Job Description P07118 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:14 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 342 % Identity 25% Template d1rqga2 SCOP info Adenine nucleotide alpha hydrolase-like Nucleotidylyl transferase Class I aminoacyl-tRNA synthetases (RS), catalytic domain Resolution 2.90

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		33	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.		.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
Predicted Secondary structure																												.
Query SS confidence																												.
Query Sequence		E	S	F	C	I	M	I	P	P	P	N	V	T	G	S	L	H	M	G	H	A	F	Q	Q	T	I	.	M	D	T	M	I	R	Y	Q	R	M	Q	G	K	N	T	L	W	Q	V	G	T	D	H	A	G	I	A	T	Q	M	V	V	E	R	K	I	A	A	E	E	G	K	T	R	H	D	Y	G	R	E	A	F	I
Query Conservation																												.
Alig confidence																												.																																				.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	R	Y	M	V	T	S	A	L	P	Y	A	N	G	P	I	H	A	G	H	L	A	G	A	Y	L	P	A	D	I	F	V	R	Y	L	R	L	K	G	E	D	V	V	F	I	C	G	T	D	E	H	G	T	P	I	S	F	R	A	L	K	E	.	.	.	.	.	G	R	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												B	T	T	S			B								T													T	T										B			S											.	.	.	.	.	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.						.	.	.	.
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	K	I	W	E	W	K	A	E	S	G	G	T	I	T	R	Q	M	R	R	L	G	N	S	V	D	W	E	R	E	R	F	T	M	D	E	G	L	S	N	A	V	K	E	V	F	V	R	L	Y	K	E	D	L	I	Y	R	G	K	R	L	V	N	W	D	P	K	L	R	T	A	I	S	D	L	E	V	E	N	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.																									.	.																																														.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																									.	.																																														.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	R	E	I	V	D	E	F	H	E	Q	I	K	I	T	F	Q	R	A	K	I	S	F	D	F	.	.	F	G	R	T	E	L	P	I	H	Y	K	L	S	Q	E	F	F	L	K	A	Y	E	N	G	H	L	V	K	K	V	T	K	Q	A	Y	C	E	H	D	K	M	F	L	P	D	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.																			T				S		.	.				T	T	S																	T	T												B	T	T	T	T	B				T	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																									.	.																																														.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					68	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.			.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	S	K	G	S	M	W	H	I	R	Y	P	L	A	D	G	A	K	T	A	D	G	K	D	Y	L	V	V	A	T	T	R	P	E	T	L	L	G	D	T	G	V	A	V	N	P	E	D	P	R	Y	K	D	L	I	G	K	Y	V	I	L	P	L	V	N	R	R	I	P	I	V	G	D	E	H	A	D	M	E	K
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	G	C	V	K	I	T	P	A	H	D	F	N	D	Y	E	V	G	K	R	H	A	L	P	M	I	N	I	L	T	F	D	G	D	I	R	E	S	A	Q	V	F	D	T	K	G	N	E	S	D	V	Y	S	S	E	I	P	A	E	F	Q	K	L	E	R	F	A	A	R	K	A	V	V	A	A	V	D	A	L
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	L	E	E	I	K	P	H	D	L	T	V	P	Y	G	D	R	G	G	V	V	I	E	P	M	L	T	D	Q	W	Y	V	R	A	D	V	L	A	K	P	A	V	E	A	V	E	N	G	D	I	Q	F	V	P	K	Q	Y	E	N	M	Y	F	S	W	M	R	D	I	Q	D	W	C	I	S	R	Q	L	W	W
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	F	A	I	C	G	R	P	I	S	F	R	D	S	A	H	Y	Y	I	K	M	Q	D	F	A	E	R	L	K	R	W	I	E	.	.	K	Q	P	W	K	P	N	V	K	N	M	V	L	S	W	I	E	E	G	L	E	E	R	A	I	T	R	D	L	N	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T				S																G	G	G	T										.	.	S	S															T	T												S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.
Template SS confidence
																137	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.			170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.								.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.				.	.	.	500	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Query Sequence		G	H	R	I	P	A	W	Y	D	E	A	G	N	V	Y	V	G	R	N	E	D	E	V	R	K	E	N	N	L	G	A	D	V	V	L	R	Q	D	E	D	V	L	D	T	W	F	S	S	A	L	W	T	F	S	.	.	.	.	.	.	.	T	L	G	W	P	E	N	T	D	A	L	.	.	.	R	Q	F	H	P
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	I	P	V	P	L	D	E	E	D	M	K	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	Y	V	W	F	E	A	P	I	G	Y	I	S	I	T	I	E	H	F	K	R	I	G	K	P	N	E	W	K	K	Y	W	L	N	I	D	G	Q	T
Template Known Secondary structure		S		B		S				S	S	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								G	G	G													T	T		T	T	T	T					B		S	S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		502	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.					.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.
Query Sequence		T	S	V	M	V	S	G	F	D	I	I	F	F	.	.	.	.	W	I	A	R	M	I	M	M	T	M	H	F	I	K	D	E	N	G	K	P	Q	V	P	F	H	T	V	Y	M	T	G	L	I	R	D	D	E	G	Q	K	M	S	K	S	K	G	N	V	I	D	P	L	D	M	V	D	G	I	S	L	P	E	L
Query Conservation															.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.																				.															.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.															.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	V	I	H	F	I	G	K	D	N	I	P	F	H	A	I	F	W	P	A	F	L	M	A	Y	G	K	Y	K	D	E	E	V	E	A	E	.	W	N	L	P	Y	D	I	P	A	N	E	Y	L	T	.	L	E	G	K	K	F	S	T	S	R	N	W	A	I	W	V	H	E	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									G	G	G						T								T	T			B		S	S	S			B		.	B				S	B									.		T	T				B	T	T	T	T	B	S		B					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																						.															.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.		.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
		578	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	E	K	R	T	G	N	M	M	Q	P	Q	L	A	D	K	I	R	K	R	T	E	K	Q	F	P	N	G	I	E	P	H	G	T	D	A	L	R	F	T	L	A	A	L	A	S	T	G	R	D	I	N	W	D	M	K	R	L	E	G	Y	R	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	V	F	P	A	D	Y	L	R	Y	Y	L	T	T	I	M	P	E	T	R	D	S	D	F	S	F	S	D	F	K	V	R	I	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	S												T			S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																														359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.