Job Description P21170 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:37:56 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 346 % Identity 17% Template c3n29A_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:carboxynorspermidine decarboxylase; PDBTitle: crystal structure of carboxynorspermidine decarboxylase complexed with2 norspermidine from campylobacter jejuni Resolution 1.90 Å

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		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	G	Q	R	L	P	A	L	F	C	F	P	Q	I	L	Q	H	R	L	R	S	I	N	A	A	F	K	R	A	R	E	S	Y	G	Y	N	G	D	Y	F	L	V	Y	P	I	K	V	N	Q	H	R	R	V	I	E	S	L	I	H	S	G	E	P	L	G	L	E	A	G	S	K	A	E	L	M	A	V	L	A	H
Query Conservation
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.											.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.											.	.
Template Sequence		E	K	I	Q	T	P	A	Y	I	L	E	E	D	K	L	R	K	N	C	E	L	L	A	S	V	G	E	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	K	V	L	L	A	L	K	G	F	A	F	S	G	A	M	K	I	V	G	E	Y	L	K	.	.	G	C	T	C	S	G	L	W	E	A	.	.	K	F	A	K
Template Known Secondary structure		T	T			S	S																								.	.	.	.	.	.	.	.								T	T	T				G	G	G								S		.	.					S	S					.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.											.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.									.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.			.	.	60	.	.	.	.	.	.	.			.	.	70	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	M	T	R	S	V	I	V	C	N	G	Y	K	D	R	E	Y	I	R	L	A	L	I	G	E	K	M	G	H	K	V	Y	L	V	I	E	K	M	S	E	I	A	I	V	L	D	E	A	E	R	L	N	V	V	P	R	L	G	V	R	A	R	L	A	S	Q	G	S	G	K	W	Q	S	S	G	G	E	K	S
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.																						.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.																						.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	Y	M	D	K	E	I	H	T	Y	S	P	A	F	K	E	D	E	I	G	E	I	A	S	L	.	.	.	.	.	S	H	H	I	V	F	N	S	L	A	Q	F	H	K	F	Q	S	K	T	Q	K	.	.	.	.	N	S	L	G	L	R	C	N	V	E	F	S	G	R	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Known Secondary structure				T		S							S	S													.	.	.	.	.		S					S	S								G	G	G		T	T	.	.	.	.	S						B							T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.																						.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.						.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.					.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.										.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	F	G	L	A	A	T	Q	V	L	Q	L	V	E	T	L	R	E	A	G	R	L	D	S	L	Q	L	L	H	F	H	L	G	S	Q	M	A	N	I	R	D	I	A	T	G	V	R	E	S	A	R	F	Y	V	E	L	H	K	L	G	V	N	I	Q	C	F	D	V	G	G	G	L	G	V	D	Y	E	G	T	R
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.								.												.																			.	.	.																				.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.								.												.																			.	.	.																				.	.	.	.
Template Sequence		R	L	G	I	R	A	K	D	F	.	.	.	.	.	.	.	E	N	V	D	L	N	A	.	I	E	G	L	H	F	H	A	L	C	E	.	E	S	A	D	A	L	E	A	V	L	K	V	F	E	E	K	F	G	.	.	.	K	W	I	G	Q	M	K	W	V	N	F	G	G	G	H	H	I	T	K	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S	B		G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	T	T				T	T	.										S	S	.	B																	G	.	.	.	G	G	T	T	T		S						S		B		T	T	S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.								.												.																			.	.	.																				.	.	.	.
Template SS confidence
		144	.	.	.	.	.	150	.	.								.	.	.	.	.	.	.		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170		.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.				.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	Q	S	D	C	S	V	N	Y	G	L	N	E	Y	A	N	N	I	I	W	A	I	G	D	A	C	E	E	N	G	L	P	H	P	T	V	I	T	E	S	G	R	A	V	T	A	H	H	T	V	L	V	S	N	I	I	G	V	E	R	N	E	Y	T	V	P	T	A	P	A	E	D	A	P	R	A	L	Q	S	M
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	K	G	Y	D	V	E	K	L	I	A	L	C	K	N	F	S	D	K	Y	.	.	.	.	.	.	.	G	V	Q	V	Y	L	E	P	G	E	A	V	G	W	Q	T	G	N	L	V	A	S	V	V	D	I	I	E	N	E	K	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	T	T																		.	.	.	.	.	.	.	T								S					T	T	S													S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.								.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	E	T	W	Q	E	M	H	E	P	G	T	R	R	S	L	R	E	W	L	H	D	S	Q	M	D	L	H	D	I	H	I	G	Y	S	S	G	I	F	S	L	Q	E	R	A	W	A	E	Q	L	Y	L	S	M	C	H	E	V	Q	K	Q	L	D	P	Q	N	R	A	H	R	P	I	I	D	E	L	Q	E	R	M
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.											.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	D	K	M	Y	V	N	F	S	L	F	Q	S	M	P	D	A	W	G	I	D	Q	L	F	P	V	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	E	G	L	D	Q	V	P	E	R	R	A	V	L	L	D	I	T	C	D	S	D	G	A	I	D	H	Y	I	D	G	D	G	I	A	T	T	M	P	M	P	E
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	I	A	I	L	D	T	S	S	E	A	H	M	P	D	T	I	I	M	P	Y	T	S	E	V	L	N	A	R	I	L	A	T	R	E	N	E	K	I	S	D	L	K	E	N	E	F	A	Y	L	L	T	G	N	T	C	L	A	G	D	V	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	Y	A	F	D	K	K
Template Known Secondary structure		.	.					S	S						S						T	T					B	T	T							T	T			B						T	T									S	S	S		T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.										320	.	.	.	.	.	.	.
		552	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	D	P	E	N	P	P	M	L	G	F	F	M	V	G	A	Y	Q	E	I	L	G	N	M	H	N	L	F	G	D	T	E	A	V	D	V	F	V	F	P	D	G	S	V	E	V
Query Conservation
Alig confidence							.	.																												.	.
Template Conservation							.	.																												.	.
Template Sequence		L	K	I	G	D	.	.	K	I	V	F	L	D	Q	I	H	Y	T	I	V	K	N	T	T	F	N	G	I	R	L	P	N	L	M	.	.	L	L	D	H	K	N	E	L	Q	M
Template Known Secondary structure				T	T		.	.					S	S		S	S	S	S	G	G	G				G	G	G								.	.				T	T	S
Template Predicted Secondary structure							.	.																												.	.
Template SS confidence
		328	.	330	.	.			.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.			360	.	.	.	.	.	.	.	.	.