Job Description P21170 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:37:56 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 348 % Identity 18% Template c3mt1B_ PDB info PDB header:lyase Chain: B: PDB Molecule:putative carboxynorspermidine decarboxylase protein; PDBTitle: crystal structure of putative carboxynorspermidine decarboxylase2 protein from sinorhizobium meliloti Resolution 2.50 Å

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		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	Q	R	L	P	A	L	F	C	F	P	Q	I	L	Q	H	R	L	R	S	I	N	A	A	F	K	R	A	R	E	S	Y	G	Y	N	G	D	Y	F	L	V	Y	P	I	K	V	N	Q	H	R	R	V	I	E	S	L	I	H	S	G	E	P	L	G	L	E	A	G	S	K	A	E	L	M	A	V	L	A	H	A
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template Sequence		X	I	E	T	P	Y	Y	L	I	D	K	A	K	L	T	R	N	X	E	R	I	A	H	V	R	E	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	K	A	L	L	A	L	K	C	F	A	T	W	S	V	F	D	L	X	R	D	Y	X	D	.	.	G	T	T	S	S	S	L	F	E	V	R	L	G	R	E	R	F
Template Known Secondary structure					S	S																								.	.	.	.	.	.	.	.								T	T	T				G	G	G						T	T			.	.					S	S											T
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.									.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.			.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	M	T	R	S	V	I	V	C	N	G	Y	K	D	R	E	Y	I	R	L	A	L	I	G	E	K	M	G	H	K	V	Y	L	V	I	E	K	M	S	E	I	A	I	V	L	D	E	A	E	R	L	N	V	V	P	R	L	G	V	R	A	R	L	A	S	Q	G	S	G	K	W	Q	S	S	G	G	E	K	S	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.																						.	.	.	.	.																							.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																						.	.	.	.	.																							.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	G	K	E	T	H	A	Y	S	V	A	Y	G	D	N	E	I	D	E	V	V	S	.	.	.	.	.	H	A	D	K	I	I	F	N	S	I	S	Q	L	E	R	F	A	D	K	A	A	G	.	.	.	.	I	A	R	G	L	R	L	N	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	R
Template Known Secondary structure		.	.		S							S	S												.	.	.	.	.			S					S	S								T	T	T	T	T	T	.	.	.	.	S						B			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.																						.	.	.	.	.																							.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.						.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.					.	.	.	.	.	.	120	.	.																.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	G	L	A	A	T	Q	V	L	Q	L	V	E	T	L	R	E	A	G	R	L	D	S	L	Q	L	L	H	F	H	L	G	S	Q	M	A	N	I	R	D	I	A	T	G	V	R	E	S	A	R	F	Y	V	E	L	H	K	L	G	V	N	I	Q	C	F	D	V	G	G	G	L	G	V	D	Y	E	G	T	R	S
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.															.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.															.	.	.	.	.
Template Sequence		L	G	E	W	D	V	P	K	V	E	R	V	X	D	.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	N	G	F	X	I	H	N	N	C	E	N	K	D	F	G	L	F	D	R	X	L	G	E	I	E	E	R	F	G	A	L	I	A	R	.	.	.	V	D	W	V	S	L	G	G	G	I	H	F	T	G	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	B								T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	S										S	S	B																								.	.	.	S	S						S		B		T	T	S	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.									.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190				.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	S	D	C	S	V	N	Y	G	L	N	E	Y	A	N	N	I	I	W	A	I	G	D	A	C	E	E	N	G	L	P	H	P	T	V	I	T	E	S	G	R	A	V	T	A	H	H	T	V	L	V	S	N	I	I	G	V	E	R	N	E	Y	T	V	P	T	A	P	A	E	D	A	P	R	A	L	Q	S	M	W
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	D	D	Y	P	V	D	A	F	S	A	R	L	R	A	F	S	D	R	Y	.	.	.	.	.	.	.	G	V	Q	I	Y	L	E	P	G	E	A	S	I	T	K	S	T	T	L	E	V	T	V	L	D	T	L	Y	N	K	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	T	T																		.	.	.	.	.	.	.	T								S					T	T																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.								.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	T	W	Q	E	M	H	E	P	G	T	R	R	S	L	R	E	W	L	H	D	S	Q	M	D	L	H	D	I	H	I	G	Y	S	S	G	I	F	S	L	Q	E	R	A	W	A	E	Q	L	Y	L	S	M	C	H	E	V	Q	K	Q	L	D	P	Q	N	R	A	H	R	P	I	I	D	E	L	Q	E	R	M	A
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	K	M	Y	V	N	F	S	L	F	Q	S	M	P	D	A	W	G	I	D	Q	L	F	P	V	L	P	L	E	G	L	D	Q	V	P	E	R	R	A	V	L	L	D	I	T	C	D	S	D	G	A	I	D	H	Y	I	D	G	D	G	I	A	T	T	M	P	M	P	E	Y	D	P	E	N	P	P	M	L	G	F
Query Conservation
Alig confidence		.	.																										.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template Conservation		.	.																										.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template Sequence		.	.	A	I	V	D	S	S	I	E	A	H	X	L	D	L	L	I	Y	R	E	T	A	K	V	L	P	.	.	.	.	.	N	E	G	S	H	S	Y	X	I	C	G	K	S	C	L	A	G	D	V	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	F	R	F	A	E	E	L	K	V	G	D	.	.	R	I	S	F
Template Known Secondary structure		.	.				S														T						S	S	.	.	.	.	.			S	S								S	S	S		T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	S				T	T		.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.																										.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template SS confidence
				257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.						.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.										.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.			.	.	.	.
		563	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	M	V	G	A	Y	Q	E	I	L	G	N	M	H	N	L	F	G	D	T	E	A	V	D	V	F	V	F	P	D	G	S	V	E	V	E	L	S	D	E	G	D	T	V	A	D	M	L	Q	Y	V	Q
Query Conservation
Alig confidence																											.	.								.	.	.
Template Conservation																											.	.								.	.	.
Template Sequence		Q	D	A	A	G	Y	T	X	V	K	K	N	W	F	N	G	V	K	X	P	A	I	A	I	R	.	.	E	L	D	G	S	V	R	.	.	.	T	V	R	E	F	T	Y	A	D	Y	E	Q	S	L	S
Template Known Secondary structure		S	S			T	T	T	G	G	G				G	G	G										.	.		T	T	S				.	.	.													T	T
Template Predicted Secondary structure																											.	.								.	.	.
Template SS confidence
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.			.	.	.	.	.	.	350				.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.