Job Description P00363 Confidence 99.61% Date Thu Jan 5 10:56:34 GMT 2012 Rank 109 Aligned Residues 376 % Identity 11% Template c2gewA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:cholesterol oxidase; PDBTitle: atomic resolution structure of cholesterol oxidase @ ph 9.02 (streptomyces sp. sa-coo) Resolution 0.97 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	A	D	L	A	I	V	G	A	G	G	A	G	L	R	A	A	I	A	A	A	Q	A	N	P	N	A	K	I	A	L	I	S	K	V	Y	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.
Template Sequence		Y	V	P	A	V	V	I	G	T	G	Y	G	A	A	V	S	A	L	R	L	G	E	A	G	.	.	V	Q	T	L	M	L	E	M	G	Q	L	W	N	Q	P	G	P	D	G	N	I	F	C	G	M	L	N	P	D	K	R	S	S	W	F	K	N	R	T	E	A	P	L	G	S	F	L	W	L	D	V	V	N	R
Template Known Secondary structure				S							S													T	T	.	.								S	S					S			T	T	S	S	S	S			T	T	S			G	G	G	S	B	S		S	B					T	T						G	G	G
Template Predicted Secondary structure																										.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.			.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
																										42	.	.	.	.	.	.	.	50	.												.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	R	S	H	T	V	A	A	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	A	A	V	A	Q	D	H	D	S	F	E	Y	H	F	H	D	T	V	A	G	G	D	W	L	C	E	Q	D	V	V	D	Y	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	I	D	P	Y	A	G	V	L	D	R	V	N	Y	D	Q	M	S	V	Y	V	G	R	G	V	G	G	G	S	L	V	N	G	G	M	A	V	E	P	K	R	S	Y	F	E	E	I	L	P	R	V	D	S	S	E	M	Y	D	R	Y	F	P	R	A	N	S	M	L	R	V	N	H	I	D	T	K	W	F	E	D
Template Known Secondary structure		B					B		S							S	S								S	T	T	G	G	G	G	T	S			B														T	T	S								T									T	T		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.				100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.									.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	H	H	C	P	T	E	M	T	Q	L	E	L	.	.	.	W	G	C	P	W	S	R	R	P	D	G	S	V	N	V	R	.	.	.	.	.	.	.	.	R	F	G	G	M	K	I	E	R	T	W	F	A	A	D	K	T	G	F	H	M	L	H	T	L	F	Q	T	S	L	Q	F	P	Q	I	Q	R	F	D	E
Query Conservation															.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	E	W	Y	K	F	A	R	V	S	R	E	Q	A	G	K	A	G	L	G	T	V	F	V	P	N	V	Y	D	F	G	Y	M	Q	R	E	A	A	G	E	V	P	K	S	A	L	A	T	E	V	I	Y	G	N	N	H	G	K	Q	S	L	D	K	T	Y	L	A	A	A	L	G	T	G	K	V	T	I	Q	T	L
Template Known Secondary structure			G	G	G													T	T								B	S	B										T	T	S	S			S	G	G	G	T		S	T	T			S	S	S	B			T	T	T	T								T	T	S						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.					.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	F	V	L	D	I	L	V	D	D	G	H	V	R	G	L	V	A	M	N	M	.	.	.	.	M	E	G	T	L	V	Q	I	R	A	N	A	V	V	M	A	T	G	G	A	G	R	V	Y	R	Y	N	T	N	G	G	I	V	T	G	D	G	M	G	M	A	L	S	H	G	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																							.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	Q	V	K	T	I	R	Q	T	K	D	G	G	Y	A	L	T	V	E	Q	K	D	T	D	G	K	L	L	A	T	K	E	I	S	C	R	Y	L	F	L	G	A	G	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	T	E	L	L	V	R	A	R	D	T	G	T	L	P	N	L	N	S
Template Known Secondary structure											T	T	S	S										T	T												S						S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T	S	S	T	T			T
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.																.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
								224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	L	R	D	M	E	F	V	Q	Y	H	P	T	G	L	P	G	S	G	I	L	M	T	E	G	C	R	G	E	G	G	I	L	V	N	K	N	G	Y	R	Y	L	Q	D	Y	G	M	G	P	E	T	P	L	G	E	P	K	N	K	Y	M	E	L	G	P	R	D	K	V	S	Q	A	F	W	H
Query Conservation		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																																																				.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	V	G	A	G	W	G	P	N	G	N	I	M	T	A	R	A	N	H	M	W	N	P	T	G	A	H	Q	S	S	I	P	A	L	G	I	D	A	W	D	N	S	D	S	S	V	F	A	E	I	A	P	M	P	A	G	L	E	T	W	V	S	L	Y	L	A	I	T	K	N	P	Q	R	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T			B	B		T	T										T	T	S				S				S	S										S	S	T	T										T	T	S	S																	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.												.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	W	R	K	G	N	T	I	S	T	P	R	G	D	V	V	Y	L	D	L	R	H	L	G	E	K	K	L	H	E	R	L	P	F	I	C	E	L	A	K	A	Y	V	G	V	D	P	V	K	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	V	R	P	T	A	H	Y	T	M	G	G	I	E	T	D	Q
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Conservation		.	.	.	.																																																																								.
Template Sequence		.	.	.	.	G	T	F	V	Y	D	A	A	T	D	R	A	K	L	N	W	T	R	D	Q	N	A	P	A	V	N	A	A	K	A	L	F	D	R	I	N	K	A	N	G	T	I	Y	R	Y	D	L	F	G	T	Q	L	K	A	F	A	D	D	F	C	Y	H	P	L	G	G	C	V	L	G	K	.	A	T	D	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	B						T	T	T	T								G	G	G	G																			T					S	S	S	S	S	S	S			S				S			S	S		B		S	S		T	T	T	.	T	B		T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																																																								.
Template SS confidence
						386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.		.	.	.	460
		367	.	.	370		.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.
Query SS confidence						.
Query Sequence		N	C	E	T	.	R	I	K	G	L	F	A	V	G	E	C	S	S	V	G	L	H	G	A	N	R	L	G	S	N	S	L	A	E	L	V	V	F	G	R	L	A	G	E	Q	A	T	E	R
Query Conservation						.
Alig confidence						.																						.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	G	R	V	A	G	Y	K	N	L	Y	V	T	D	G	S	L	I	P	G	S	V	G	V	N	P	.	.	.	.	.	F	V	T	I	T	A	L	A	E	R	N	V	E	R	I	I	K	Q
Template Known Secondary structure		T	S	B	B	T	T		S	S					S	G	G	G	S		S			S	S		S	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		461	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.						.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.