Job Description P07118 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:14 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 836 % Identity 23% Template c1wz2B_ PDB info PDB header:ligase/rna Chain: B: PDB Molecule:leucyl-trna synthetase; PDBTitle: the crystal structure of leucyl-trna synthetase and trna(leucine)2 complex Resolution 3.21 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.			.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.
Query SS confidence																								.	.
Query Sequence		N	P	Q	D	I	E	Q	P	L	Y	E	H	W	E	K	Q	G	Y	F	K	P	N	.	.	G	D	E	S	Q	E	S	F	C	I	M	I	P	P	P	N	V	T	G	S	L	H	M	G	H	A	F	Q	Q	T	I	M	D	T	M	I	R	Y	Q	R	M	Q	G	K	N	T	L	W	Q	V	G	T	D	H	A	G
Query Conservation																								.	.
Alig confidence																								.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	F	K	A	I	E	E	K	W	Q	K	R	W	L	E	A	K	I	F	E	P	N	I	R	D	K	P	K	E	K	K	F	Y	I	T	V	A	F	P	Y	L	S	G	H	L	H	V	G	H	A	R	T	Y	T	I	P	D	V	I	A	R	F	K	R	M	Q	G	Y	N	V	L	F	P	M	A	W	H	I	T	G
Template Known Secondary structure																		T	T	T	S			S	T	T	S		G	G	G			B							B		S	S			B																				T	T				B					B	B			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.								.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.			.	.	.	150	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.																																								.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.																																								.	.
Query Sequence		I	A	T	Q	M	V	V	E	R	K	I	A	A	E	E	G	K	T	R	H	D	Y	G	R	.	.	.	.	.	.	.	E	A	F	I	D	K	I	W	E	W	K	A	E	S	G	G	T	I	T	R	Q	M	R	R	L	G	N	S	V	D	W	E	R	E	R	F	T	M	D	.	.	E	G	L	S	N	A	V	K
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.																																								.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.																																								.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	P	I	V	G	I	A	E	R	I	K	N	R	D	P	K	T	I	W	I	Y	R	D	V	Y	K	V	P	E	E	I	L	W	T	F	E	D	P	I	N	I	V	K	Y	F	M	K	A	A	K	E	T	F	I	R	A	G	F	S	V	D	W	S	R	E	F	Y	T	T	S	L	F	P	P	F	S	K	F	I	E
Template Known Secondary structure		S											T	T										T	T	S									G	G	G	S																		T	T	T					T	T	S			B		S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.			.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.
Query SS confidence																																								.	.
Query Sequence		E	V	F	V	R	L	Y	K	E	D	L	I	Y	R	G	K	R	L	V	N	W	D	P	K	L	R	T	A	I	S	D	L	E	V	E	N	R	E	.	.	S	K	G	S	M	W	H	I	R	Y	P	L	A	D	G	A	K	T	A	D	G	K	D	Y	L	V	V	A	T	T	R	P	E	T	L	L	G	D	T	G
Query Conservation																																								.	.
Alig confidence																																								.	.																	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.
Template Sequence		W	Q	F	W	K	L	K	E	K	G	Y	I	V	K	G	A	H	R	V	R	W	D	P	V	V	G	T	P	L	G	D	H	D	L	M	E	G	E	D	V	P	I	L	D	Y	I	I	I	K	F	E	L	R	E	N	G	.	.	.	.	E	V	I	Y	L	P	A	A	T	L	R	P	E	T	V	Y	G	V	T	N
Template Known Secondary structure							T	T	T	T	T													T	T	T	S		B			S	S	S		S	S																			S	S	.	.	.	.	S									S		G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220					.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		233	.	.	.	.	.	.	240																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	A	V	N	P	E	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Y	K	D	L	I	G	K	Y	V	I	L	P	L	V	N	R	R	I	P	I	V	G	D	E	H	A	D	M	E	K	G	T	G
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	W	V	N	P	N	A	T	Y	V	K	A	K	V	R	R	K	D	K	E	E	T	W	I	V	S	K	E	A	A	Y	K	L	S	F	Q	D	R	E	I	E	V	I	E	E	F	K	G	E	K	L	I	G	K	Y	V	R	N	P	V	S	G	D	E	V	I	I	L	P	A	E	F	V	D	P	D	N	A	T	G
Template Known Secondary structure						S	S	S										S	S																		S	S											S	S	T	T	S	S						S	S	S	S									S	S			S	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.						.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.
