Job Description P07118 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:14 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 524 % Identity 20% Template c1pfuA_ PDB info PDB header:ligase Chain: A: PDB Molecule:methionyl-trna synthetase; PDBTitle: methionyl-trna synthetase from escherichia coli complexed2 with methionine phosphinate Resolution 1.91 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		32	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	E	S	F	C	I	M	I	P	P	P	N	V	T	G	S	L	H	M	G	H	A	F	Q	Q	T	I	M	D	T	M	I	R	Y	Q	R	M	Q	G	K	N	T	L	W	Q	V	G	T	D	H	A	G	I	A	T	Q	M	V	V	E	R	K	I	A	A	E	E	G	K	T	R	H	D	Y	G	R	E	A	F	I
Query Conservation
Alig confidence																																																																.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	K	K	I	L	V	T	C	A	L	P	Y	A	N	G	S	I	H	L	G	H	M	L	E	H	I	Q	A	D	V	W	V	R	Y	Q	R	M	R	G	H	E	V	N	F	I	C	A	D	D	A	H	G	T	P	I	M	L	K	A	Q	Q	L	.	.	.	.	.	G	I	T	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													B	T	T	S			B																				T	T										B			S											.	.	.	.	.	T	S				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.						.	.	.	.	70
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	K	I	W	E	W	K	A	E	S	G	G	T	I	T	R	Q	M	R	R	L	G	N	S	V	D	W	E	R	E	R	F	T	M	D	E	G	L	S	N	A	V	K	E	V	F	V	R	L	Y	K	E	D	L	I	Y	R	G	K	R	L	V	N	W	D	P	K	L	R	T	A	I	S	D	L	E	V	E	N	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																								.	.
Template Conservation		.	.	.	.																								.	.
Template Sequence		.	.	.	.	Q	M	I	G	E	M	S	Q	E	H	Q	T	D	F	A	G	F	N	I	S	Y	D	N	.	.	Y	H	S	T	H	S	E	E	N	R	Q	L	S	E	L	I	Y	S	R	L	K	E	N	G	F	I	K	N	R	T	I	S	Q	L	Y	D	P	E	K	G	M	F	L	P	D	R	F	V	K	G	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.																	T	T				S		.	.				S	S	S																	T	T													T	T	T	T					G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																								.	.
Template SS confidence
						71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.			.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	S	K	G	S	M	W	H	I	R	Y	P	L	A	D	G	A	K	T	A	D	G	K	D	Y	L	V	V	A	T	T	R	P	E	T	L	L	G	D	T	G	V	A	V	N	P	E	D	P	R	Y	K	D	L	I	G	K	Y	V	I	L	P	L	V	N	R	R	I	P	I	V	G	D	E	H	A	D	M	E	K
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	G	C	V	K	I	T	P	A	H	D	F	N	D	Y	E	V	G	K	R	H	A	L	P	M	I	N	I	L	T	F	D	G	D	I	R	E	S	A	Q	V	F	D	T	K	G	N	E	S	D	V	Y	S	S	E	I	P	A	E	F	Q	K	L	E	R	F	A	A	R	K	A	V	V	A	A	V	D	A	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	C	P	K	C	K	S	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Y	G	D	N	C	E	V	C	G	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.		T	T	T			S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	B		T	T	T			B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									145	.	.	.	.	150	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.		430
Predicted Secondary structure																																																																																.
Query SS confidence																																																																																.
Query Sequence		G	L	L	E	E	I	K	P	H	D	L	T	V	P	Y	G	D	R	G	G	V	V	I	E	P	M	L	T	D	Q	W	Y	V	R	A	D	V	L	A	K	P	A	V	E	A	V	E	N	G	D	I	Q	F	V	P	K	Q	Y	E	N	M	Y	F	S	W	M	R	D	I	Q	D	W	C	I	S	R	Q	L	.	W
Query Conservation																																																																																.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																											.	.																														.
Template Conservation		.	.	.	.	.																																											.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	Y	S	P	T	E	L	I	E	P	K	S	V	V	S	G	A	T	P	V	M	R	D	S	E	H	F	F	F	D	L	P	S	F	S	E	M	L	Q	A	W	T	R	.	.	S	G	A	L	Q	E	Q	V	A	N	K	M	Q	E	W	F	E	S	G	L	Q	Q	W	D	I	S	R	D	A	P	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.			G	G	G							T	T	T																G	G	G	G										.	.	T	S		S																									S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																											.	.
Template SS confidence
							165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.			.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490					.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.														.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.	.														.	.	.
