Job Description P77148 Confidence 99.97% Date Thu Jan 5 12:25:39 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 377 % Identity 15% Template c3s5wB_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:l-ornithine 5-monooxygenase; PDBTitle: ornithine hydroxylase (pvda) from pseudomonas aeruginosa Resolution 1.90 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.				.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.					.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.																																								.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.																																								.	.	.	.
Query Sequence		I	A	I	V	G	A	G	P	T	G	I	Y	T	L	F	S	L	L	Q	Q	.	.	.	Q	T	P	L	S	I	S	I	F	E	Q	A	D	E	A	G	V	G	M	P	Y	S	D	E	E	N	S	K	M	M	L	A	N	I	A	S	I	E	I	.	.	.	.	P	P	I	Y	C	T	Y	L	E	W	L	Q	K	Q
Query Conservation																						.	.	.																																								.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.																	.	.																						.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.
Template Sequence		L	I	G	V	G	F	G	P	S	N	I	A	L	A	I	A	L	Q	E	R	A	Q	A	Q	G	A	L	E	V	L	F	L	D	K	Q	G	D	Y	R	.	.	W	H	G	N	T	L	V	S	Q	S	E	L	Q	I	S	F	L	K	D	L	V	S	L	R	N	P	T	S	P	Y	S	F	V	N	Y	L	H	K	H
Template Known Secondary structure								S																											S		S	S			.	.	S	S	G	G	G			S	S		B		S	S		G	G	G	S	S	S	T	T	T		T	T	S	T	T	S								T
Template Predicted Secondary structure																																									.	.
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.			.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140							.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	D	S	H	L	Q	R	Y	G	V	K	K	E	T	L	H	D	R	Q	F	L	P	R	I	L	L	G	E	Y	F	R	D	Q	F	L	R	L	V	D	Q	A	R	Q	Q	K	F	A	V	A	V	Y	E	S	C	Q	V	T	D	L	Q	I	T	N	A	.	.	.	.	.	.	G	V	M	L	A	T	N	Q	D	L
Query Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	R	L	V	D	F	I	N	.	.	.	.	.	.	.	L	G	T	F	Y	P	C	R	M	E	F	N	D	Y	L	R	W	V	A	S	H	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	E	Q	S	R	Y	G	E	E	V	L	R	I	E	P	M	L	S	A	G	Q	V	E	A	L	R	V	I	S	R	N	A	D	G
Template Known Secondary structure		T								.	.	.	.	.	.	.		T		S			B													G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T				S												T	T												T	T	S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		91	.	.	.	.	.	.	.								.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120										.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.									.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	S	E	T	F	D	L	A	V	I	A	T	G	H	V	W	P	D	E	E	E	A	T	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	F	P	S	P	W	S	G	L	M	E	A	K	V	D	A	C	N	V	G	I	M	G	T	S	L	S	G	L	D	A	A	M	A	V	A	I	Q	H	G	S	F	I	E	D	D	K
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	E	L	V	R	T	T	R	A	L	V	V	S	P	G	G	T	P	R	I	P	Q	V	F	R	A	L	K	G	D	G	R	V	F	H	H	S	Q	Y	.	.	.	L	E	H	M	A	K	P	M	K	I	A	I	I	G	G	G	Q	S	A	A	E	A	F	I	D	L	N	D	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									S														G	G	G	G	G	G	T	T		T	T				G	G	G		.	.	.					T											S															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.				.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	H	V	V	F	H	R	D	N	A	S	E	K	L	N	I	T	L	L	S	R	T	G	I	L	P	E	A	D	F	Y	C	P	I	P	Y	E	P	L	H	I	V	T	D	Q	A	L	N	A	E	I	Q	K	G	E	E	G	L	L	D	R	V	F	R	L	I	V	E	E	I	K	F	A	D	P	D	W	S	Q	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	S	V	Q	A	D	M	I	L	R	A	S	A	L	K	P	A	D	D	S	P	F	V	N	E	V	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T								S	S	S	S			B					T	T	G	G	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	A	L	E	S	L	N	V	D	S	F	A	Q	A	W	F	A	E	R	K	Q	R	D	P	F	D	W	A	E	K	N	L	Q	E	V	E	R	N	K	R	E	K	H	T	V	P	W	R	Y	V	I	L	R	L	H	E	A	V	Q	E	I	V	P	H	L	N	E	H	D	H	K	R	F	S	K	G	L	A	R	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	F	T	D	L	I	Y	S	R	E	H	A	E	R	E	R	L	L	R	E	Y	H	N	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	S												T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																									259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
		383	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.				400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.							.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.																														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.																														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	I	D	N	Y	A	A	I	P	S	E	S	I	R	R	L	L	.	.	.	A	L	R	E	A	G	I	I	H	I	L	A	L	G	E	D	Y	K	M	E	I	N	E	S	R	T	V	L	K	.	.	.	.	.	.	T	E	D	N	S	Y	S	F	D	V	F	I	D	A	R	G	Q	R	P	L	K	V	K	D	I
Query Conservation																			.	.	.																														.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.																														.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	Y	S	V	V	D	T	D	L	I	E	R	I	Y	G	V	F	Y	R	Q	K	V	S	G	I	P	R	H	A	F	R	C	M	T	T	V	E	R	A	T	A	T	A	Q	G	I	E	L	A	L	R	D	A	G	S	G	E	L	S	V	E	T	Y	D	A	V	I	L	A	T	G	Y	E	R	Q	L	H	R	Q	L
Template Known Secondary structure		T	S	S		B																			T				S				T	T										S	S	S								T	T	T									S												S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	F	P	G	L	R	E	Q	L	Q	K	T	G	D	E	I	P	D	V	G	E	D	Y	T	L	Q	Q	P	E	D	I	R	G	R	V	A	F	G	A	L	P	W	L	M	H	D	Q	P	F	V	Q	G	L	T	A	C	A	E	I	G	E	A	M	A	R	A	V	V	K	P
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.																																	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.																																	.
Template Sequence		L	.	.	.	.	.	.	E	P	L	A	E	Y	L	G	D	H	E	I	G	R	D	Y	R	L	Q	T	D	E	R	C	K	V	A	I	Y	A	Q	G	.	F	S	Q	A	S	H	G	L	S	D	T	L	L	S	V	L	P	V	R	A	E	E	I	S	G	S	L	Y	Q	H
Template Known Secondary structure		S	.	.	.	.	.	.	G	G	G	G	G	G	B		S	S				T	T	S	B			B		T	T	B		S					S	S	.								T	T	T	T	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.																																	.
Template SS confidence
		364							.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.		.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.