Job Description P76052 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:52 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 378 % Identity 12% Template c2pokB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:peptidase, m20/m25/m40 family; PDBTitle: crystal structure of a m20 family metallo peptidase from streptococcus2 pneumoniae Resolution 1.90 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.		.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.				.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.				70	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.																						.	.	.																																		.	.	.
Query SS confidence																	.																						.	.	.																																		.	.	.
Query Sequence		M	Q	E	I	Y	R	F	I	D	D	A	I	E	A	D	.	R	Q	R	Y	T	D	I	A	D	Q	I	W	D	H	P	E	T	R	F	E	E	.	.	.	F	W	S	A	E	H	L	A	S	A	L	E	S	A	G	F	T	V	T	R	N	V	G	N	I	P	N	A	F	I	A	S	F	.	.	.	G	Q	G	K
Query Conservation																	.																						.	.	.																																		.	.	.
Alig confidence																	.																						.	.	.																																		.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	P	S	E	Q	E	Q	I	E	K	F	E	K	D	H	V	A	Q	H	Y	F	E	V	L	R	T	L	I	S	K	K	S	V	F	A	Q	Q	V	G	L	K	E	V	A	N	Y	L	G	E	I	F	K	R	V	G	A	E	V	E	I	D	E	S	Y	T	A	P	F	V	M	A	H	F	K	S	S	R	P	D	A
Template Known Secondary structure																															S			B	T	T	T	T	B	S															T	T								S	S	S	S												T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.		.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.		.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
Predicted Secondary structure															.																																															.
Query SS confidence															.																																															.
Query Sequence		P	V	I	A	L	L	G	E	Y	D	A	L	A	.	G	L	S	Q	Q	A	G	C	A	Q	P	T	S	V	T	P	G	E	N	G	H	G	C	G	H	N	L	L	G	T	A	A	F	A	A	A	I	A	V	K	K	W	L	E	Q	Y	.	G	Q	G	G	T	V	R	F	Y	G	C	P	G	E	E	G	G	S	G
Query Conservation															.																																															.
Alig confidence															.																																															.
Template Conservation
Template Sequence		K	T	L	I	F	Y	N	H	Y	D	T	V	P	A	D	G	D	Q	V	W	T	E	D	P	F	T	L	S	V	R	N	G	F	M	Y	G	R	G	V	D	D	D	K	G	H	I	T	A	R	L	S	A	L	R	K	Y	M	Q	H	H	D	D	L	P	V	N	I	S	F	I	M	E	G	A	E	E	S	A	S	T
Template Known Secondary structure																	S	S				S	S		T	T	S					T	T				S	T	T	T	T	T	T															T	T	T		S	S		S	S								S		G	G	G	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.							.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.			.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.																												.	.																								.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.																												.	.																								.	.
Query Sequence		K	T	F	M	V	R	E	G	V	F	D	D	V	D	A	A	L	T	W	H	.	.	.	.	.	.	P	E	A	F	A	G	M	F	N	T	R	T	L	A	N	I	Q	A	S	W	R	F	K	G	I	A	A	.	.	H	A	A	N	S	P	H	L	G	R	S	A	L	D	A	V	T	L	M	T	T	G	T	.	.
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.																												.	.																								.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.																												.	.					.																			.	.
Template Conservation																																																													.
Template Sequence		D	L	D	K	Y	L	E	K	H	A	D	K	L	R	G	A	D	L	L	V	W	E	Q	G	T	K	N	A	L	E	Q	L	E	I	S	G	G	N	K	G	I	V	T	F	D	A	K	V	K	S	A	D	V	D	I	H	S	S	Y	.	G	G	V	V	E	S	A	P	W	Y	L	L	Q	A	L	Q	S	L	R	A
Template Known Secondary structure		T									G	G	G	T	T	T		S					S			B	B		T	T	S								B	B												S	S	S				G	G	G	.	T	T	T	S														T	B
Template Predicted Secondary structure																																																													.
Template SS confidence
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.		.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
																																																					222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.				.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	F	L	N	E	H	I	I	E	K	A	R	V	H	Y	A	I	T	N	S	G	.	.	.	G	I	S	P	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	D	G	R	I	L	V	E	G	L	Y	E	E	V	Q	E	P	N	E	R	E	M	A	L	L	E	T	Y	G	Q	R	N	P	E	E	V	S	R	I	Y	G	L	E	L	P	L	L	Q	E	E	R	M	A	F	L	K	R	F	F	F	D	P	A	L	N	I	E	G	I	Q	S	G	Y	Q	G	Q	G	V	K	T
Template Known Secondary structure		T	T	S		B			T	T	T	G	G	G																S		S		T								T			S			S	S		S											S											S			S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	Q	A	Q	A	E	V	L	Y	L	I	R	A	P	E	M	T	D	V	Q	H	I	Y	D	R	V	A	K	I	A	E	G	A	A	L	M	T	E	T	T	V	E	C	R	F	D	K	A	C	S	S	Y	L	P	N	R	T	L	E	N	A	M	Y	Q	A	L	S	H	F	G	T	P	E	W	N	S	E	E	L
Query Conservation
Alig confidence																																							.																																								.	.	.
Template Conservation																																							.																																								.	.	.
Template Sequence		I	L	P	A	E	A	S	A	K	L	E	V	R	L	V	P	G	L	E	P	H	D	V	L	E	K	I	R	K	Q	L	D	K	N	G	F	D	.	K	V	E	L	Y	Y	T	L	G	E	M	S	Y	R	S	D	M	S	A	P	A	I	L	N	V	I	E	L	A	K	K	F	Y	P	Q	G	V	S	V	.	.	.
Template Known Secondary structure					S												T	T																	T	T		T	.	T												B				S													T	T	T		T	T					.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																							.																																								.	.	.
Template SS confidence
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.		.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	F	A	K	Q	I	Q	A	T	L	T	S	N	D	R	Q	N	S	L	N	N	I	A	A	T	G	G	E	N	G	K	V	F	A	L	R	H	R	E	T	V	L	A	N	E	V	A	P	Y	A	A	T	D	N	V	L	A	A	S	T	D	V	G	D	V	S	W	K	L	P	V	A	Q	C	F	S	P	C	F	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	T	T	A	G	T	G	P	M	H	T	V	F	D	A	L	E	V	P	M	V	A	F	G	L	G	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S			S	S	B		T														B			S	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																						398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	G	T	P	L	H	T	W	Q	L	V	S	Q	G	R	T	S	I	A	H	K	G	M	L	L	A	A	K	T	M	A	A	T	T
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	N	S	R	D	H	G	G	D	E	.	.	.	.	.	.	N	V	R	I	A	D	Y	Y	T	H	I	E	L	V	E	E	L	I
Template Known Secondary structure		T	T			T	T	S	T	T		.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.							.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.