Job Description P21170 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:37:56 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 376 % Identity 20% Template c1d7kB_ PDB info PDB header:lyase Chain: B: PDB Molecule:human ornithine decarboxylase; PDBTitle: crystal structure of human ornithine decarboxylase at 2.12 angstroms resolution Resolution 2.10 Å

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		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	Q	L	V	K	T	R	E	A	Q	G	Q	R	L	P	A	L	F	C	F	P	Q	I	L	Q	H	R	L	R	S	I	N	A	A	F	K	R	A	R	E	S	Y	G	Y	N	G	D	Y	F	L	V	Y	P	I	K	V	N	Q	H	R	R	V	I	E	S	L	I	H	S	G	E	P	L	G	L	E	A	G	S
Query Conservation
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																		.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																		.	.
Template Sequence		L	D	Q	K	I	N	E	V	S	S	S	D	D	K	D	A	F	Y	V	A	D	L	G	D	I	L	K	K	H	L	R	W	L	K	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	V	T	P	F	Y	A	.	V	C	N	D	S	K	A	I	V	K	T	L	A	A	T	G	T	.	.	G	F	D	C	A	S
Template Known Secondary structure								T	T	T	T	S	S																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T							.														T	T	T		.	.						S
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																		.	.
Template SS confidence
		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.											60	.	.	.	.	.	.	.		.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.			.	.	.	.	.	90
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	E	L	M	A	V	L	A	H	A	G	M	T	R	S	V	I	V	C	N	G	Y	K	D	R	E	Y	I	R	L	A	L	I	G	E	K	M	G	H	K	V	Y	L	V	I	E	K	M	S	E	I	A	I	V	L	D	E	A	E	R	L	N	V	V	P	R	L	G	V	R	A	R	L	A	S	Q	G	S	G
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.							.																			.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.							.																			.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template Sequence		K	T	E	I	Q	L	V	Q	S	L	G	V	P	P	E	R	I	I	Y	A	N	P	C	K	Q	V	S	Q	I	K	Y	A	A	.	.	.	N	N	G	V	Q	M	.	M	T	F	D	S	E	V	E	L	M	K	V	A	R	A	H	P	K	.	.	.	.	A	K	L	V	L	R	I	A	T	.	.	.	.	.	D
Template Known Secondary structure										T	T	T			G	G	G						S	S											.	.	.		T	T				.					S												T	T	.	.	.	.							B			.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.							.																			.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.				.	.	.	.	.	130		.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.					.	150	.	.	.	.	.	.	.						.
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	W	Q	S	S	G	G	E	K	S	K	F	G	L	A	A	T	Q	V	L	Q	L	V	E	T	L	R	E	A	G	R	L	D	S	L	Q	L	L	H	F	H	L	G	S	Q	M	A	N	I	R	D	I	A	T	G	V	R	E	S	A	R	F	Y	V	E	L	H	K	L	G	V	N	I	Q	C	F	D	V	G	G
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.
Template Conservation																																		.	.
Template Sequence		D	S	K	A	V	C	R	L	S	V	K	F	G	A	T	L	R	T	S	R	L	L	L	E	R	A	K	E	L	N	I	D	.	.	V	V	G	V	S	F	H	V	G	S	G	C	T	D	P	E	T	F	V	Q	A	I	S	D	A	R	C	V	F	D	M	G	A	E	V	G	F	S	M	Y	L	L	D	I	G	G
Template Known Secondary structure		S			S	S			S	S		S	S		B																T			.	.										S			S		T																			T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																		.	.
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190			.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	G	V	D	Y	E	G	T	R	S	Q	S	D	C	S	V	N	Y	G	L	N	E	Y	A	N	N	I	I	W	A	I	G	D	A	C	E	E	N	G	L	P	H	P	T	V	I	T	E	S	G	R	A	V	T	A	H	H	T	V	L	V	S	N	I	I	G	V	E	R	N	E	Y	T	V	P	T	A	P	A
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Sequence		G	F	P	G	S	E	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	K	F	E	E	I	T	G	V	I	N	P	A	L	D	K	Y	F	P	S	D	.	.	S	G	V	R	I	I	A	E	P	G	R	Y	Y	V	A	S	A	F	T	L	A	V	N	I	I	A	K	K	I	V	L	K	E	Q	S	S	E	Q	T
Template Known Secondary structure					S	S	S		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S																	S		G	G	.	.	G									S					T	T	T																					S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.										.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.			.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	D	A	P	R	A	L	Q	S	M	W	E	T	W	Q	E	M	H	E	P	G	T	R	R	S	L	R	E	W	L	H	D	S	Q	M	D	L	H	D	I	H	I	G	Y	S	S	G	I	F	S	L	Q	E	R	A	W	A	E	Q	L	Y	L	S	M	C	H	E	V	Q	K	Q	L	D	P	Q	N	R	A	H	R
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		314	.
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.		.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
Predicted Secondary structure																										.
Query SS confidence																										.
Query Sequence		P	I	I	D	E	L	Q	E	R	M	A	D	K	M	Y	V	N	F	S	L	F	Q	S	M	.	P	D	A	W	G	I	D	Q	L	F	P	V	L	P	L	E	G	L	D	Q	V	P	E	R	R	A	V	L	L	D	I	T	C	D	S	D	G	A	I	D	H	Y	I	D	G	D	G	I	A	T	T	M	P	M	P
Query Conservation																										.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																																					.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Y	V	N	D	G	V	Y	G	S	F	N	C	I	L	Y	D	H	A	H	V	K	P	L	L	Q	K	R	P	K	P	D	E	R	Y	Y	S	S	S	I	W	G	P	T	C	D	G	L	.	.	.	D	R	I	.	.	.	.	.	.	V	E	R	C	D	L	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S			T	T	T	G	G	G					S										S				T	T											S	S	S		T	T	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.				.	.	.							.	.	.	370	.	.	.
		551	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Y	D	P	E	N	P	P	M	L	G	F	F	M	V	G	A	Y	Q	E	I	L	G	N	M	H	N	L	F	G	D	T	E	A	V	D	V	F
Query Conservation
Alig confidence								.	.
Template Conservation								.	.
Template Sequence		E	M	H	V	G	D	.	.	W	M	L	F	E	N	M	G	A	Y	T	V	A	A	A	S	T	F	N	G	F	Q	R	P	T	I	Y	Y	V	M
Template Known Secondary structure					T	T		.	.						S			S	S	S	G	G	G				G	G	G
Template Predicted Secondary structure								.	.
Template SS confidence
		374	.	.	.	.	.			380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.