Query Sequence		C	V	K	I	T	P	A	H	D	F	N	D	Y	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	K	R	H	A	L	P	M	I	N	I	L	T	F	D	G	D	I	R	E	S	A	Q	V	F	D	T	K	.	.	.	.	.	G	N	E	S	D	V	Y	S	S	E	I	P	A	E	F	Q
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	V	M	S	V	P	A	H	A	P	F	D	H	V	A	L	E	D	L	K	R	E	T	E	I	L	E	K	Y	D	I	D	P	R	I	V	F	P	A	V	E	E	V	N	K	L	G	I	K	S	Q	K	D	K	E	K	L	E	Q	A	T	K	T	I	Y	K	A	E	Y	H	K	G	I	F	K	V	P	P	Y	E
Template Known Secondary structure							T	T	S		T	T	T	T	T	T	T	S			S			S					T	T										S	S			T	T	T	S	S	S				S	S		T	T					T	T									S		B			S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	E	R	F	A	A	R	K	A	V	V	A	A	V	D	A	L	G	L	L	E	E	I	K	P	H	D	L	T	V	P	Y	G	D	R	G	G	V	V	I	E	P	M	L	T	D	Q	W	Y	V	R	A	D	V	L	A	K	P	A	V	E	A	V	E	N	G	D	I	Q	F	V	P	K	Q	Y	E	N	M	Y
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	K	P	V	Q	E	V	K	E	A	I	A	K	E	M	L	E	K	G	I	A	E	I	M	Y	E	F	A	E	K	N	V	I	S	R	F	G	N	R	A	V	I	K	I	I	H	D	Q	W	F	I	D	Y	G	N	P	E	W	K	E	K	A	R	K	A	L	E	R	M	K	I	L	P	E	T	R	R	A	Q	F
Template Known Secondary structure		S	S	B					T	T	T	T								T	S								S	S	S			B		S	S	S	S	B							S	S						S			T	T										T	T	S				S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.							.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.			.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.																.	.																									.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.																.	.																									.	.	.	.	.
Query Sequence		F	S	W	M	R	D	I	Q	D	W	C	I	S	R	Q	L	W	W	G	H	R	I	P	A	W	Y	D	E	.	.	.	.	.	.	A	G	N	V	Y	V	G	R	N	E	D	E	V	R	K	.	.	E	N	N	L	G	A	D	V	V	L	R	Q	D	E	D	V	L	D	T	W	F	S	S	A	.	.	.	.	.
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.																.	.																									.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.																.	.																									.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	A	I	I	D	W	L	D	K	K	A	C	A	R	K	I	G	L	G	T	P	L	P	W	D	P	E	W	V	I	E	S	L	S	D	S	T	I	Y	M	A	Y	Y	T	I	S	R	H	I	N	K	L	R	Q	E	G	K	L	D	P	E	K	L	T	P	E	F	F	D	Y	I	F	L	E	E	F	S	E	D	K
Template Known Secondary structure							S								B	S	S	S	S	S				T	T		T	T	S								T	T	S	T																T	T				G	G	G									T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		497	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.
			481	.	.	.	.	.	.	.	.	490						.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.											.	.	.	.	.
Query SS confidence		.											.	.	.	.	.
Query Sequence		.	L	W	T	F	S	T	L	G	W	P	.	.	.	.	.	E	N	T	D	A	L	R	Q	F	H	P	T	S	V	M	V	S	G	F	D	I	I	F	F	W	I	A	R	M	I	M	M	T	M	H	F	I	K	D	E	N	G	K	P	Q	V	P	F	H	T	V	Y	M	T	G	L	I	R	D	D	E	G	Q	K
Query Conservation		.											.	.	.	.	.
