Job Description P77148 Confidence 99.11% Date Thu Jan 5 12:25:39 GMT 2012 Rank 110 Aligned Residues 167 % Identity 11% Template d1d5ta1 SCOP info FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain GDI-like N domain Resolution 1.04

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	A	I	V	G	A	G	P	T	G	I	Y	T	L	F	S	L	L	Q	Q	Q	T	P	L	S	I	S	I	F	E	Q	A	D	E	A	G	V	G	M	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.
Template Sequence		V	I	V	L	G	T	G	L	T	E	C	I	L	S	G	I	M	S	V	N	.	.	G	K	K	V	L	H	M	D	R	N	P	Y	Y	G	G	E	S	S	S	I	T	P	L	E	E	L	Y	K	R	F	Q	L	L	E	G	P	P	E	T	M	G	R	G	R	D	W	N	V	D	L	I	P	K	F	L	M	A	N
Template Known Secondary structure								S													T	.	.	T								S	S	S	S	S		T	T	S					S								T	T		T	T				G	G	G			G	G	G					S	S			B			T	T
Template Predicted Secondary structure																						.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.			.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
																																																																44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	D	E	E	N	S	K	M	M	L	A	N	I	A	S	I	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	Q	L	V	K	M	L	L	Y	T	E	V	T	R	Y	L	D	F	K	V	V	E	G	S	F	V	Y	K	G	G	K	I	Y	K	V	P	S	T	E	T	E	A	L	A	S	N	L	M	G	M	F	E	K	R	R	F	R	K	F	L	V	F	V	A	N	F	D	E	N	D	P	K	T	F	E	G	V	D	P	Q
Template Known Secondary structure		S										T	G	G	G	G														T	T								S								S	S	S																				T	T		G	G	G	G	T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		62	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	P	P	I	Y	C	T	Y	L	E	W	L	Q	K	Q	E	D	S	H	L	Q	R	Y	G	V	K	K	E	T	L	H	D	R	Q	F	L	P	R	I	L	L	G	E	Y	F	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	F	L	R	L	V	D	Q	A	R	Q
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	T	S	M	R	D	V	Y	R	K	F	D	L	G	Q	D	V	I	D	F	T	G	H	A	L	A	L	Y	R	T	D	D	Y	L	D	Q	P	C	L	E	T	I	N	R	I	K	L	Y	S	E	S	L	A	R	Y	G	K	S	P	Y	L	Y	P	L	Y	G	L	G	E	L	P	Q	G	F	A	R	L	S	A	I
Template Known Secondary structure		T	S	B								T	T													T	S			S	S	S	G	G	G	G	S	B	S													S			S	S	S			S					T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	K	F	A	V	A	V	Y	E	S	C	Q	V	T	D	L	Q	I	T	N	A	G	V	M	L	A	T	N	Q	D	L	P	S	E	T	F	D	L	A	V	I	A	T	G	H	V	W	P	D	E	E	E	A	T	R	T
Query Conservation
Alig confidence						.	.																							.
Template Conservation						.	.																							.
Template Sequence		Y	G	G	T	.	.	Y	M	L	N	K	P	V	D	D	I	I	M	E	N	G	K	V	V	G	V	K	S	.	E	G	E	V	A	R	C	K	Q	L	I	C	D	P	S	Y	V	P	D	R	V	P	I	D	D	G	S
Template Known Secondary structure			T			.	.		B		S										T	T								.	T	T						S						G	G	G		G	G	G						S	T
Template Predicted Secondary structure						.	.																							.
Template SS confidence
		245	.	.	.			.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270		.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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