Query Sequence		W	G	H	R	I	P	A	W	Y	D	E	A	G	N	V	Y	V	G	R	N	E	D	E	V	R	K	E	N	N	L	G	A	D	V	V	L	R	Q	D	E	D	V	L	D	T	W	F	S	S	A	L	W	T	F	S	T	L	G	W	P	.	.	.	.	E	N	T	D	A	L	R	Q	F	H	P	T	S	.	.	.
Query Conservation																																																														.	.	.	.														.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.														.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	G	F	E	I	P	N	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	K	Y	F	Y	V	W	L	D	A	P	I	G	Y	M	G	S	F	K	N	L	C	D	K	R	G	D	S	V	S	F	D	E	Y	W	K	K	D	S	T	A
Template Known Secondary structure		S	S		B		T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T																									T		S	S							B	T	T			S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
				504	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	V	M	V	S	G	F	D	I	I	F	F	W	I	A	R	M	I	M	M	T	M	H	F	I	K	D	E	N	G	K	P	Q	V	P	F	H	T	V	Y	M	T	G	L	I	R	D	D	E	G	Q	K	M	S	K	S	K	G	N	V	I	D	P	L	D	M	V	D	G	I	S	L	P	E	L	L	E	K	R
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.																										.	.	.	.	.	.	.																.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.																.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	Y	H	F	I	G	K	D	I	V	Y	F	H	S	L	F	W	P	A	M	L	E	G	S	N	F	.	.	.	.	.	.	.	R	K	P	S	N	L	F	V	H	G	Y	V	T	V	N	.	G	A	K	M	S	K	S	R	G	T	F	I	K	A	S	T	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									G	G	G						T									T	T	B	.	.	.	.	.	.	.				S											T	.	T	B	S			T	T	T	T				B					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.																.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.								.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
		582	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620		.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640			.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.																					.	.
Query SS confidence																																									.																					.	.
Query Sequence		T	G	N	M	M	Q	P	Q	L	A	D	K	I	R	K	R	T	E	K	Q	F	P	N	G	I	E	P	H	G	T	D	A	L	R	F	T	L	A	A	.	L	A	S	T	G	R	D	I	N	W	D	M	K	R	L	E	G	Y	R	N	.	.	F	C	N	K	L	W	N	A	S	R	F	V	L	M	N	T	E	G
Query Conservation																																									.																					.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.																					.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	N	H	F	D	A	D	S	L	R	Y	Y	Y	T	A	K	L	S	S	R	I	D	D	I	D	L	N	L	E	D	F	V	Q	R	V	N	A	D	I	V	N	K	V	V	N	L	A	S	R	N	A	G	F	I	N	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S															S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																										347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
		659	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.				.	730	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.
Query Sequence		Q	D	C	G	F	N	G	G	E	M	T	L	S	L	A	D	R	W	I	L	A	E	F	N	Q	T	I	K	A	Y	R	E	A	L	D	S	F	R	F	D	I	A	A	G	I	L	Y	E	F	T	W	N	Q	F	C	D	W	Y	L	E	L	T	K	P	V	M	N	G	G	T	.	.	.	E	A	E	L	R	G	T
Query Conservation																																																																								.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.																																							.	.																			.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.																																							.	.
Template Sequence		R	F	D	G	V	L	A	S	.	.	.	.	E	L	A	D	P	Q	L	Y	K	T	F	T	D	A	A	E	V	I	G	E	A	W	E	S	R	E	F	G	K	A	V	R	E	I	M	A	L	A	.	.	D	L	A	N	R	Y	V	D	E	Q	A	P	W	V	V	A	K	Q	E	G	R	D	A	D	L	Q	A	I
Template Known Secondary structure			S	T	T	B			S	.	.	.	.	S		S											T										T	T														.	.																T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.																																							.	.
Template SS confidence
		403	.	.	.	.	.	.	410					.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.			.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
		736	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.					.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.
Query Sequence		R	H	T	L	V	T	V	L	E	G	L	L	R	L	A	H	P	I	I	P	F	I	T	E	T	I	W	Q	R	V	K	V	L	.	.	.	.	C	G	I	T	A	D	T	I	M	L	Q	P	F	P	Q	Y	D	A	S	Q	V	D	E	A	A	L	A	D	T	E	W	L	K	Q
Query Conservation																																			.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	S	M	G	I	N	L	F	R	V	L	M	T	Y	L	K	P	V	L	P	K	L	T	E	R	A	E	A	F	L	N	T	E	L	T	W	D	G	I	Q	Q	P	L	L	G	H	K	V	N	P	F	K	A	L	Y	N	R	I	D	M	R	Q	V	E	A	L	V	E	A	S	K
Template Known Secondary structure																	T	T	T													T	S				T	G	G	G	G	S				S		B					S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.