Job Description P21170 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:37:56 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 387 % Identity 22% Template c2p3eA_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:diaminopimelate decarboxylase; PDBTitle: crystal structure of aq1208 from aquifex aeolicus Resolution 1.99 Å

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		46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	N	Y	Y	D	V	N	E	L	G	H	I	S	V	C	P	D	P	D	V	P	E	A	R	V	D	L	A	Q	L	V	K	T	R	E	A	Q	G	Q	R	L	P	A	L	F	C	F	P	Q	I	L	Q	H	R	L	R	S	I	N	A	A	F	K	R	A	R	E	S	Y	G	Y	N	G	D	Y	F	L	V	Y	P
Query Conservation
Alig confidence										.						.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.						.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	P	Y	L	E	Y	R	D	.	G	E	L	F	I	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	V	S	L	K	E	L	A	Q	T	.	.	.	.	.	F	G	T	P	L	Y	V	Y	S	S	N	F	I	K	E	R	F	E	A	Y	R	K	A	F	P	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	C	Y	A
Template Known Secondary structure			T	T					T	.	T					.	.	.	.	.	.	.	.	T	T										.	.	.	.	.			S	S																				S	T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.						.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.		.	.	.	.	20									.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.						.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.											.	60	.	.	.
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	K	V	N	Q	H	R	R	V	I	E	S	L	I	H	S	G	E	P	L	G	L	E	A	G	S	K	A	E	L	M	A	V	L	A	H	A	G	M	T	R	S	V	I	V	C	N	G	Y	K	D	R	E	Y	I	R	L	A	L	I	G	E	K	M	G	H	K	V	Y	L	V	I	E	K	M	S	E	I	A	I
Query Conservation
Alig confidence																				.	.																																													.	.	.	.
Template Conservation																				.	.																																													.	.	.	.
Template Sequence		V	K	A	N	F	N	P	H	L	V	K	L	L	G	E	L	G	A	.	.	G	A	D	I	V	S	G	G	E	L	Y	L	A	K	K	A	G	I	P	P	E	R	I	V	Y	A	G	V	G	K	T	E	K	E	L	T	D	A	V	D	S	E	I	L	.	.	.	.	M	F	N	V	E	S	R	Q	E	L	D	V
Template Known Secondary structure		G	G	G													T	T		.	.					S	S										T	T			G	G	G					S	S													T	T		S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																				.	.																																													.	.	.	.
Template SS confidence
		64	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.			.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.					.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	D	E	A	E	R	L	N	V	V	P	R	L	G	V	R	A	R	L	A	S	Q	G	S	G	K	W	Q	S	S	G	G	E	K	S	K	F	G	L	A	A	T	Q	V	L	Q	L	V	E	T	L	R	E	A	G	R	L	D	S	L	Q	L	L	H	F	H	L	G	S	Q	M	A	N	I	R	D	I	A	T
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Template Sequence		L	N	E	I	A	G	K	L	G	K	K	A	R	I	A	I	R	V	N	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	F	G	V	D	I	R	E	A	Q	K	E	Y	E	Y	A	S	K	L	E	N	L	E	.	I	V	G	I	H	C	H	I	G	S	Q	I	L	D	I	S	P	Y	R	E
Template Known Secondary structure										T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S				G	G	G										T		T	T			.										S	S	B	S	S		T
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Template SS confidence
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.																.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.		.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	R	E	S	A	R	F	Y	V	E	L	H	K	L	G	V	N	I	Q	C	F	D	V	G	G	G	L	G	V	D	Y	E	G	T	R	S	Q	S	D	C	S	V	N	Y	G	L	N	E	Y	A	N	N	I	I	W	A	I	G	D	A	C	E	E	N	G	L	P	H	P	T	V	I	T	E	S	G	R	A	V
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	V	E	K	V	V	S	L	Y	E	S	L	T	Q	K	G	F	D	I	K	Y	L	D	I	G	G	G	L	G	I	K	Y	.	.	.	.	.	.	K	P	E	D	K	E	P	A	P	Q	D	L	A	D	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	D	L	L	V	K	A	K	I	I	L	E	P	G	R	S	I
Template Known Secondary structure																T	T												B					.	.	.	.	.	.	S	T	T														.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T				S							S
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.							250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.										.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	A	H	H	T	V	L	V	S	N	I	I	G	V	E	R	N	E	Y	T	V	P	T	A	P	A	E	D	A	P	R	A	L	Q	S	M	W	E	T	W	Q	E	M	H	E	P	G	T	R	R	S	L	R	E	W	L	H	D	S	Q	M	D	L	H	D	I	H	I	G	Y	S	S	G	I	F	S	L	Q	E	R
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	G	N	A	G	I	L	I	T	Q	V	Q	F	L	K	D	K	G	S	K	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			G	G	G														T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
		446	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	W	A	E	Q	L	Y	L	S	M	C	H	E	V	Q	K	Q	L	D	P	Q	N	R	A	H	R	P	I	I	D	E	L	Q	E	R	M	A	D	K	M	Y	V	N	F	S	L	F	Q	S	M	P	D	A	W	G	I	D	Q	L	F	P	V	L	P	L	E	G	L	D	Q	V	P	E	R	R	A	V	L	L	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.										.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.										.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	I	I	V	D	A	G	M	N	D	L	I	R	P	S	I	Y	.	N	A	Y	H	H	I	I	P	V	.	.	.	.	E	T	K	E	V	V	A	D	I	V	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S			T	T	T								.									S	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.										.	.	.	.
Template SS confidence
																																								306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.		.	.	.	.	.	.	.	330	.					.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.
		526	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	T	C	D	S	D	G	A	I	D	H	Y	I	D	G	D	G	I	A	T	T	M	P	M	P	E	Y	D	P	E	N	P	P	M	L	G	F	F	M	V	G	A	Y	Q	E	I	L	G	N	M	H	N	L	F	G	D	T	E	A	V	D	V	F	V	F	P	D	G	S	V	E	V	E	L	S	D	E	G	D	T
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																															.	.	.							.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																															.	.	.							.	.
Template Sequence		P	I	C	E	T	G	D	F	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	D	R	E	I	E	E	V	Q	R	G	E	.	.	Y	L	A	V	L	S	A	G	A	Y	G	F	A	M	S	S	H	Y	N	M	R	P	R	A	A	E	V	L	V	E	.	.	.	N	G	S	V	K	L	.	.	I	R	K	R	E	N
Template Known Secondary structure		S	S	S	S	T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T		.	.						S		T	T	T	T	G	G	G				G	G	G											.	.	.	T	T					.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																															.	.	.							.	.
Template SS confidence
		346	.	.	.	350	.	.	.	.										.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.			.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.				.	.	400	.	.	.			.	.	.	.	.	.
		606	.	.	.	610	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	A	D	M	L	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Y	D	Y	I	V	E
Template Known Secondary structure							G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		410	.	.	.	.	.