Job Description P76052 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:52 GMT 2012 Rank 27 Aligned Residues 365 % Identity 17% Template c3mruB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:aminoacyl-histidine dipeptidase; PDBTitle: crystal structure of aminoacylhistidine dipeptidase from vibrio2 alginolyticus Resolution 3.00 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		12	.	.	.	.	.	.		.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.			.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.																																																		.	.
Query SS confidence									.																																																		.	.
Query Sequence		I	E	A	D	R	Q	R	.	Y	T	D	I	A	D	Q	I	W	D	H	P	E	T	R	F	E	E	F	W	S	A	E	H	L	A	S	A	L	E	S	A	G	F	T	V	T	R	N	V	G	N	I	P	N	A	F	I	A	.	.	S	F	G	Q	G	K	P	V	I	A	L	L	G	E	Y	D	A	L	A	G	L
Query Conservation									.																																																		.	.
Alig confidence									.																																																		.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	S	T	L	S	P	A	P	L	W	Q	F	F	D	K	I	C	S	I	P	H	P	S	K	H	E	E	A	L	A	Q	Y	I	V	T	W	A	T	E	Q	G	F	D	V	R	R	D	P	T	G	N	V	F	I	K	K	P	A	T	P	G	M	E	N	K	K	G	V	V	L	Q	A	H	I	D	M	V	P	Q	K
Template Known Secondary structure		G	G	G	S	S	S											T	T	S			B	T	T														T	T	T	T							T	T	S										S	S			S	B											B				B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		89	90	.					.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.
Query Sequence		S	Q	Q	.	.	.	.	A	G	C	A	Q	P	T	S	V	T	P	G	E	N	G	H	G	C	G	H	N	L	L	G	T	A	A	F	A	A	A	I	A	V	K	K	W	L	E	Q	Y	G	Q	G	G	T	V	R	F	Y	G	C	P	G	E	E	G	G	S	G	K	T	F	M	V	R	E	G	V	F	D	D	V
Query Conservation					.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.																																																																							.
Template Conservation																																																																															.
Template Sequence		N	E	D	T	D	H	D	F	T	Q	D	P	I	Q	P	Y	I	D	G	E	W	V	T	A	K	G	T	T	L	G	A	D	N	G	I	G	M	A	S	C	L	A	V	L	A	S	K	E	I	K	H	G	P	I	E	V	L	L	T	I	D	E	E	A	G	M	T	G	A	F	G	L	E	A	G	W	L	.	K	G
Template Known Secondary structure			S	S					T	T	T	S								T	T					S	S	B																		T		S	S				S								S		S	S	S	T	T					S			T	T	S		.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.		.	.
		165	.	.	.	.	170	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.		.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.		.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.														.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.														.
Query Sequence		D	A	A	L	T	W	H	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	F	A	G	M	F	N	T	R	T	L	A	N	I	Q	A	S	W	R	F	K	G	.	I	A	A	H	A	A	N	S	P	H	L	G	R	.	S	A	L	D	A	V	T	L	M	T	T	G	T	N	F	L	N
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.														.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.														.
Template Conservation
Template Sequence		D	I	L	L	N	T	D	S	E	Q	E	G	E	V	Y	M	G	C	A	G	G	I	D	G	A	M	T	F	D	I	T	R	D	A	I	P	A	G	F	I	T	R	Q	L	T	L	K	G	L	K	G	G	H	S	G	C	D	I	H	T	G	R	G	N	A	N	K	L	I	G	R	F	L	A	G	H	A	Q	E	L
Template Known Secondary structure		S										T	T																									T	T															B	T	T	T	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
		226	.																																																	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	I	E	K	A	R	V	H	Y	A	I	T	N	S	G	G	I	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	L	R	L	V	E	F	R	G	G	S	L	R	N	A	I	P	R	E	A	F	V	T	V	A	L	P	A	E	N	Q	D	K	L	A	E	L	F	N	Y	Y	T	E	L	L	K	T	E	L	G	K	I	E	T	D	I	V	T	F	N	E	E	V	A	T	D	A	Q	V	F	A	I	A	D	Q	Q	R	F	I	A
Template Known Secondary structure		T										S		T	T	B													G	G	G																				T	T	T															S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
																															247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	V	V	Q	A	Q	A	E	V	L	Y	L	I	R	A	P	E	M	T	D	V	Q	H	I	Y	D	R	V	A	K	I	A	E	G	A	A	L	M	T	E	T	T	V	E	C	R	F	D	K	A	C
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	N	A	C	P	N	G	V	M	R	M	S	D	E	V	E	G	V	V	E	T	S	L	N	V	G	V	I	T	T	E	E	N	K	V	T	V	L	C	L	I	R	S	L	I	D	S	G	R	S	Q	V	E	G	M	L	Q	S	V	A	E	L	.	.	.	.	A	G	A	Q	I	E	F	S	G	A	Y	P	G
Template Known Secondary structure						S			S						S	S	S	T	T															T	T											S	S																		.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.					390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	S	Y	L	P	N	R	T	L	E	N	A	M	Y	Q	A	L	S	H	F	G	T	P	E	W	N	S	E	E	L	A	F	A	K	Q	I	Q	A	T	L	T	S	N	D	R	Q	N	S	L	N	N	I	A	A	T	G	G	E	N	G	K	V	F	A	L	R	H	R	E	T	V	L	A	N	E	V	A	P	Y	A
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	K	P	D	A	D	S	E	I	M	A	I	F	R	D	M	Y	E	G	I	Y	G	H	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		B				S	S									T	T	T	T	T	T			S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	T	D	N	V	L	A	A	S	T	D	V	G	D	V	S	W	K	L	P	V	A	Q	C	F	S	P	C	F	A	V	G	T	P	L	H	T	W	Q	L	V	S	Q	G	R	T	S	I	A	H	K	G	M	L	L	A	A	K	T	M	A	A	T	T	V	N	L
Query Conservation
Alig confidence																								.																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.																		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	N	I	M	V	I	H	A	G	L	E	C	G	L	F	K	E	P	Y	P	N	M	.	D	M	V	S	F	G	P	T	I	K	F	P	H	S	P	D	E	.	.	.	.	.	.	K	V	K	I	D	T	V	Q	L	F	W	D	Q	M	V	A	L	L	E	A	I
Template Known Secondary structure								S	S			G	G	G	G	G	G	S	S	S	S			.											S	T	T	S	T	T		.	.	.	.	.	.																				T
Template Predicted Secondary structure																								.																		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		427	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.		.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.							.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.