Job Description P77541 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:30:23 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 238 % Identity 28% Template d1dqua_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel Phosphoenolpyruvate/pyruvate domain Phosphoenolpyruvate mutase/Isocitrate lyase-like Resolution 2.80

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		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.					.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.																													.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.																													.	.	.	.
Query Sequence		K	A	F	R	A	A	L	T	K	E	N	P	L	Q	I	V	G	T	I	N	A	N	H	A	L	L	A	Q	R	A	G	Y	Q	A	I	Y	L	S	G	G	G	V	A	A	.	.	.	.	G	S	L	G	L	P	D	L	G	I	S	T	L	D	D	V	L	T	D	I	R	R	I	T	D	V	C	S	.	.	.	.
Query Conservation																																														.	.	.	.																													.	.	.	.
Alig confidence																																.														.	.	.	.																													.	.	.	.
Template Conservation																																.
Template Sequence		G	I	L	E	R	N	F	K	N	K	E	A	S	F	T	Y	G	C	L	D	P	T	M	V	T	Q	M	A	K	Y	.	L	D	T	V	Y	V	S	G	W	Q	S	S	S	T	A	S	S	T	D	E	P	S	P	D	L	A	D	Y	P	M	N	T	V	P	N	K	V	N	H	L	W	M	A	Q	L	F	H	D	R
Template Known Secondary structure											T							B			S											.		S															T	T					S	S		S		S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																.
Template SS confidence
		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90		.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																									80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	L	L	V	D	A	D	I	G	F	G	S	S	A	F	N	V	A	R	T	V	K	S	M	I	K	A	G	A	A	G	L	H	I	E	D	Q	V	G	A	K	R	C	G	H	R	P	N	K	A	I	V	S	K	E	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.																														.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.																														.	.	.	.	.
Template Sequence		K	Q	R	E	E	R	M	T	T	P	K	D	Q	R	H	K	V	A	N	V	D	Y	L	R	P	I	I	A	D	A	D	T	G	H	G	G	.	L	T	A	V	M	K	L	T	K	L	F	V	E	R	G	A	A	G	I	H	I	E	D	Q	A	P	G	T	K	.	.	.	.	.	G	K	V	L	V	P	I	S	E
Template Known Secondary structure									S	S						T	T	S														T	T		S	S	S	.														T	T		S						S	B		T	T			.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																						.																														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.		.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.						.	.	.	.	.	210	.	.	.
		137	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.			150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	V	D	R	I	R	A	A	V	D	A	K	T	.	.	D	P	D	F	V	I	M	A	R	T	D	A	L	A	V	E	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation															.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	I	N	R	L	V	A	I	R	A	Q	A	D	I	M	G	T	D	L	L	A	I	A	R	T	D	S	E	A	A	T	L	I	T	S	T	I	D	H	R	D	H	P	F	I	I	G	S	T	N	P	D	I	Q	P	L	N	D	L	M	V	M	A	E	Q	A	G	K	N	G	A	E	L	Q	A	I	E	D	E	W
Template Known Secondary structure																T	T											G	G	G					S		T	T		G	G	G	G	G	G							T	T	S													S				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																																																														168	.	170	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	A	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	A	K	A	G	L	K	L	F	N	D	A	V	V	D	A	I	N	N	S	P	L	P	N	K	K	A	A	I	E	K	Y	L	T	Q	S	K	G	K	S	N	L	E	A	R	A	I	A	K	E	I	A	G	T	D	I	Y	F	D	W	E	A	P	R	T	R	E	G	Y	Y	R	Y	Q	G	G	T	Q	C	A	I
Template Known Secondary structure					S					S										T	S	S		S														T	T															S	S					B	T	T	S	S			T	T								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.						.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.														.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure																				.															.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.															.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	R	A	Q	A	Y	V	E	A	G	A	E	M	L	F	P	E	A	.	I	T	E	L	A	M	Y	R	Q	F	A	D	A	V	.	.	.	.	.	Q	V	P	I	L	A	N	I	T	E	F	G	A	T	P	L	F	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	L	R	S	A	H	V	A	M
Query Conservation																				.															.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.									.															.	.	.	.	.									.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		N	R	A	V	A	Y	A	P	F	.	A	D	L	I	W	M	E	S	K	L	P	D	Y	K	Q	A	K	E	F	A	D	G	V	H	A	V	W	P	E	Q	K	L	A	Y	N	L	.	.	.	.	.	S	P	S	F	N	W	K	K	A	M	P	R	D	E	Q	E	T	Y	I	K	R	L	G	A	L	G	Y	A	W
Template Known Secondary structure								T	T	S	.		S							S	S																		T	T								.	.	.	.	.		S	S	S		G	G	G	T	S							S									T
Template Predicted Secondary structure											.																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		380	.	.	.	.	.	.	.	.		.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.						.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	Y	P	L	S	A	F	R	A	M	N	R	A	A	E	H	V	Y	N	V	L	R	Q	E	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q	F	I	T	L	A	G	L	H	T	T	A	L	I	S	D	T	F	A	K	A	Y	A	K	Q	G
Template Known Secondary structure					T	T																					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.

---

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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