Job Description P07762 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 514 % Identity 18% Template c1gviA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:maltogenic amylase; PDBTitle: thermus maltogenic amylase in complex with beta-cd Resolution 3.3 Å

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		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.							.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.				.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Query Sequence		T	R	F	S	V	W	A	P	N	A	R	R	V	S	V	V	.	.	.	.	.	.	G	Q	F	N	Y	W	D	G	R	R	H	P	M	R	L	R	K	E	S	G	.	.	.	I	W	E	L	F	I	P	G	A	H	N	G	Q	L	Y	K	Y	E	M	I	D	A	N	G	N	L	R	L	K	S	D	P	Y	A	F
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.																					.	.	.																													.	.
Template Conservation																																																																											.	.
Template Sequence		L	R	L	Q	T	K	K	N	D	V	D	H	V	E	L	L	F	G	D	P	Y	E	W	H	D	G	A	W	Q	F	Q	T	M	P	M	R	K	T	G	S	D	G	L	F	D	Y	W	L	A	E	V	K	P	P	Y	R	R	L	R	Y	G	F	V	L	R	A	G	G	E	K	L	V	Y	.	.	T	E	K	G	F
Template Known Secondary structure								T	T	T		S									T	T				T	T																S	S											T	T	S											T	T						.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.
Template SS confidence
		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.			.	.	100	.	.
		209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	270
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	A	Q	M	R	P	E	T	A	S	L	I	C	G	L	P	E	K	V	V	Q	T	E	E	R	K	K	A	N	Q	F	D	A	P	I	S	I	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	R	H	T	D	N	N	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	L	S	Y	R	E	L	A	D
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.
Template Sequence		Y	H	E	A	P	S	D	D	T	A	Y	Y	F	C	.	.	F	P	F	L	H	R	V	D	L	F	Q	A	P	D	W	V	K	D	T	V	W	Y	Q	I	F	P	E	R	F	A	N	G	N	P	A	I	S	P	K	G	A	R	P	W	G	S	E	D	P	T	P	T	S	F	F	G	G	D	L	Q	G	I	I	D
Template Known Secondary structure			S	S				S		S	T	T	S			.	.						S	S	S						G	G	G	G	T								G	G	G	T				S					S	S			S				S	S				S	S
Template Predicted Secondary structure																.	.
Template SS confidence
		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.			.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	L	V	P	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	H	P	F	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E
Query Conservation
Alig confidence				.																						.	.
Template Conservation				.																						.	.
Template Sequence		H	L	.	D	Y	L	A	D	L	G	I	T	G	I	Y	L	T	P	I	F	R	A	P	S	.	.	N	H	K	Y	D	T	A	D	Y	F	E	I	D	P	H	F	G	D	K	E	T	L	K	T	L	V	K	R	C	H	E	K	G	I	R	V	M	L	D	A	V	F	N	H	C	G	Y	E	F	A	P	F	Q	D
Template Known Secondary structure		T		.							T										B	S		S	S	.	.	S	S	T	T	S		S		T	T	S	B		T	T	T																	T										S	B			T	T
Template Predicted Secondary structure				.																						.	.
Template SS confidence
		181	.		.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.			.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
															351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.				.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	G	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	N	T	L	.	.	.	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.																																						.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		V	L	K	N	G	A	A	S	R	Y	K	D	W	F	H	I	R	E	F	P	L	Q	T	E	P	R	P	N	Y	D	T	F	A	F	V	P	H	M	P	K	L	N	T	A	H	P	E	V	K	R	Y	L	L	D	V	A	T	Y	W	I	R	E	F	D	I	D	G	W	R	L	D	V	A	N	E	I	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						G	G	G		T	T	G	G	G	B		B	S	S	S	S				S	S	S		S	B		B	S	S	S		T	T	S	B	B	B		T	T	S																		S								T	T	G	G	G	S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	S	R	K	E	G	E	W	I	P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	H	Q	F	W	R	E	F	R	Q	A	V	K	A	L	K	P	D	V	Y	I	L	G	L	I	W	H	D	A	M	P	W	L	R	.	.	.	.	.	G	D	Q	F	D	A	V	M	N	Y	P	L	A	D	A	A	L	R	F	F	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T								S	S			T	T	T	T	T	.	.	.	.	.	T	T	S		S			B													T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
																						334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.						.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
		495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.					.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.
Query Sequence		L	D	P	V	Y	R	Q	Y	H	H	D	K	L	T	F	G	I	L	Y	N	Y	T	E	.	.	.	.	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N
Query Conservation																									.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.											.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template Sequence		K	E	D	M	S	A	S	E	F	A	D	R	L	M	H	V	L	H	S	Y	P	K	Q	V	N	E	A	A	F	N	L	L	G	S	H	D	T	.	.	.	.	.	P	R	L	L	T	V	C	G	G	D	V	.	.	.	.	R	K	V	K	L	L	F	L	F	Q	L	T	F	T	G	S	P	C	I	Y	Y	G	D
Template Known Secondary structure		S			S														T	T	S							T		B		B	S			S	S	S	.	.	.	.	.								T	T			.	.	.	.												T	S	S	S						T	T	G
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template SS confidence
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.						.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.					.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		571	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.			.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.
Query SS confidence															.	.
Query Sequence		E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H	D	A	S	.	.	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G
Query Conservation															.	.
Alig confidence															.	.					.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.																			.
Template Conservation																					.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.																			.
Template Sequence		E	I	G	M	T	G	G	N	D	P	E	C	R	K	C	M	V	W	D	.	.	.	.	P	E	K	Q	N	K	E	L	Y	E	H	V	K	Q	L	I	A	L	R	K	Q	Y	R	A	L	R	R	G	D	V	A	F	.	.	.	.	.	.	L	T	A	D	D	E	V	N	H	L	V	Y	A	K	T	D	G	N	.
Template Known Secondary structure		G	G	T					S	T	T	G	G	G							.	.	.	.	T	T	T	S																	T							S	B			B	.	.	.	.	.	.				S	S		T	T									T	T	.
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.																			.
Template SS confidence
		460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.					.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510							.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.
		649	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	E	I	I	V	A	S	N	F	T	P	V	P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V	R	E	A
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	T	V	M	I	I	I	N	R	S	N	E	A	A	E	I	P	M	P	I	D	A	R	G	K	W	L	V	N	L	L	T	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	F	A	A	E	A	E	T	L	C	V	S	L	P	P	Y	G	F	V	L	Y	A	V	E	S
Template Known Secondary structure											S	S	S										T	T							T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	S								T	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		529	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.