Alig confidence		.											.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	K	E	L	E	K	K	T	G	I	P	A	E	I	I	H	E	M	K	E	E	F	E	Y	W	Y	P	L	D	W	R	C	S	G	K	D	L	I	P	N	H	L	T	F	F	I	F	N	H	V	A	I	F	R	.	.	.	.	.	.	E	E	H	W	P	K	G	I	A	V	N	G	F	G	T	L	E	G	Q	K
Template Known Secondary structure										T																		S		S						G	G	G	T	T	T													S		.	.	.	.	.	.	S	T	T	S													S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		577	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630							.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650
		555	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	S	K	S	K	G	N	V	I	D	P	L	D	M	V	D	G	I	S	L	P	E	L	L	E	K	R	T	G	N	M	M	Q	P	Q	L	A	D	K	I	R	K	R	T	E	K	Q	F	P	N	G	I	E	P	H	G	T	D	A	L	R	F	T	L	A	A	L	A	S	T	G	R	D	I	N	W	D	M	K	R
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	S	K	S	K	G	N	V	L	N	F	I	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	E	N	G	A	D	V	V	R	L	Y	I	M	S	L	A	E	H	D	S	D	F	D	W	R	R	K	E
Template Known Secondary structure				T	T	T					B					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T															T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		651	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.
		635	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	E	G	Y	R	N	F	C	N	K	L	W	N	A	S	R	F	V	L	M	N	T	E	G	Q	D	C	G	F	N	G	G	E	M	T	L	S	L	A	D	R	W	I	L	A	E	F	N	Q	T	I	K	A	Y	R	E	A	L	D	S	F	R	F	D	I	A	A	G	I	L	Y	E	F	T	W	N	Q	F	C	D
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Template Sequence		V	G	K	L	R	K	Q	I	E	R	F	Y	E	L	I	S	Q	F	A	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	E	V	K	G	N	V	E	L	K	D	I	D	R	W	M	L	H	R	L	N	K	A	I	K	E	T	T	N	A	L	E	E	F	R	T	R	T	A	V	Q	W	A	F	Y	S	I	M	N	D	.	L	R
Template Known Secondary structure																					S	S	.	.	.	.	.	.	.																																T	T										T							.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Template SS confidence
		694	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.								.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.		.	.
		715	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	Y	L	E	L	T	K	P	V	M	N	G	G	T	E	A	E	L	R	G	T	R	H	T	L	V	T	V	L	E	G	L	L	R	L	A	H	P	I	I	P	F	I	T	E	T	I	W	Q	R	V	K	V	L	C	G	I	T	A	D	T	I	M	L	Q	P	F	P	Q	Y	D	A	S	Q	V	D	E	A	A	L
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		W	Y	L	R	R	T	E	G	R	.	.	.	.	.	.	.	D	D	E	A	K	R	Y	V	L	R	T	L	A	D	V	W	V	R	L	M	A	P	F	T	P	H	I	C	E	E	L	W	E	K	L	G	.	.	.	.	.	G	E	G	F	V	S	L	A	K	W	P	E	P	V	E	E	W	W	N	E	T	I	E
Template Known Secondary structure							T	T	T		.	.	.	.	.	.	.																					T	T	T	S											S	S	.	.	.	.	.			S		G	G	G	S							S	S
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		766	.	.	.	770	.	.	.	.								.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810						.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.
		795	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.		.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.
Query SS confidence																																				.
Query Sequence		A	D	T	E	W	L	K	Q	A	I	V	A	V	R	N	I	R	A	E	M	N	I	A	P	G	K	P	L	E	L	L	L	R	G	.	C	S	A	D	A	E	R	R	V	N	E	N	R	G	F	L	Q	T	L	A	R	L	E	S	I	T	V	L	P	A	D	D	K	G	P	V	S	V	T	K	I	I	D	G	A
Query Conservation																																				.
Alig confidence																																				.																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	E	E	E	F	I	R	S	V	M	E	D	I	K	E	I	I	E	V	A	K	I	E	N	A	K	R	A	Y	I	Y	T	A	E	D	W	K	W	K	V	A	E	V	V	S	E	K	R	D	F	K	S	S	M	E	E	L	M	K	D	S	E	I	R	K	H	G	K	E	V	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																				T	S					S	B								T	T	T	T	T	T	T					T	T	T		S	S	S								T	S	T	T	T	T	T	T	G	G	G	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		834	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.
		874	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	L	L	I	P	M	A	G	L	I	N	K	E	D	E	L	A	R	L	A	K	E	V	A	K	I	E	G	E	I	S	R	I	E	N	K	L	A	N	E	G	F	V	A	R	A	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	I	V	Q	K	L	I	K	E	R	T	F	D	V	K	R	I	N	E	E	K	A	L	R	E	A	K	E	F	M	E	K	E	L	G	I	E	I	I	I	N	P	T	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.						T	T								T	T							T	T	T									T	S	B				S		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Template SS confidence
						906	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.