Job Description P21170 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:37:56 GMT 2012 Rank 16 Aligned Residues 363 % Identity 24% Template c2nvaH_ PDB info PDB header:lyase Chain: H: PDB Molecule:arginine decarboxylase, a207r protein; PDBTitle: the x-ray crystal structure of the paramecium bursaria2 chlorella virus arginine decarboxylase bound to agmatine Resolution 1.80 Å

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		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	Q	L	V	K	T	R	E	A	Q	G	Q	R	L	P	A	L	F	C	F	P	Q	I	L	Q	H	R	L	R	S	I	N	A	A	F	K	R	A	R	E	S	Y	G	Y	N	G	D	Y	F	L	V	Y	P	I	K	V	N	Q	H	R	R	V	I	E	S	L	I	H	S	G	E	P	L	G	L	E	A	G	S
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Conservation													.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Sequence		M	N	S	V	V	N	N	I	L	Q	T	.	.	.	K	S	F	Y	V	S	S	P	K	I	V	E	D	L	I	D	Q	W	T	I	L	F	P	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	P	H	Y	A	V	K	C	N	N	D	E	V	L	L	K	T	M	C	D	K	N	V	.	.	N	F	D	C	A	S
Template Known Secondary structure													.	.	.	S																						T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							G	G	G													T	T		.	.						S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.				.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.											.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.			60	.	.	.	.	.
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	E	L	M	A	V	L	A	H	A	G	M	T	R	S	V	I	V	C	N	G	Y	K	D	R	E	Y	I	R	L	A	L	I	G	E	K	M	G	H	K	V	Y	L	V	I	E	K	M	S	E	I	A	I	V	L	D	E	A	E	R	L	N	V	V	P	R	L	G	V	R	A	R	L	A	S	Q	G	S	G
Query Conservation
Alig confidence																																								.	.	.	.																				.	.	.	.													.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.																				.	.	.	.													.	.	.
Template Sequence		S	S	E	I	K	K	V	I	Q	I	G	V	S	P	S	R	I	I	F	A	H	T	M	K	T	I	D	D	L	I	F	A	K	D	Q	G	V	D	.	.	.	.	I	A	T	F	D	S	S	F	E	L	D	K	I	H	T	Y	H	P	N	.	.	.	.	C	K	M	I	L	R	I	R	C	D	D	P	.	.	.
Template Known Secondary structure												T			G	G	G						S	S													T			.	.	.	.						S												T	T	.	.	.	.							B					T	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.																				.	.	.	.													.	.	.
Template SS confidence
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.					.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.					.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	W	Q	S	S	G	G	E	K	S	K	F	G	L	A	A	T	Q	V	L	Q	L	V	E	T	L	R	E	A	G	R	L	D	S	L	Q	L	L	H	F	H	L	G	S	Q	M	A	N	I	R	D	I	A	T	G	V	R	E	S	A	R	F	Y	V	E	L	H	K	L	G	V	N	I	Q	C	F	D	V	G	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.																															.	.
Template Conservation		.	.																															.	.
Template Sequence		.	.	N	A	T	V	Q	L	G	N	K	F	G	A	N	E	D	E	I	R	H	L	L	E	Y	A	K	Q	L	D	I	E	.	.	V	I	G	I	S	F	H	V	G	S	G	S	R	N	P	E	A	Y	Y	R	A	I	K	S	S	K	E	A	F	N	E	A	I	S	V	G	H	K	P	Y	I	L	D	I	G	G
Template Known Secondary structure		.	.	T		S	B			T	T	T	S	S	B		G	G	G											T	T			.	.										B	S	B																								T
Template Predicted Secondary structure		.	.																															.	.
Template SS confidence
				140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.			170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	G	V	D	Y	E	G	T	R	S	Q	S	D	C	S	V	N	Y	G	L	N	E	Y	A	N	N	I	I	W	A	I	G	D	A	C	E	E	N	G	L	P	H	P	T	V	I	T	E	S	G	R	A	V	T	A	H	H	T	V	L	V	S	N	I	I	G	V	E	R	N	E	Y	T	V	P	T	A	P	A
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.																																				.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.																																				.	.	.	.
Template Sequence		G	L	H	A	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	L	S	T	M	S	D	Y	I	N	D	A	I	K	D	F	F	P	E	.	.	.	D	T	V	T	I	V	A	E	P	G	R	F	F	A	E	H	Y	S	V	L	A	T	Q	V	I	G	K	R	V	R	D	G	L	Y	E	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			B					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	T	T								S					G	G	G														T	T				.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.																																				.	.	.	.
Template SS confidence
		216	.	.	.	220	.													.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.				.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	D	A	P	R	A	L	Q	S	M	W	E	T	W	Q	E	M	H	E	P	G	T	R	R	S	L	R	E	W	L	H	D	S	Q	M	D	L	H	D	I	H	I	G	Y	S	S	G	I	F	S	L	Q	E	R	A	W	A	E	Q	L	Y	L	S	M	C	H	E	V	Q	K	Q	L	D	P	Q	N	R	A	H	R
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.		.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
Predicted Secondary structure																																	.
Query SS confidence																																	.
Query Sequence		P	I	I	D	E	L	Q	E	R	M	A	D	K	M	Y	V	N	F	S	L	F	Q	S	M	P	D	A	W	G	I	D	.	Q	L	F	P	V	L	P	L	E	G	L	D	Q	V	P	E	R	R	A	V	L	L	D	I	T	C	D	S	D	G	A	I	D	H	Y	I	D	G	D	G	I	A	T	T	M	P	M	P
Query Conservation																																	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.																														.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	F	F	N	E	S	T	Y	G	G	F	S	N	V	I	F	E	K	S	V	P	T	P	Q	L	L	R	D	V	P	D	D	E	E	Y	V	P	S	V	L	Y	G	C	T	C	D	G	V	.	.	.	D	V	I	.	.	.	.	.	.	N	H	N	V	A	L	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S			T	T	T	T		T					S									S	S				T	T											S	S	S		T	T	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.				.	.	330							.	.	.	.	.	.	.
		551	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Y	D	P	E	N	P	P	M	L	G	F	F	M	V	G	A	Y	Q	E	I	L	G	N	M	H	N	L	F	G	D	T	E	A	V	D	V
Query Conservation
Alig confidence								.	.
Template Conservation								.	.
Template Sequence		E	L	H	I	G	D	.	.	W	V	Y	F	P	S	W	G	A	Y	T	N	V	L	T	T	S	F	N	G	F	G	E	Y	D	V	Y	Y	I
Template Known Secondary structure					T	T		.	.					S	S			S	S	S	G	G	G				G	G	G
Template Predicted Secondary structure								.	.
Template SS confidence
		338	.	340	.	.	.			.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.