Job Description P07762 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 24 Aligned Residues 427 % Identity 19% Template c1jgiA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:amylosucrase; PDBTitle: crystal structure of the active site mutant glu328gln of2 amylosucrase from neisseria polysaccharea in complex with3 the natural substrate sucrose Resolution 2.00 Å

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		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.		.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.
Query SS confidence																																																													.
Query Sequence		F	D	A	P	I	S	I	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	R	H	T	D	N	N	F	W	L	S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	G	S	.	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D
Query Conservation																																																													.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.											.																									.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Sequence		L	S	N	K	Q	V	G	G	V	C	Y	V	D	L	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	L	K	G	L	K	D	K	I	.	P	Y	F	Q	E	L	G	L	T	Y	L	Y	L	M	P	L	F	K	C	P	E	G	K	S	D	G	G	Y	A	V	S	S	Y	R	D	V	N	P	A	L	G	T	I	G	D
Template Known Secondary structure		G		T	T													.	.	.	.	.	.	.	.	S	S							T		.							T		S								B				S	S		S	T	T	T	T	S		S		S	S	S	B		T	T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template SS confidence
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.									110	.	.	.	.	.	.	.	.	.		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	R	E	V	I	A	A	L	H	E	A	G	I	S	A	V	V	D	F	I	F	N	H	T	S	N	E	H	E	W	A	Q	R	C	A	A	G	D	P	L	F	D	N	F	Y	Y	I	F	P	D	R	R	M	P	D	Q	Y	D	R	T	L	R	E	I	F	P	D	Q	H	P	G	G	F	S	Q	L	E	D	G	R
Template Known Secondary structure												T	T										S				T	T	S									T		G	G	G	T	T	S	B				S	S	S								T	S				S		T	T	T		S	T	T					T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	E	G	Y	H	Q	D	W	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T
Query Conservation
Alig confidence																																		.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	V	W	T	T	F	N	S	F	Q	W	D	L	N	Y	S	N	P	W	V	F	R	A	M	A	G	E	M	L	F	L	A	.	N	L	G	V	D	I	L	R	M	D	A	V	A	F	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	K	Q	M	G	T	S	C	E	N	L	P	Q	A	H	A	L	I	R	A	F
Template Known Secondary structure						S	S		T	T				B		T	T	S																.	T	T	T								T	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																		.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.		.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.												.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
		443	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	E	N	F	V	L	P
Query Conservation
Alig confidence																														.	.																									.
Template Conservation																														.	.																									.
Template Sequence		N	A	V	M	R	I	A	A	P	A	V	F	F	K	S	Q	A	I	V	H	P	D	Q	V	V	Q	Y	I	.	.	G	Q	D	E	C	Q	I	G	Y	N	P	L	Q	M	A	L	L	W	N	T	L	A	T	R	.	E	V	N	L	L	H	Q	A	L	T	Y	R	H	N	L	P	E	H	T	A	W	V	N	Y	V
Template Known Secondary structure										T	T									S						G	G	G	B	.	.	S	T	T	S	B	S																			.												S					T	T							S
Template Predicted Secondary structure																														.	.																									.
Template SS confidence
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340			.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.		.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		523	.	.	.	.	.	.	530																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	S	H	D	E	V	V	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	S	H	D	D	I	G	W	T	F	A	D	E	D	A	A	Y	L	G	I	S	G	Y	D	H	R	Q	F	L	N	R	F	F	V	N	R	F	D	G	S	F	A	R	G	V	P	F	Q	Y	N	P	S	T	G	D	C	R	V	S	G	T	A	A	A	L	V	G	L	A	Q	D	D	P	H	A	V	D	R	I	K
Template Known Secondary structure				S	S		B												T	T															T	T		S	T	T												T	T	T														T	T	T	T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		552	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580															.	.	.	.	.	.	.	.	.	590				.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.
Query Sequence		A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	.	.	.	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	Y	S	I	A	L	S	T	G	G	L	P	L	I	Y	L	G	D	E	V	G	T	L	N	D	D	D	W	S	Q	D	S	N	K	S	D	D	S	R	W	A	H	R	P	R	Y	N	E	A	L	Y	A	Q	R	N	D	P	S	T	A	A	G	Q	I	Y	Q	D	L	R	H	M	I	A	V	R	Q	S	N	P
Template Known Secondary structure										S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	S	G	G	G		T	T	T	T	T		G	G	G	G	G										T	T	T	T		T	T	S																				G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		615	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.			.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.
Query SS confidence																																																												.	.
Query Sequence		A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	N	E	I	I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	.	.	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G
Query Conservation																																																												.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.																	.									.	.																	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.																	.																											.	.	.	.
Template Sequence		R	F	D	G	G	R	L	V	.	.	.	.	.	.	.	T	F	N	T	N	N	K	H	I	I	G	Y	I	R	.	.	.	.	N	N	A	L	L	A	F	G	N	F	S	E	Y	P	Q	T	.	V	T	A	H	T	L	Q	A	M	P	F	K	A	H	D	L	I	G	G	K	T	V	S	L	N	Q	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G		S	S				.	.	.	.	.	.	.					S		T	T							.	.	.	.	T	T	T								S	S	S				.			T	T	T	T	T	T	S		S					T	T	T						S	S	S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.																	.																											.	.	.	.
Template SS confidence
		550	.	.	.	.	.	.	.								.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.					.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.		.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.
		693	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	T	L	Q	P	Y	Q	V	M	W	L	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																					614	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.