Job Description P76052 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:52 GMT 2012 Rank 28 Aligned Residues 345 % Identity 14% Template c2qyvB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:xaa-his dipeptidase; PDBTitle: crystal structure of putative xaa-his dipeptidase (yp_718209.1) from2 haemophilus somnus 129pt at 2.11 a resolution Resolution 2.11 Å

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		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.						.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	R	Y	T	D	I	A	D	Q	I	W	D	H	P	E	T	R	F	E	E	F	W	S	A	E	H	L	A	S	A	L	E	S	A	G	F	T	V	T	R	N	V	G	N	I	P	N	A	F	I	A	S	F	G	Q	G	K	.	.	.	.	.	P	V	I	A	L	L	G	E	Y	D	A	L	A	G	L	S	Q	Q
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.
Alig confidence																																														.	.	.											.	.	.	.	.														.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.																													.	.	.	.	.
Template Sequence		K	L	L	W	Q	W	F	D	Q	I	C	A	I	P	H	P	S	Y	K	E	E	Q	L	A	Q	F	I	I	N	W	A	K	T	K	G	F	F	A	E	R	D	E	V	G	.	.	.	N	V	L	I	R	K	P	A	T	V	G	X	E	N	R	K	P	V	V	L	Q	A	H	L	D	X	V	P	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														S			B	T	T																T	T							T	T		.	.	.										T	T		T	T	B									S		B			.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.				.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	C	A	Q	P	T	S	V	T	P	G	E	N	G	H	G	C	G	H	N	L	L	G	T	A	A	F	A	A	A	I	A	V	K	K	W	L	E	Q	Y	G	Q	G	G	T	V	R	F	Y	G	C	P	G	E	E	G	G	S	G	K	T	F	M	V	R	E	G	V	F	D	D	V	D	A	A	L	T	W	H
Query Conservation
Alig confidence		.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	Q	Q	D	P	I	L	P	Y	I	D	G	D	W	V	K	A	K	G	T	T	L	G	A	D	N	G	I	G	X	A	S	A	L	A	V	L	E	S	N	D	I	A	H	P	E	L	E	V	L	L	T	X	T	E	E	R	G	X	E	G	A	I	G	L	R	P	N	W	L	R	S	E	I	L	I	N	T	D	T
Template Known Secondary structure		.											S	S					T	T	B																				S	S				S	S							S		T	T	T	T						T			S	S					S
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.		.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Query Sequence		P	E	A	F	A	G	M	F	N	T	R	T	L	A	N	I	Q	A	S	W	R	F	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	A	H	A	A	N	S	P	H	L	G	R	.	S	A	L	D	A	V	T	L	M	T	T	G	T	N	F	L	N	E	H	I	I	E	K	A
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Alig confidence													.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.																						.	.	.
Template Conservation													.	.																																																																	.	.	.
Template Sequence		E	E	N	G	E	I	Y	I	G	C	A	.	.	G	G	E	N	A	D	L	E	L	P	I	E	Y	Q	V	N	N	F	E	H	C	Y	Q	V	V	L	K	G	L	R	G	G	H	S	G	V	D	I	H	T	G	R	A	N	A	I	K	V	L	L	R	F	L	A	E	L	Q	Q	N	Q	P	H	F	D	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T								.	.																			S														B	T	T	T	T	T	T	S	S																				T	T			.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.																																																																	.	.	.
Template SS confidence
		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.			.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	V	H	Y	A	I	T	N	S	G	G	I	S	P	N	V	V	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	F	T	L	A	N	I	R	G	G	S	I	R	N	A	I	P	R	E	S	V	A	T	L	V	F	N	G	D	I	T	V	L	Q	S	A	V	Q	K	F	A	D	V	I	K	A	E	L	A	L	T	E	P	N	L	I	F	T	L	E	K	V	E	K	P	Q	Q	V	F	S	S	Q	C	T	K	N	I	I	H
Template Known Secondary structure		.	.										S		T	T	B													S																					T	T	T		T	T												S
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
																																				252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A	E	V	L	Y	L	I	R	A	P	E	M	T	D	V	Q	H	I	Y	D	R	V	A	K	I	A	E	G	A	A	L	M	T	E	T	T	V	E	C	R	F	D	K	A	C
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.
Template Sequence		C	L	N	V	L	P	N	G	V	V	R	N	S	D	V	I	E	N	V	V	E	T	S	L	S	I	G	V	L	K	T	E	D	N	F	V	R	S	T	X	L	V	R	S	L	I	E	S	G	K	S	Y	V	A	S	L	L	K	S	L	A	S	.	.	.	.	L	A	Q	G	N	I	N	L	S	G	D	Y	P	G
Template Known Secondary structure															S	S	S	T	T															T	T											S	S																	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.					.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	S	Y	L	P	N	R	T	L	E	N	A	M	Y	Q	A	L	S	H	F	G	T	P	E	W	N	S	E	E	L	A	F	A	K	Q	I	Q	A	T	L	T	S	N	D	R	Q	N	S	L	N	N	I	A	A	T	G	G	E	N	G	K	V	F	A	L	R	H	R	E	T	V	L	A	N	E	V	A	P	Y	A
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	E	P	Q	S	H	S	D	I	L	D	L	T	K	T	I	Y	A	Q	V	L	G	T	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		B				S																	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	T	D	N	V	L	A	A	S	T	D	V	G	D	V	S	W	K	L	P	V	A	Q	C	F	S	P	C	F	A	V	G	T	P	L	H	T	W	Q	L	V	S	Q	G	R	T	S	I	A	H	K	G	M	L	L	A	A	K	T	M	A	A	T	T	V	N	L
Query Conservation
Alig confidence																								.																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.																		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	E	I	K	V	I	H	A	G	L	E	C	G	L	L	K	K	I	Y	P	T	I	.	D	X	V	S	I	G	P	T	I	R	N	A	H	S	P	D	E	.	.	.	.	.	.	K	V	H	I	P	A	V	E	T	Y	W	K	V	L	T	G	I	L	A	H	I
Template Known Secondary structure								S	S			T									T	T	S	.											S	T	T	S	T	T		.	.	.	.	.	.																				T
Template Predicted Secondary structure																								.																		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.		.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.							.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.