Job Description P77148 Confidence 99.35% Date Thu Jan 5 12:25:39 GMT 2012 Rank 48 Aligned Residues 345 % Identity 17% Template c1tytA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:trypanothione reductase, oxidized form; PDBTitle: crystal and molecular structure of crithidia fasciculata2 trypanothione reductase at 2.6 angstroms resolution Resolution 2.60 Å

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		1	.	.				.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.
Query SS confidence					.	.	.
Query Sequence		M	K	K	.	.	.	I	A	I	V	G	A	G	P	T	G	I	Y	T	L	F	S	L	L	Q	Q	Q	T	P	L	S	I	S	I	F	E	Q	A	D	E	A	G	V	G	M	P	Y	S	D	E	E	N	S	K	M	M	L	A	N	I	A	S	I	E	I	P	P	I	Y	C	T	Y	L	E	W	L	Q	K	Q	E
Query Conservation					.	.	.
Alig confidence					.	.	.																								.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	S	R	A	Y	D	L	V	V	I	G	A	G	S	G	G	L	E	A	G	W	N	A	A	S	L	H	K	K	.	R	V	A	V	I	D	L	Q	K	H	H	G	P	P	H	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	G	G	T	C	V	N	V	G	C	V	P	K	K	L	M	V	T	G	A	N	Y	M
Template Known Secondary structure				S	S									S																	.							S		S	S	S	B	T	T	T	B		.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T							S
Template Predicted Secondary structure																															.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.		30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.										.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.						.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.
Query Sequence		D	S	H	L	Q	R	Y	G	V	K	K	E	T	L	H	D	R	Q	F	L	P	R	I	L	L	G	E	Y	F	R	D	Q	F	L	R	L	V	D	Q	A	R	Q	Q	K	F	A	V	A	V	Y	E	S	C	Q	V	T	D	L	Q	I	T	N	A	G	V	M	L	A	T	.	.	.	.	.	N	Q	D	L	P	S
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																							.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	T	I	R	E	S	A	G	F	G	W	E	L	D	R	E	S	V	R	P	N	W	K	A	L	I	A	A	K	N	K	A	V	S	G	I	N	D	S	Y	E	G	M	F	A	D	T	E	G	L	T	F	H	Q	G	F	G	A	L	Q	D	N	H	T	V	L	V	R	E	S	A	D	P	N	S	A	V	L	E	T
Template Known Secondary structure								G	G	G	T					G	G	G																													T	S	T	T						S							T	T						S	S	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	T	F	D	L	A	V	I	A	T	G	H	V	W	P	D	E	E	E	A	T	R	T	Y	F	P	S	P	W	S	G	L	M	E	A	K	V	D	A	C	N	V	G	I	M	G	T	S	L	S	G	L	D	A	A	M	A	V	A	I	Q	H	G	S	F	I	E	D	D	K	Q	H	V	V	F	H	R	D	N	A
Query Conservation
Alig confidence													.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	T	E	Y	I	L	L	A	T	G	.	S	W	P	Q	H	L	G	I	E	G	D	D	L	C	I	T	S	N	E	A	F	Y	L	D	E	A	P	K	R	A	L	C	V	G	G	G	Y	I	S	I	E	F	A	G	I	F	N	A	Y	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													.								S	B	T	G	G	G		B						T	T		S	S			S							S	S														S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.		.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	E	K	L	N	I	T	L	L	S	R	T	G	I	L	P	E	A	D	F	Y	C	P	I	P	Y	E	P	L	H	I	V	T	D	Q	A	L	N	A	E	I	Q	K	G	E	E	G	L	L	D	R	V	F	R	L	I	V	E	E	I	K	F	A	D	P	D	W	S	Q	R	I	A	L	E	S	L	N	V	D	S
Query Conservation
Alig confidence		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	A	R	G	G	Q	V	D	L	A	Y	R	G	D	M	I	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.		T	T								S	S	S	S	S	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	A	Q	A	W	F	A	E	R	K	Q	R	D	P	F	D	W	A	E	K	N	L	Q	E	V	E	R	N	K	R	E	K	H	T	V	P	W	R	Y	V	I	L	R	L	H	E	A	V	Q	E	I	V	P	H	L	N	E	H	D	H	K	R	F	S	K	G	L	A	R	V	F	I	D	N	Y	A	A	I	P	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	D	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																														229	230	.	.
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.			.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
Predicted Secondary structure																																			.	.
Query SS confidence																																			.	.
Query Sequence		E	S	I	R	R	L	L	A	L	R	E	A	G	I	I	H	I	L	A	L	G	E	D	Y	K	M	E	I	N	E	S	R	T	.	.	V	L	K	T	E	D	N	S	Y	S	F	D	V	F	I	D	A	R	G	Q	R	P	L	K	V	K	D	I	P	F	P	G	L	R	E	Q	L	Q	K	T	G	D	E	I	P
Query Conservation																																			.	.
Alig confidence																																			.	.																							.	.						.	.	.
Template Conservation																																																											.	.						.	.	.
Template Sequence		E	L	R	K	Q	L	T	E	Q	L	R	A	N	G	I	N	V	R	T	H	E	N	P	A	K	V	T	K	N	A	D	G	T	R	H	V	V	F	E	S	G	A	E	A	D	Y	D	V	V	M	L	A	I	G	R	V	P	.	.	R	S	Q	T	L	.	.	.	Q	L	D	K	A	G	V	E	V	A	K	N	G
Template Known Secondary structure														T	T						S										T	T	S							T	T	S						S						S					.	.			T	T	S	.	.	.						T			B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.						.	.	.
Template SS confidence
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.			290	.	.	.	.				.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	V	G	E	D	Y	T	L	Q	Q	P	E	D	I	R	G	R	V	A	F	G	A	L	P	W	L	M	H	D	Q	P	F	V	Q	G	L	T	A	C	A	E	I	G	E	A	M	A	R	A	V	V	K	P	A	S	R
Query Conservation
Alig confidence											.	.										.	.	.	.											.	.
Template Conservation											.	.										.	.	.	.											.	.
Template Sequence		A	I	K	V	D	A	Y	S	K	.	.	T	N	V	D	N	I	Y	A	I	.	.	.	.	G	D	V	T	D	R	V	M	L	T	.	.	P	V	A	I	N	E	G	A	A	F	V	D	T	V	F	A	N	K	P	R
Template Known Secondary structure			B				T	T	S	B	.	.		S	S	T	T					.	.	.	.	G	G	G	G		S					.	.																	S
Template Predicted Secondary structure											.	.										.	.	.	.											.	.
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.			.	.	.	320	.	.	.	.	.					.	.	.	.	330	.	.	.	.	.			.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.