	S								S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.																			.																.
Template SS confidence
		473	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.								.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.		.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.		.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.
		692	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	T	L	R	P	Y	E	A	M	V	F	K
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		544																					.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.