Job Description P07762 Confidence 98.48% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 124 Aligned Residues 335 % Identity 16% Template c1ktbA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-n-acetylgalactosaminidase; PDBTitle: the structure of alpha-n-acetylgalactosaminidase Resolution 1.90 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.		.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.				.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
Predicted Secondary structure													.																								.	.	.
Query SS confidence													.																								.	.	.
Query Sequence		Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	.	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	G	S	W	.	.	.	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H
Query Conservation													.																								.	.	.
Alig confidence													.												.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.														.																											.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.																					.																											.	.
Template Sequence		F	M	E	M	A	D	R	I	A	E	D	G	W	R	E	L	G	Y	K	Y	I	N	I	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	C	W	A	A	K	Q	R	D	A	E	G	R	L	V	P	D	P	E	.	R	F	P	R	G	I	K	A	L	A	D	Y	V	H	A	R	G	L	K	L	G	I	Y	G	D	L	.	.
Template Known Secondary structure												S	S					T							.	.	.	.	.	.	.	.		S	S		B		S	S			T	T	S				B		T	T	.	T		T	T											T	T	T									B	.	.
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.																					.																											.	.
Template SS confidence
		38	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60									.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80		.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	L	T	C	G	G	Y	P	G	T	T	L	D	R	V	E	Q	D	A	Q	T	F	A	E	W	.	G	V	D	M	L	K	L	D	G	C	Y	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	B		T	T	S	S	B		B		G	G	G												.	T									T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																107	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.		.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	E	Q	A	Q	G	Y	P	Q	M	A	R	A	L	N	A	T	G	R	P	I	V	Y	S	C	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	P	A	Y	Q	G	G	L	P	P	K	V	N	Y	T	L	L	G	E	I	C	N	L	W	R	N	Y	D	D	I	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		T	T	S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	S	S	T	T	T											S					S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.												.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H
Query Conservation
Alig confidence																																																											.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	S	W	D	S	V	L	S	I	V	D	W	F	F	T	N	Q	D	V	L	Q	P	F	A	G	P	G	H	W	N	D	P	D	M	L	I	I	G	N	F	G	L	S	Y	E	Q	S	R	S	Q	M	A	L	W	T	I	M	.	.	.	.	A	A	P	L	L	M	S	T	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S														T	G	G	G	T	G	G	G		B	T	T	B							B		T	T	S	S	S																T	.	.	.	.	T							S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260					.	.	.	.	.	.	.	.	.
		581	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.			.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.
Query SS confidence																									.	.
Query Sequence		D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	.	.	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	N	E	I	I	V	A	S	N	F	T
Query Conservation																									.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R	T	I	S	P	S	A	K	K	I	L	Q	N	R	L	M	I	Q	I	N	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	G	I	Q	G	R	R	I	I	K	E	G	S	H	I	E	V	F	L	R	P	L	S	Q	A	A	S	A	L	V	F	F	S	R	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T										T									T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T											T	T	S									S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.											.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
		659	660	.	.	.	.	.	.	.	.						.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.
Query Sequence		P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	.	.	.	.	.	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V
Query Conservation												.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template Sequence		T	D	M	P	F	R	Y	T	T	S	L	A	K	L	G	F	P	M	G	A	A	Y	E	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	D	V	Y	S	G	K	I	I	S	G	L	K	T	.	.	.	.	.	G	D	N	F	T	V	I	I	N	P	S	G	V	V	M	W	Y
Template Known Secondary structure		S	S	S												T			T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T									T	.	.	.	.	.	T	S								T	T
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.												.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.						.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.