Job Description P77148 Confidence 99.74% Date Thu Jan 5 12:25:39 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 312 % Identity 17% Template c1cjcA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:protein (adrenodoxin reductase); PDBTitle: structure of adrenodoxin reductase of mitochondrial p4502 systems Resolution 1.70 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	K	I	A	I	V	G	A	G	P	T	G	I	Y	T	L	F	S	L	L	Q	Q	Q	T	P	L	S	I	S	I	F	E	Q	A	D	E	A	G	V	G	M	P	Y	S	D	E	E	N	S	K	M	M	L	A	N	I	A	S	I	E	I	P	P	I	Y	C	T	Y	L	E	W	L	Q	K	Q	E	D	S	H	L
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	Q	I	C	V	V	G	S	G	P	A	G	F	Y	T	A	Q	H	L	L	K	H	H	S	R	A	H	V	D	I	Y	E	K	Q	L	V	P	F	G	L	V	R	F	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										S															S	S								S	S	S	S	S		T					T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	R	Y	G	V	K	K	E	T	L	H	D	R	Q	F	L	P	R	I	L	L	G	E	Y	F	R	D	Q	F	L	R	L	V	D	Q	A	R	Q	Q	K	F	A	V	A	V	Y	E	S	C	Q	V	T	D	L	Q	I	T	N	A	G	V	M	L	A	T	N	Q	D	L	P	S	E	T	F	D	L	A	V	I	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	D	H	P	E	V	K	N	V	I	N	T	F	T	Q	T	A	R	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	C	A	F	Y	G	N	V	E	V	G	R	D	V	T	V	Q	E	L	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Y	H	A	V	V	L	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T		G	G	G	G	G										T	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T					B	S			B	T	T	T	B								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.										.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.											.	.	.	.	.	.	100	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.															.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	G	H	V	W	P	D	E	E	E	A	T	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	F	P	S	P	W	S	G	L	M	E	A	K	V	D	A	C	N	V	G	I	M	G	T	S	L	S	G	L	D	A	A	M	A	V	A	I	Q	H	G	S	F	I	E	D	D	K	Q	H	V	V	F
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	G	A	E	D	H	Q	A	L	D	I	P	G	E	E	L	P	G	V	F	S	A	R	A	F	V	G	W	Y	N	G	L	P	E	N	R	E	L	A	P	D	L	S	C	D	T	A	V	I	L	G	Q	G	N	V	A	L	D	V	A	R	I	L	L	T	P	P	D	H	L	E	K	T	D	I	T	E	A	A	L
Template Known Secondary structure													T	T	T	T	S	T	T												T	T		G	G	G	T	T					T	T	S	S						S		S												S		G	G	G	G	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	R	D	N	A	S	E	K	L	N	I	T	L	L	S	R	T	G	I	L	P	E	A	D	F	Y	C	P	I	P	Y	E	P	L	H	I	V	T	D	Q	A	L	N	A	E	I	Q	K	G	E	E	G	L	L	D	R	V	F	R	L	I	V	E	E	I	K	F	A	D	P	D	W	S	Q	R	I	A	L	E	S
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	A	L	R	Q	S	R	V	K	T	V	W	I	V	G	R	R	G	P	L	Q	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	T	I	K	E	L	R	E	M	I	Q	L	P	G	T	R	P	M	L	D	P
Template Known Secondary structure						T											S	S		G	G	G			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T		T	T							G
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	N	V	D	S	F	A	Q	A	W	F	A	E	R	K	Q	R	D	P	F	D	W	A	E	K	N	L	Q	E	V	E	R	N	K	R	E	K	H	T	V	P	W	R	Y	V	I	L	R	L	H	E	A	V	Q	E	I	V	P	H	L	N	E	H	D	H	K	R	F	S	K	G	L	A	R	V	F	I	D	N	Y
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	D	F	L	G	L	Q	D	R	I	K	E	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	R	K	R	L	M	E	L	L	L	R	T	A	T	E	K	P	G	V	E	E	A	A	R	R	A	S	A	S	R	A	W	G	L	R	F
Template Known Secondary structure		G	G	G	T	T					T	T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																S												T		S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
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Predicted Secondary structure																																															.
Query SS confidence																																															.
Query Sequence		A	A	I	P	S	E	S	I	R	R	L	L	A	L	R	E	A	G	I	I	H	I	L	A	L	G	E	D	Y	K	M	E	I	N	E	S	R	T	V	L	K	T	E	D	N	.	S	Y	S	F	D	V	F	I	D	A	R	G	Q	R	P
Query Conservation																																															.
Alig confidence								.	.	.	.																																				.
Template Conservation								.	.	.	.
Template Sequence		F	R	S	P	Q	Q	.	.	.	.	V	L	P	S	P	D	G	R	R	A	A	G	I	R	L	A	V	T	R	L	E	G	I	G	E	A	T	R	A	V	P	T	G	D	V	E	D	L	P	C	G	L	V	L	S	S	I	G	Y	K	S
Template Known Secondary structure		S						.	.	.	.					T	T	S	S	S													S	S	G	G	G															S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.
Template SS confidence
		277	.	.	280	.	.					.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.