Job Description P07762 Confidence 98.07% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 135 Aligned Residues 327 % Identity 15% Template c1r46B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alpha-galactosidase a; PDBTitle: structure of human alpha-galactosidase Resolution 3.25 Å

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		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.		.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.				.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
Predicted Secondary structure													.																								.	.	.
Query SS confidence													.																								.	.	.
Query Sequence		Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	.	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	G	S	W	.	.	.	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H
Query Conservation													.																								.	.	.
Alig confidence													.												.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.															.																										.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.																						.																										.	.
Template Sequence		F	M	E	M	A	E	L	M	V	S	E	G	W	K	D	A	G	Y	E	Y	L	C	I	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	C	W	M	A	P	Q	R	D	S	E	G	R	L	Q	A	D	P	Q	R	.	F	P	H	G	I	R	Q	L	A	N	Y	V	H	S	K	G	L	K	L	G	I	Y	A	D	V	.	.
Template Known Secondary structure												T	T					T							.	.	.	.	.	.	.	.		S	S		B		S	S			T	T	S				B		T	T	T	.		T	T	T	T	T									T	T									S	.	.
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.																						.																										.	.
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.									.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.		.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	K	T	C	A	G	F	P	G	S	F	G	Y	Y	D	I	D	A	Q	T	F	A	D	W	.	G	V	D	L	L	K	F	D	G	C	Y	C	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	B		T	T	S	S	B			T	T	T												.	T										S		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																	138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.		.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.									.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	E	N	L	A	D	G	Y	K	H	M	S	L	A	L	N	R	T	G	R	S	I	V	Y	S	C	E	W	P	L	Y	M	W	P	F	Q	K	P	N	Y	T	E	I	R	Q	Y	C	N	H	W	R	N	F	A	D	I	D	D	S	W	K	S	I	K	S	I	L	D	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																				S													T	T	T	S								T	T	T		S					S					S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	K	L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.
Template Sequence		T	S	F	N	Q	E	R	I	V	D	V	A	G	P	G	G	W	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P	D	M	L	V	I	G	N	F	G	L	S	W	N	Q	Q	V	T	Q	M	A	L	W	A	I	M	A	A	P	.	.	.	.	L	F	M	S	N	D	L
Template Known Secondary structure				T	T	T	T	T						B	T	T	B			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					B		T	T	S	S	S	S															T	T			.	.	.	.					S		T
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.					.	.	.	.	.	.	300
		573	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.			.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650
Predicted Secondary structure																																	.	.
Query SS confidence																																	.	.
Query Sequence		A	Q	G	R	E	W	N	H	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	.	.	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	N	E
Query Conservation																																	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	H	I	S	P	Q	A	K	A	L	L	Q	D	K	D	V	I	A	I	N	Q	D	P	L	G	K	Q	G	Y	Q	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	D	N	F	E	V	W	E	R	P	L	S	G	L	A	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S																			T		T	T									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	S									S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																						301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.												.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		651	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.								.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	.	.	.	.	.	.	.	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L
Query Conservation																																																												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	V	A	M	I	N	R	Q	E	I	G	G	P	.	R	S	Y	T	I	A	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	G	K	G	V	A	C	N	P	A	C	F	I	T	Q	L	L	P	V	K	R	K	L	G	F	Y	E	W	T	S	R	L	R	S	H	I	N	P	T	G	T	V	L	L
Template Known Secondary structure											S	S	S		.							S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	B	T	T	T	B	S	S	S									S	S									S	S									T	T
Template Predicted Secondary structure															.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.		.	.	.	.	.	.	.	370														.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
		724
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		416