Job Description P77148 Confidence 99.66% Date Thu Jan 5 12:25:39 GMT 2012 Rank 13 Aligned Residues 299 % Identity 16% Template c3icrA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:coenzyme a-disulfide reductase; PDBTitle: crystal structure of oxidized bacillus anthracis coadr-rhd Resolution 2.10 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	K	I	A	I	V	G	A	G	P	T	G	I	Y	T	L	F	S	L	L	Q	Q	Q	T	P	L	S	I	S	I	F	E	Q	A	D	E	A	G	V	G	M	P	Y	S	D	E	E	N	S	K	M	M	L	A	N	I	A	S	I	E	I	P	P	I	Y	C	T	Y	L	E	W	L	Q	K	Q	E	D	S	H	L
Query Conservation
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	K	I	V	V	V	G	G	V	A	G	G	A	S	V	A	A	R	L	R	R	L	S	E	E	D	E	I	I	X	V	E	R	G	E	Y	I	S	F	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	G	L	P
Template Known Secondary structure										S															S	S	S							S	S	S		S	S	B		G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.																																				.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.			.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.
Query SS confidence																																																																								.	.
Query Sequence		Q	R	Y	G	V	K	K	E	T	L	H	D	R	Q	F	L	P	R	I	L	L	G	E	Y	F	R	D	Q	F	L	R	L	V	D	Q	A	R	Q	Q	K	F	A	V	A	V	Y	E	S	C	Q	V	T	D	L	Q	I	T	N	A	G	V	M	L	A	T	N	Q	D	L	P	.	.	S	E	T	F	D	L	A	V
Query Conservation																																																																								.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	Y	I	G	G	V	I	T	E	R	Q	K	L	L	V	Q	T	V	E	R	X	S	K	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	D	I	R	V	L	S	E	V	V	K	I	N	K	E	E	K	T	I	T	I	K	N	V	T	T	N	E	T	Y	N	E	A	Y	D	V	L	I
Template Known Secondary structure					T	T	S	S			G	G	G	G	B	S	S									T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T						S								T	T	T	T							T	T	T									S
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
		160	.	.	.					.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.							190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	A	T	G	.	.	.	.	H	V	W	P	D	E	E	E	A	T	R	T	Y	F	P	S	P	W	S	G	L	M	E	A	K	V	.	.	.	.	.	.	D	A	C	N	V	G	I	M	G	T	S	L	S	G	L	D	A	A	M	A	V	A	I	Q	H	G	S	F	I	E	D	D	K	Q	H	V	V	F	H	R
Query Conservation						.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	S	P	G	A	K	P	I	V	P	S	I	P	G	I	E	E	A	K	A	L	F	T	L	R	N	V	P	D	T	D	R	I	K	A	Y	I	D	E	K	K	P	R	H	A	T	V	I	G	G	G	F	I	G	V	E	X	V	E	N	L	R	E	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														T	T	T	T	T		T	T					S	S																	S								S													T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	N	A	S	E	K	L	N	I	T	L	L	S	R	T	G	I	L	P	E	A	D	F	Y	C	P	I	P	Y	E	P	L	H	I	V	T	D	Q	A	L	N	A	E	I	Q	K	G	E	E	G	L	L	D	R	V	F	R	L	I	V	E	E	I	K	F	A	D	P	D	W	S	Q	R	I	A	L	E	S	L	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	I	E	V	T	L	V	E	X	A	N	Q	V	X	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.								S	S	S	S	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	D	S	F	A	Q	A	W	F	A	E	R	K	Q	R	D	P	F	D	W	A	E	K	N	L	Q	E	V	E	R	N	K	R	E	K	H	T	V	P	W	R	Y	V	I	L	R	L	H	E	A	V	Q	E	I	V	P	H	L	N	E	H	D	H	K	R	F	S	K	G	L	A	R	V	F	I	D	N	Y	A	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																																	191
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	P	S	E	S	I	R	R	L	L	A	L	R	E	A	G	I	I	H	I	L	A	L	G	E	D	Y	K	M	E	I	N	E	S	R	T	V	L	K	T	E	D	N	S	Y	S	F	D	V	F	I	D	A	R	G	Q	R	P	L	K	V	K	D	I	P	F	P	G	L	R	E	Q	L	Q	K	T	G	D	E	I
Query Conservation
Alig confidence																							.																																								.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.																																								.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	D	Y	E	X	A	A	Y	V	H	E	H	X	K	N	H	D	V	E	L	V	.	F	E	D	G	V	D	A	L	E	E	N	G	A	V	V	R	L	K	S	G	S	V	I	Q	T	D	X	L	I	L	A	I	G	V	Q	P	E	S	S	.	.	.	.	.	.	.	L	A	K	G	A	G	L	A	L	G	V	R
Template Known Secondary structure		S														T	T	T					.		S								G	G	G	T					T	T	S						S						S								.	.	.	.	.	.	.					T	T			B		G	G
Template Predicted Secondary structure																							.																																								.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.		.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.								.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.				.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510		.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.																				.
Query SS confidence																								.	.	.																				.
Query Sequence		P	D	V	G	E	D	Y	T	L	Q	Q	P	E	D	I	R	G	R	V	A	F	G	.	.	.	A	L	P	W	L	M	H	D	Q	P	F	V	Q	G	L	T	A	C	A	.	E	I	G	E	A	M	A	R	A	V	V
Query Conservation																								.	.	.																				.
Alig confidence													.	.										.	.	.																				.
Template Conservation													.	.
Template Sequence		G	T	I	K	V	N	E	K	F	Q	T	.	.	S	D	P	H	I	Y	A	I	G	D	A	I	E	V	K	D	F	V	T	E	T	E	T	X	I	P	L	A	W	P	A	N	R	Q	G	R	X	L	A	D	I	I	H
Template Known Secondary structure		G		B				T	T	S	B		.	.	S	S	T	T					G	G	G	B				B	T	T	T																								T
Template Predicted Secondary structure													.	.
Template SS confidence
		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.			.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.