Job Description P76052 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:17:52 GMT 2012 Rank 22 Aligned Residues 366 % Identity 15% Template c1lfwA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:pepv; PDBTitle: crystal structure of pepv Resolution 1.80 Å

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		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.													.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	D	D	A	I	E	A	D	R	Q	R	Y	T	D	I	A	D	Q	I	W	D	H	P	E	T	R	F	E	E	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	S	A	E	H	L	A	S	A	L	E	S	A	G	F	T	V	T	R	N	V	G	N	I	P	N	A	F	I	A	S	F	G	Q	G	K	P	V
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.
Template Sequence		F	K	E	L	A	E	A	K	K	D	A	I	L	K	D	L	E	E	L	I	A	I	D	S	S	E	D	L	E	N	A	T	E	E	Y	P	V	G	K	G	P	V	D	A	M	T	K	F	L	S	F	A	K	R	D	G	F	D	T	E	N	F	A	N	Y	A	.	.	.	G	R	V	N	F	G	A	G	D	K	R
Template Known Secondary structure								T	T													T	S			B			G	G	G			S	S	S	T	T																		T	T							T	T	T		.	.	.									S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70				.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.		.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.
Query SS confidence																																																										.
Query Sequence		I	A	L	L	G	E	Y	D	A	L	A	G	L	S	Q	Q	A	G	C	A	Q	P	T	S	V	T	P	G	E	N	G	H	G	C	G	H	N	L	L	G	T	A	A	F	A	A	A	I	A	V	K	K	W	L	E	Q	.	Y	G	Q	G	G	T	V	R	F	Y	G	C	P	G	E	E	G	G	S	G	K	T	F
Query Conservation																																																										.
Alig confidence																																																										.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	I	I	G	H	M	D	V	V	P	A	G	E	G	W	T	R	D	P	F	K	M	E	I	D	E	E	G	R	I	Y	G	R	G	S	A	D	D	K	G	P	S	L	T	A	Y	Y	G	M	L	L	L	K	E	A	G	F	K	P	K	K	K	I	D	F	V	L	G	T	N	E	E	T	N	W	V	G	I	D
Template Known Secondary structure										B					S			S	S		T	T	S					T	T					S	T	T	S	S	S	S																		T				S	S								S		T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	V	R	E	G	V	F	D	D	V	D	A	A	L	T	W	H	P	E	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	Y	L	K	H	E	P	T	P	D	I	V	F	S	P	D	A	E	Y	P	I	I	N	G	E	Q	G	I	F	T	L	E	F	S	F	K	N	D	D	T	K	G	D	Y	V	L	D	K	F	K	A	G	I	A	T	N	V	T	P	Q	V	T	R	A	T	I	S	G	P	D	L	E	A	V	K	L	A	Y	E	S
Template Known Secondary structure							S				S					S	S			S	S																							S	B									S	B	T	T	B			S									S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
						176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	230
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	A	G	M	F	N	T	R	T	L	A	N	I	Q	A	S	W	R	F	K	G	I	A	A	H	A	A	N	S	P	H	L	G	R	S	A	L	D	A	V	T	L	M	T	T	G	T	N	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	N	E	H	I	I	E
Query Conservation		.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																												.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.
Template Sequence		F	L	A	D	K	E	L	D	G	S	F	E	I	N	D	E	S	A	D	I	V	L	I	G	Q	G	A	H	A	S	A	.	P	Q	V	G	K	N	S	A	T	F	L	A	L	F	L	D	Q	Y	A	F	A	G	R	D	K	N	F	L	H	F	L	A	E	V	E	H	E	D	F	Y	G	K	K	L	G	I	F	H
Template Known Secondary structure							T									T	T									B			B	T	T		.	G	G	G	S	B											T	T	S		B														T	T	T	T		T	T	S	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																	.
Template SS confidence
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.		.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	R	V	H	Y	A	I	T	N	S	G	G	I	S	P	N	V	V	Q	A	Q	A	E	V	L	Y	L	I	R	A	P	E	M	T	D	V	Q	H	I	Y	D	R	V	A	K	I	A	E	G	A	A	L	M	T	E	T	T	V	E	C	R	F	D	K	A	C	S	S	Y	L	P	N	R	T	L	E	N	A	M
Query Conservation
Alig confidence																																																				.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.
Template Sequence		H	D	D	L	M	G	D	L	A	S	S	P	S	M	F	D	Y	E	H	A	G	K	A	S	L	L	N	N	V	R	Y	P	Q	G	T	D	P	D	T	M	I	K	Q	V	L	D	K	F	S	G	.	.	.	.	.	I	L	D	V	T	Y	N	G	F	E	E	P	H	Y	V	P	G	S	D	P	M	V	Q	T	L
Template Known Secondary structure				T	T	T														T	T	S												T	T															T	T	.	.	.	.	.	T						S			B							T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370						.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	Q	A	L	S	H	F	G	T	P	E	W	N	S	E	E	L	A	F	A	K	Q	I	Q	A	T	L	T	S	N	D	R	Q	N	S	L	N	N	I	A	A	T	G	G	E	N	G	K	V	F	A	L	R	H	R	E	T	V	L	A	N	E	V	A	P	Y	A	A	T	D	N	V	L	A	A	S	T	D	V	G
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	V	Y	E	K	Q	T	G	K	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	E	V	V	I	G	G	G	T	Y	G	R
Template Known Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S			G	G	G
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	V	S	W	K	L	P	V	A	Q	C	F	S	P	C	F	A	V	G	T	P	L	H	T	W	Q	L	V	S	Q	G	R	T	S	I	A	H	K	G	M	L	L	A	A	K	T	M	A	A	T	T	V	N	L	F	L	D
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.													.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.													.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	F	E	R	G	V	A	F	G	A	Q	P	.	.	.	E	N	G	P	M	V	M	H	A	A	N	E	.	.	.	.	.	.	F	M	M	L	D	D	L	I	L	S	I	A	I	Y	A	E	A	I	Y	E	L	T	K	D
Template Known Secondary structure		G	S	T	T									.	.	.	T	T					T	T	S	T	T		.	.	.	.	.	.																							S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.													.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.				.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.							.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.