Job Description P00363 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:56:34 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 543 % Identity 22% Template c2fjaC_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: C: PDB Molecule:adenylylsulfate reductase, subunit a; PDBTitle: adenosine 5'-phosphosulfate reductase in complex with2 substrate Resolution 2.00 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.					.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.								.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	T	F	Q	A	D	L	A	I	V	G	A	G	G	A	G	L	R	A	A	I	A	A	A	Q	.	.	.	.	A	N	P	N	A	K	I	A	L	I	S	K	V	Y	P	M	R	S	H	T	V	A	A	E	G	G	S	A	A	V	A	.	.	.	.	.	.	.	Q	D	H	D	S	F	E	Y	H	F	H	D	T
Query Conservation																											.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.			.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.
Template Sequence		E	V	V	E	T	D	I	L	I	I	G	G	G	F	S	G	C	G	A	A	Y	E	A	A	Y	W	A	K	L	G	G	.	.	L	K	V	T	L	V	E	K	A	A	V	E	R	S	G	A	V	A	Q	G	L	S	A	I	N	T	Y	I	D	L	T	G	R	S	E	R	Q	N	T	L	E	D	Y	V	R	Y	V
Template Known Secondary structure							S							S															G	G	G	T	.	.								S	S		T	T	T		S	T	T	S	S						S					S	S	S	S	B	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.
Template SS confidence
		2019	2020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2040	.	.	.	.	.	.	.	.	.			2050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2090	.	.	.	.	.	.
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.		.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.
Query SS confidence																																																																															.
Query Sequence		V	A	G	G	D	W	L	C	E	Q	D	V	V	D	Y	F	V	H	H	C	P	T	E	M	T	Q	L	E	L	W	G	C	P	W	S	R	R	P	D	G	S	V	N	V	R	R	F	G	G	M	K	I	E	R	T	W	F	A	A	D	K	T	G	F	H	M	L	H	T	L	F	Q	T	S	L	Q	F	.	P	Q
Query Conservation																																																																															.
Alig confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	L	D	M	M	G	L	A	R	E	D	L	V	A	D	Y	A	R	H	V	D	G	T	V	H	L	F	E	K	W	G	L	P	I	W	K	T	P	D	G	K	Y	V	R	E	G	Q	W	Q	I	M	I	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	S	Y	K	P	I	I	A	E	A	A	K	M	A	V	G	E
Template Known Secondary structure					T	T	T																								T	T			B		B		T	T	S		B		B	S	S	S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T															G
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2097	.	.	2100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2140	.	.	.	.	.	.	.	.	.										2150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2160	.	.	.	.	.	.	.
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.				.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.										.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	Q	R	F	D	E	H	F	V	L	D	I	L	V	D	D	.	.	.	G	H	V	R	G	L	V	A	M	N	M	M	E	G	T	L	V	Q	I	R	A	N	A	V	V	M	A	T	G	G	A	G	R	V	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	N	T	N	G	G	I	V	T	G	D	G	M	G	M	A
Query Conservation																		.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	N	I	Y	E	R	V	F	I	F	E	L	L	K	D	K	N	D	P	N	A	V	A	G	A	V	G	F	S	V	R	E	P	K	F	Y	V	F	K	A	K	A	V	I	L	A	T	G	G	A	T	L	L	F	R	P	R	S	T	G	E	A	A	G	R	T	W	Y	A	I	F	D	T	G	S	G	Y	Y	M	G
Template Known Secondary structure		G	G				S										T	T		T	T	B									S	S	S	S								S									B		S	S	S			S			S	G	G	G	G			S	S		T	T		B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2168	.	2170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2240	.	.	.	.	.	.	.
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	S	H	G	V	P	L	R	D	M	E	F	V	Q	Y	H	P	T	G	L	P	G	S	G	I	L	M	T	E	G	C	R	G	E	G	G	I	L	V	N	K	N	G	Y	R	Y	L	Q	D	Y	G	M	G	P	E	T	P	L	G	E	P	K	N	K	Y	M	E	L	G	P	R	D	K	V	S	Q	A	F	W	H
Query Conservation
Alig confidence														.																																												.	.	.
Template Conservation														.																																												.	.	.
Template Sequence		L	K	A	G	A	M	L	T	Q	F	E	H	.	R	F	I	P	F	R	F	K	D	G	Y	G	P	V	G	A	W	F	L	F	F	K	C	K	A	K	N	A	Y	G	E	E	Y	I	K	T	R	A	A	E	L	E	K	.	.	.	Y	K	P	Y	G	A	A	Q	P	I	P	T	P	L	R	N	H	Q	V	M	L
Template Known Secondary structure					T					S	T	T		.		B						T	T	T										T	S							T	T	S							T	S	G	G	G	T	T	.	.	.	S	T	T	G	G	G		S	S
Template Predicted Secondary structure														.																																												.	.	.
Template SS confidence
		2248	.	2250	.	.	.	.	.	.	.	.	.		2260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2300	.	.				.	.	.	.	.	.	.	2310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2320	.	.	.
