Job Description P07762 Confidence 98.78% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 117 Aligned Residues 324 % Identity 12% Template c1uasA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of rice alpha-galactosidase Resolution 1.50 Å

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		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.						.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.				.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.																					.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.																					.	.	.
Query Sequence		S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	A	K	W	.	.	.	.	.	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	G	S	W	.	.	.	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D
Query Conservation																	.	.	.	.	.																					.	.	.
Alig confidence											.						.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.														.
Template Conservation											.																			.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template Sequence		N	E	Q	I	I	R	E	T	A	.	D	A	L	V	N	T	G	L	A	K	L	G	Y	Q	Y	V	N	I	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	C	W	A	E	Y	S	R	D	S	Q	G	N	F	V	P	N	R	Q	.	T	F	P	S	G	I	K	A	L	A	D	Y	V	H	A	K	G	L	K	L	G	I	Y
Template Known Secondary structure											.						T	S					T							.	.	.	.	.	.	.	.		S	S		B		S	S			T	T	S				B		T	T	.	T		T	T												T	T
Template Predicted Secondary structure											.																			.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template SS confidence
		24	.	.	.	.	.	30	.	.		.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50									.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70		.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
		336	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	Q	T	C	S	N	K	M	P	G	S	L	D	H	E	E	Q	D	V	K	T	F	A	S	W	.	G	V	D	Y	L	K	Y	D	N	C	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	B		T	T	S	S	S	B			T	T													.	T										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.											.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		94	.	.																																	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.		.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
		416	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.		.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.
Query SS confidence																																										.
Query Sequence		S	R	K	E	G	E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	.	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K
Query Conservation																																										.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	D	A	G	R	S	V	M	E	R	Y	T	R	M	S	N	A	M	K	T	Y	G	K	N	I	F	F	S	L	C	E	W	G	K	E	N	P	A	T	W	A	G	R	M	G	N	S	W	R	T	T	G	D	I	A	D	N	W	G	S	M	T	S	R	A	D	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T																			T	T	S						S	T	T	T	T		G	G	G	T	G	G	G	T		S					S	S				S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template Sequence		N	.	.	.	.	.	.	D	Q	W	A	A	Y	A	G	P	G	G	W	N	D	P	D	M	L	E	V	G	N	G	G	M	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	E	Y	R	S	H	F	S	I	W	A	L	A	K	A	P	L	L	I	G	C	D	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.		T	T	G	G	G		B	T	T	B									T	T	S	S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T							S		.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template SS confidence
		200							.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		575	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.			.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.
Query SS confidence																															.	.
Query Sequence		G	R	E	W	N	H	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	.	.	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	N	E	I	I
Query Conservation																															.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	R	S	M	S	Q	Q	T	K	N	I	L	S	N	S	E	V	I	A	V	N	Q	D	S	L	G	V	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	K	V	Q	S	D	N	G	L	E	V	W	A	G	P	L	S	N	N	R	K	A	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S										T									T		T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T									S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.												.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
		653	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V
Query Conservation
Alig confidence													.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	W	N	R	Q	S	Y	Q	A	T	.	I	T	A	H	W	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	I	G	L	A	G	S	V	A	V	T	A	R	D	L	W	A	H	S	S	F	A	A	Q	G	Q	I	S	A	S	V	A	P	H	D	C	K	M	Y	V
Template Known Secondary structure							S	S	S				.					G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	T			T	T								T	T	T	T							S								T	T
Template Predicted Secondary structure													.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.		.	.	.	.	.	.															.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.