Job Description P07762 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 510 % Identity 19% Template c1jibA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:neopullulanase; PDBTitle: complex of alpha-amylase ii (tva ii) from thermoactinomyces2 vulgaris r-47 with maltotetraose based on a crystal soaked3 with maltohexaose. Resolution 3.30 Å

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		135	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.			.	.	.	150	.	.	.		.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.							.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.								.																					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.								.																					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	T	G	T	R	F	S	V	W	A	P	N	.	.	A	R	R	V	S	V	V	.	G	Q	F	N	Y	W	D	G	R	R	H	P	M	R	L	R	K	E	S	G	.	.	.	.	.	.	I	W	E	L	F	I	P	G	A	H	N	G	Q	L	Y	K	Y	E	M	I	D	A	N	G	N	L	R	L	K	S	D	P
Query Conservation														.	.								.																					.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.								.																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	T	Q	L	R	V	R	L	R	A	K	K	G	D	V	V	R	C	E	V	L	Y	A	D	R	Y	A	S	P	E	E	E	L	A	H	A	L	A	G	K	A	G	S	D	E	R	F	D	Y	F	E	A	L	L	E	C	S	T	K	R	V	K	Y	V	F	L	L	T	G	P	Q	G	E	A	V	Y	F	G	E	T
Template Known Secondary structure		T	T										T	T	T		S									T	T			S	S	S														S	S											T	T	S											T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.																				.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	A	F	E	A	Q	M	R	P	E	T	A	S	L	I	C	G	L	P	E	K	V	V	Q	T	E	E	R	K	K	A	N	Q	F	D	A	P	I	S	I	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	R	H	T	D	N	N	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	Y	R
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	F	S	A	E	R	S	K	A	G	V	F	Q	Y	.	.	.	.	.	.	A	Y	I	H	R	S	E	V	F	T	T	P	E	W	A	K	E	A	V	I	Y	Q	I	F	P	E	R	F	A	N	G	D	P	S	N	D	P	P	G	T	E	Q	W	A	K	D	A	R	P	R	H	D	S	F	Y	G	G	D	L	K
Template Known Secondary structure					S	S	T	T	T	T						.	.	.	.	.	.					G	G	G	S									T								G	G	G	T					T	T	T			T	T						T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.							.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F
Query Conservation
Alig confidence								.																						.	.
Template Conservation								.																						.	.
Template Sequence		G	V	I	D	R	L	.	P	Y	L	E	E	L	G	V	T	A	L	Y	F	T	P	I	F	A	S	P	S	.	.	H	H	K	Y	D	T	A	D	Y	L	A	I	D	P	Q	F	G	D	L	P	T	F	R	R	L	V	D	E	A	H	R	R	G	I	K	I	I	L	D	A	V	F	N	H	A	G	D	Q	F	F
Template Known Secondary structure						T		.							T		S											S	S	.	.	S	S			S		S							T	T	T															T	T	T										S	B			T	T	S
Template Predicted Secondary structure								.																						.	.
Template SS confidence
		174	.	.	.	.	.		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200			.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
		347	.	.	350	.								.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370											.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	A	E	F	.	.	.	.	.	.	.	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Template Conservation																																																																			.
Template Sequence		A	F	R	D	V	L	Q	K	G	E	Q	S	R	Y	K	D	W	F	F	I	E	D	F	P	V	S	K	T	S	R	T	N	Y	E	T	F	A	V	Q	V	P	A	M	P	K	L	R	T	E	N	P	E	V	K	E	Y	L	F	D	V	A	R	F	W	M	.	E	Q	G	I	D	G	W	R	L	N	V	A	N	E
Template Known Secondary structure										G	G	G		T	T	G	G	G	S		B		S	S	S				S	S	S		S	B		B	S	S	S	S		T	T		B	B			T	T	S																.	T	T	T							T	T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																																			.
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.		.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Template Sequence		V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	H	A	F	W	R	E	F	R	R	L	V	K	S	L	N	P	D	A	L	I	V	G	E	I	W	H	D	A	S	G	W	L	M	.	.	.	.	.	G	D	Q	F	D	S	V	M	N	Y	L	F	R	E	S	V
Template Known Secondary structure		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T								S	S			T	T	T	T	T	.	.	.	.	.	T	T	S		S			B
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		330																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.						.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
		490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.					.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.
Query Sequence		L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	E	N	.	.	.	.	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L
Query Conservation																															.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.										.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template Sequence		I	R	F	F	A	T	G	E	I	H	A	E	R	F	D	A	E	L	T	R	A	R	M	L	Y	P	E	Q	A	A	Q	G	L	W	N	L	L	D	S	H	D	T	.	.	.	.	.	E	R	F	L	T	S	C	G	G	N	E	.	.	.	.	A	K	F	R	L	A	V	L	F	Q	M	T	Y	L	G	T	P	L
Template Known Secondary structure						T	S			S														T	T	S						T	T					S			T	T	S	.	.	.	.	.							T	T	T			.	.	.	.											T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template SS confidence
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.						.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.					.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
		566	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.			.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.
Query SS confidence																				.	.
Query Sequence		L	F	M	G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H	D	A	S	.	.	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R
Query Conservation																				.	.
Alig confidence																				.	.					.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	Y	Y	G	D	E	I	G	M	A	G	A	T	D	P	D	C	R	R	P	M	I	W	E	.	.	.	.	E	K	E	Q	N	R	G	L	F	E	F	Y	K	E	L	I	R	L	R	H	R	L	A	S	L	T	R	G	N	V	R	.	.	.	.	.	.	S	W	H	A	D	K	Q	A	N	L	Y	A	F	V	R
Template Known Secondary structure				T	T	G	G	G	T					S	T	T	T	T								.	.	.	.	G	G	G	S																			T									.	.	.	.	.	.						T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.					.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.							.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.
		644	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.		.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.
Predicted Secondary structure																						.
Query SS confidence																						.
Query Sequence		R	D	K	E	G	N	E	I	I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	.	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W
Query Conservation																						.
Alig confidence						.																.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	V	Q	D	.	Q	H	V	G	V	V	L	N	N	R	G	E	K	Q	T	V	L	L	Q	V	P	E	S	G	G	K	T	W	L	D	C	L	T	G	E	E	V	H	G	K	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	L	K	L	T	L	R	P	Y	Q	G	M	I
Template Known Secondary structure				T	T	.										S	S	S										T	T	S		S					T	T	S								T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T								T	T
Template Predicted Secondary structure						.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		522	.	.	.		.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580
		723
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		581