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340											.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Query Sequence		E	W	R	K	G	N	T	I	S	T	P	R	G	D	V	V	Y	L	D	L	R	H	L	G	E	K	K	L	H	E	R	L	P	F	I	C	E	L	A	K	A	Y	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	D	P	V	K	E	P	I	P	V	R	P	T	A	H	Y	T	M	G	G	I	.	.	.	.	.
Query Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Alig confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	I	M	D	G	N	Q	P	I	Y	M	H	T	E	E	A	L	A	E	L	A	G	G	D	K	K	K	L	K	H	I	Y	E	E	A	F	E	D	F	L	D	M	T	V	S	Q	A	L	L	W	A	C	Q	N	I	D	P	Q	E	Q	P	S	E	A	A	P	A	E	P	Y	I	M	G	S	H	S	G	E	A	G
Template Known Secondary structure					T	T																	T	T																		T	T											T	T			T	T	T	S										B	B		S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2324	.	.	.	.	.	2330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2400	.	.	.
																				363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	D	Q	N	C	E	T	R	I	K	G	L	F	A	V	G	E	C	S	S	V	G	L	H	G	A	N	R	L	G	S	N	S	L	A	E	L	V	V	F	G	R	L	A	G	E	Q	A	T	E	R	A	A	T	A	G	N	G	N	E	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.									.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.									.	.	.	.
Template Sequence		F	W	V	C	G	P	E	D	L	M	P	E	E	Y	A	K	L	F	P	L	K	Y	N	R	M	T	T	V	K	G	L	F	A	I	G	D	C	A	G	A	.	.	.	N	P	H	K	F	S	S	G	.	.	.	.	S	F	T	E	G	R	I	A	A	K	A	A	V	R	F	I	L	E	Q	K	P	N	P	E	I
Template Known Secondary structure								T	T	T							T	T		S	S			T	T	B		S	S	B	T					G	G	G	B		S	.	.	.									.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.									.	.	.	.
Template SS confidence
		2404	.	.	.	.	.	2410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2440	.	.	.				.	.	.	.	.	.	2450	.					.	.	.	.	.	.	.	.	2460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2470	.	.	.	.	.	.
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.															.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.						.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Query Sequence		A	I	E	A	Q	A	A	G	V	E	Q	R	L	K	D	L	V	N	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	G	E	N	W	A	K	I	R	D	E	M	G	L	A	M	E	E	G	C	G	I	Y	.	.	.	.	.	R	T	P	E	L	M	Q	K	T	I	D	K	L	A	E	L	Q	E
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Alig confidence			.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template Conservation			.
Template Sequence		D	.	D	A	V	V	E	E	L	K	K	K	A	Y	A	P	M	E	R	F	M	Q	Y	K	D	L	S	T	A	D	D	V	N	P	E	Y	I	L	P	W	Q	G	L	V	R	L	Q	K	I	M	D	E	Y	A	A	G	I	A	T	I	Y	K	T	N	E	K	M	L	Q	R	A	L	E	L	L	A	F	L	K	E
Template Known Secondary structure			.																						G	G	G		S	S	T	T			S	S		B																	T	T		G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure			.
Template SS confidence
		2477		.	.	2480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2550	.	.	.	.	.
		486	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530			.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.		.	.	560	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.																												.
Query SS confidence																																															.	.																												.
Query Sequence		R	F	K	R	V	R	I	T	D	T	S	S	V	F	N	T	D	L	L	Y	T	I	E	L	G	H	G	L	N	V	A	E	C	M	A	H	S	A	M	A	R	K	E	S	R	.	.	G	A	H	Q	R	L	D	E	G	C	T	E	R	D	D	V	N	F	L	K	H	T	L	A	F	R	D	.	A	D	G	T	T
Query Conservation																																															.	.																												.
Alig confidence											.	.	.	.	.																																.	.								.	.																			.
Template Conservation											.	.	.	.	.																																									.	.
Template Sequence		D	L	E	K	L	A	A	R	D	.	.	.	.	.	L	H	E	L	M	R	A	W	E	L	V	H	R	V	W	T	A	E	A	H	V	R	H	M	L	F	R	K	E	T	R	W	P	G	Y	Y	Y	R	T	D	.	.	Y	P	E	L	N	D	E	E	W	K	C	F	V	C	S	K	Y	D	A	E	K	D	E	W
Template Known Secondary structure				T	T	B			S	S	.	.	.	.	.																													S		S		T	T	T				T	T	.	.	S		S			T	T	T											T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.																																									.	.
Template SS confidence
		2556	.	.	.	2560	.	.	.	.						.	.	.	.	.	2570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2600	.	.	.	.			.	.	.	.	.	2610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2620	.	.	.	.	.	.	.	.
		563	.	.	.	.	.	.	570	.				.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.
Query SS confidence											.	.	.
Query Sequence		R	L	E	Y	S	D	V	K	I	.	.	.	T	T	L
Query Conservation											.	.	.
Alig confidence											.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	F	E	K	V	P	Y	V	Q	V	I	E	W	S	F
Template Known Secondary structure												S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2629	2630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2640	.	.	.