Job Description P21170 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:37:56 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 355 % Identity 19% Template c3btnA_ PDB info PDB header:biosynthetic protein Chain: A: PDB Molecule:antizyme inhibitor 1; PDBTitle: crystal structure of antizyme inhibitor, an ornithine2 decarboxylase homologous protein Resolution 2.05 Å

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		67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.				.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.
Query Sequence		E	A	R	V	D	L	A	Q	L	V	K	T	R	E	A	Q	G	Q	.	.	.	R	L	P	A	L	F	C	F	P	Q	I	L	Q	H	R	L	R	S	I	N	A	A	F	K	R	A	R	E	S	Y	G	Y	N	G	D	Y	F	L	V	Y	P	I	K	V	N	Q	H	R	R	V	I	E	S	L	I	H	S	G	E
Query Conservation																				.	.	.
Alig confidence																				.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	E	G	T	N	L	G	N	V	I	D	N	Y	V	Y	E	H	T	L	T	G	K	N	A	F	F	V	G	D	L	G	K	I	V	K	K	H	S	Q	W	Q	T	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Q	I	K	P	F	Y	T	V	K	C	N	S	T	P	A	V	L	E	I	L	A	A	L	G	T
Template Known Secondary structure			T	T																	S	S																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T							G	G	G														T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.											60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	L	G	L	E	A	G	S	K	A	E	L	M	A	V	L	A	H	A	G	M	T	R	S	V	I	V	C	N	G	Y	K	D	R	E	Y	I	R	L	A	L	I	G	E	K	M	G	H	K	V	Y	L	V	I	E	K	M	S	E	I	A	I	V	L	D	E	A	E	R	L	N	V	V	P	R	L	G	V	R	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.																																								.	.	.							.																			.	.	.	.
Template Conservation		.	.																																								.	.	.							.																			.	.	.	.
Template Sequence		.	.	G	F	A	C	S	S	K	N	E	M	A	L	V	Q	E	L	G	V	S	P	E	N	I	I	F	T	S	P	C	K	Q	V	S	Q	I	K	Y	A	A	.	.	.	K	V	G	V	N	I	.	M	T	C	D	N	E	I	E	L	K	K	I	A	R	N	H	P	N	.	.	.	.	A	K	V	L	L	H	I
Template Known Secondary structure		.	.					S	S										T	T			G	G	G						S	S											.	.	.			T				.					S												T	T	.	.	.	.							B
Template Predicted Secondary structure		.	.																																								.	.	.							.																			.	.	.	.
Template SS confidence
				86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.				.	.	.	.	.	130		.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.					.	150	.	.	.	.	.
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	L	A	S	Q	G	S	G	K	W	Q	S	S	G	G	E	K	S	K	F	G	L	A	A	T	Q	V	L	Q	L	V	E	T	L	R	E	A	G	R	L	D	S	L	Q	L	L	H	F	H	L	G	S	Q	M	A	N	I	R	D	I	A	T	G	V	R	E	S	A	R	F	Y	V	E	L	H	K	L	G	V	N
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Sequence		A	T	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	K	F	G	T	T	L	K	N	C	R	H	L	L	E	C	A	K	E	L	D	V	Q	.	.	I	I	G	V	K	F	H	V	S	S	A	C	K	E	Y	Q	V	Y	V	H	A	L	S	D	A	R	C	V	F	D	M	A	G	E	F	G	F	T
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					B																T			.	.										T	T				T	T																			T	T
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template SS confidence
		156	.	.	.														160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.			.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	Q	C	F	D	V	G	G	G	L	G	V	D	Y	E	G	T	R	S	Q	S	D	C	S	V	N	Y	G	L	N	E	Y	A	N	N	I	I	W	A	I	G	D	A	C	E	E	N	G	L	P	H	P	T	V	I	T	E	S	G	R	A	V	T	A	H	H	T	V	L	V	S	N	I	I	G	V	E	R	N	E
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template Sequence		M	N	M	L	D	I	G	G	G	F	T	G	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	Q	L	E	E	V	N	H	V	I	S	P	L	L	D	I	Y	F	P	E	G	.	.	S	G	I	Q	I	I	S	E	P	G	S	Y	Y	V	S	S	A	F	T	L	A	V	N	I	I	A	K	K	V	V	A
Template Known Secondary structure									S				S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		S		T	T	.	.	S									S					T	T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.													.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.			.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	T	V	P	T	A	P	A	E	D	A	P	R	A	L	Q	S	M	W	E	T	W	Q	E	M	H	E	P	G	T	R	R	S	L	R	E	W	L	H	D	S	Q	M	D	L	H	D	I	H	I	G	Y	S	S	G	I	F	S	L	Q	E	R	A	W	A	E	Q	L	Y	L	S	M	C	H	E	V	Q	K	Q	L
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		312	.
		464	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	P	Q	N	R	A	H	R	P	I	I	D	E	L	Q	E	R	M	A	D	K	M	Y	V	N	F	S	L	F	Q	S	M	P	D	A	W	G	I	D	Q	L	F	P	V	L	P	L	E	G	L	D	Q	V	P	E	R	R	A	V	L	L	D	I	T	C	D	S	D	G	A	I	D	H	Y	I	D	G	D	G	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Y	M	N	D	G	V	Y	G	S	F	A	S	K	L	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	I	P	E	V	H	K	K	P	L	F	T	S	S	L	W	G	P	S	C	D	E	L	D	Q	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S			T	T	T	T	T	G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.																			T	T		S	T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																							314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.									.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
		544	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	T	T	M	P	M	P	E	Y	D	P	E	N	P	P	M	L	G	F	F	M	V	G	A	Y	Q	E	I	L	G	N	M	H	N	L	F	G	D	T	E	A	V	D	V	F
Query Conservation
Alig confidence															.	.
Template Conservation															.	.
Template Sequence		V	E	S	C	L	L	P	E	L	N	V	G	D	.	.	W	L	I	F	D	N	M	G	A	D	S	F	H	E	P	S	A	F	N	D	F	Q	R	P	A	I	Y	F	M	M
Template Known Secondary structure												T	T		.	.					S	S			S	S							G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.
Template SS confidence
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.			.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.